1954年10月，新疆军区生产建设兵团成立，农六师编属兵团领导。

1975年5月，农六师建制撤销。

1982年4月1日，农六师建制恢复。

2012年12月，新疆生产建设兵团农业建设第六师更名为新疆生产建设兵团第六师。

截至2014年，新疆生产建设兵团第六师下辖14个团农牧场：101团、102团、103团、105团、106团、芳草湖农场、新湖农场、军户农场、共青团农场、六运湖农场、土墩子农场、红旗农场、奇台农场、北塔山牧场。第六师师部驻五家渠市。

新疆生产建设兵团第六师，地处天山北麓东段，准噶尔盆地东南部，北纬43°31′16″～45°33′20″、东经86°07′30″～91°11′48″范围内。成片状散布在昌吉回族自治州、阿勒泰地区和五家渠市3地州（市）境内。东起中蒙边境的北塔山，西临玛纳斯河，南倚天山，北入古尔班通古特沙漠，东西长500千米，南北宽40～200千米。总面积7813.67平方千米。

新疆生产建设兵团第六师根据地形、方位、土壤、开发方向等差异，大体分四种类型。西部冲积洪积平原由呼图壁河、玛纳斯河、塔西河进入盆地后所形成的冲积洪积平原，占土地总面积的25.33%，海拔360～532米，坡降0.1%～0.3%，是棉花、粮食、甜菜、啤酒花的主产地，土地区划命名为芳新垦区。中部冲积洪积平原由三屯河、头屯河、乌鲁木齐河、三工河、四工河、甘河子河进入盆地后形成的冲积洪积平原，占总面积的19.9%，海拔420～610米，地势由东南向西北倾斜，坡降0.07%～0.75%，是粮食、西瓜、哈密瓜、油料和水产、禽蛋、肉类的主产地，与乌鲁木齐市、昌吉市相邻，具备发展城郊型农业的条件，土地区划命名为五家渠垦区。东部的奇台农场为山前冲积洪积扇戈壁平原，地势南高北低，由东南向北倾斜，坡降0.1%～0.3%，局部地区坡降较大，土层0.3～1.5米，中下部是主要农田，适种小麦、甜菜、大麦、油菜等；吉木萨尔北部的红旗农场为冲积沼泽平原，海拔560～1220米，土壤含盐量较大，部分地区有泉水溢出，是小麦、红花的主产地。占总面积的26.9%，土地区划命名为奇台垦区。北塔山山地占总面积的27.1%。北塔山北段和东北的山地，海拔1031～3290米。砾漠、石漠面积大，土壤主要是灰棕荒漠土、棕钙土、栗钙土、黑钙土、草甸土。山体小，无终年积雪，四周被戈壁围绕，辐射强，干旱缺水，草场多为干荒漠，级低等劣，以畜牧业为主，土地区划命名为北塔山牧区。

新疆生产建设兵团第六师属中温带大陆性气候，深居亚欧大陆腹地，干旱、低温，光照时数多，昼夜温差大，气温变化剧烈。春秋季节不明显，冬寒夏热，具有显著的大陆性特征。垦区大致可分为3个气候区。即南部山区、北部沙漠和中部平原。山区特点是温凉多雨，差异分明；平原区地域辽阔，夏季炎热，冬季寒冷，降水量少，蒸发强烈，光照充足，热量丰富，春秋季气温变化剧烈，温差大，无霜期较长，冬季有稳定的积雪；沙漠区气候干旱，降水量少，冬季严寒，夏季酷热，昼夜温差大，多风沙，差异明显；中部平原区年均气温6℃～7℃，最高气温40℃～42℃，最低气温-38℃～-43℃，年均降水量200毫米，年蒸发量2?000毫米，无霜期155天，日照2600～3200小时/年。

新疆生产建设兵团第六师野生植物有1000余种，其中可作为中草药的植物，有贝母、雪莲、当归等29种。列为自治区保护的有西伯利亚落叶松、新疆阿魏、沙生柽柳（红柳）、梭梭、胡杨、黄芪等6种。

新疆生产建设兵团第六师野生动物有野马、蒙古野驴、雪豹、马鹿、盘羊、岩羊、鹅喉羚、北山羊、波斑豹、熊、短尾黄羊等360多种，其中国家保护动物49种。1980年代末，新疆大学生物专家把在北塔山发现的雪鸡定名为“阿尔泰雪鸡”，为世界第三个雪鸡品种。

截至2014年，新疆生产建设兵团第六师总人口34万人，比2013年增长1%，其中，男性17.62万人，女性16.38万人。性别比为108（女=100）。全年出生人口2040人，出生率为0.603%；死亡人口1633人，死亡率为0.483%；人口自然增长率为0.12%。以汉族为主，少数民族有壮族、蒙古族、维吾尔族等。

新疆生产建设兵团第六师境内，乌伊公路（312国道）、乌奇公路（216国道）和吐乌大、乌奎高速公路横贯东西，北疆铁路穿越垦区南端。

2014年，新疆生产建设兵团第六师公路通达里程4641.6公里。其中，二级542.2公里、三级400.3公里、四级1253.6公里。

2014年，新疆生产建设兵团第六师民用汽车保有量2.36万辆，较2013年增长14.9%。民用轿车0.69万辆，较2013年增长39.2%。民用汽车中，载客汽车10.77万辆，较2013年增长45.4%；载货汽车0.82万辆，较2013年增长1.2%；其他汽车0.46万辆，较2013年减少7.1%。全年道路运输旅客周转量12.06亿人公里、货物周转量71.71亿吨公里，分别比2013年增长10.1%和40%。

2014年，新疆生产建设兵团第六师实现生产总值（GDP）204.85亿元，较2013年增长12.3%。其中，第一产业增加值40.78亿元，较2013年增长7.5%；第二产业增加值100.79亿元，较2013年增长13.0%；第三产业增加值63.28亿元，较2013年增长14.6%。三次产业占生产总值比重为20:49:31。三次产业对经济的贡献率分别为12.5%、53.2%和34.3%，分别拉动经济增长1.5、6.6和4.2个百分点。人均生产总值62952元，较2013年增长11%。

2014年，新疆生产建设兵团第六师固定资产投资268.63亿元，较2013年下降10.5%。其中，第一产业21.09亿元，较2013年增长31.8%；第二产业110.58亿元，较2013年下降36.8 %；第三产业136.96亿元，较2013年增长25.4%。固定资产投资三次产业构成为7.9:41.2:50.9。

2014年，新疆生产建设兵团第六师实现农业增加值40.78亿元，较2013年增长7.5%。实现农业产值96.92亿元，较2013年增长9.3%。全年农作物播种面积166.6千公顷（250万亩），较2013年增长15.7%。其中，粮食种植面积44.4千公顷（66.6万亩），较2013年下降8.2%；棉花种植面积80.5千公顷（120.7万亩），较2013年增长17.2%；油料种植面积11千公顷（16.5万亩），较2013年增长138.9%；蔬菜种植面积（含菜用瓜）12千公顷（18万亩），较2013年增长7.8%。作物精量播种面积133千公顷（200万亩），较2013年增长64%。其中，棉花精量播种面积66.7千公顷（105万亩），较2013年增长10.5 %。测土配方施肥面积73.7千公顷（110万亩），较2013年增长10%。有效灌溉面积146.43千公顷（219.65万亩），其中高新节水灌溉面积141.17千公顷（211.76万亩）。全年粮食产量37.68万吨，较2013年下降8%；棉花产量15.58万吨，较2013年下降1.9%；油料产量4万吨，较2013年增长109.2%。种植业耕、种、收综合机械化率95.8%。畜禽良种推广覆盖率达到89%，优质高产饲草种植收获加工示范田达到3万亩，养殖粪污资源化利用率达到87%。

2014年，新疆生产建设兵团第六师各级农业产业化龙头企业34个。其中，国家级1个，兵团级13家，销售收入过10亿元的有3家。龙头企业带动种植面积150万亩、牲畜饲养量9.7万头、禽类饲养量63万只，带动团场和农村农户近10万户。已建成1个全国现代农业示范区，1个全国现代农业示范区，1个全国农产品加工示范基地，2个 全国“一村一品”示范团场，2个国家级无公害农产品示范基地和国家级农业标准化示范农场，示范面积10余万亩。完成“三品”（即有机农产品、无公害农产品、绿色食品）认证13个，认证面积达到10万亩，完成农产品地理标志认证1个。

2014年，新疆生产建设兵团第六师完成工业总产值362亿元，较2013年增长13%。工业增加值84亿元，较2013年增长6.7%。工业产销率95.5%。轻、重工业比重分别为24:76。轻工业较2013年增长20.1%，重工业较2013年增长13%。工业产销率95.4%。

2014年，新疆生产建设兵团第六师规模以上工业增加值72.18亿元，较2013年增长5.8 %，占师工业增加值85.9%。

2014年，新疆生产建设兵团第六师规模以上工业中，煤炭开采和洗选业增加值比2013年下降48.7%，农副食品加工业较2013年增长70.9%，食品制造业较2013年增长12.5%，纺织业较2013年下降23.4%，有色金属冶炼及压延加工业较2013年下降21.0%，电力、热力的生产和供应业较2013年增长1%。

2014年，新疆生产建设兵团第六师规模以上工业企业实现利润8.6亿元，较2013年下降16.5%。共有各类园区5个，其中国家级经济开发区1个，兵团级园区2个。

2014年，新疆生产建设兵团第六师实现全社会建筑业产值72.98亿元，较2013年增长89.5%。建筑业增加值16.79亿元，较2013年增长68.2%。具有资质等级的总承包和专业承包建筑企业17家。各类建筑施工单位签定合同额82.53亿元，较2013年增长71.7%。全年房屋建筑施工面积340万平方米，较2013年增长89.9%。

2014年，新疆生产建设兵团第六师批发零售业商品销售总额144.77亿元，较2013年增长18.5 %。全年社会消费品零售总额67.98亿元，较2013年增21.6%。

2014年，新疆生产建设兵团第六师货物进出口总额2.58亿美元（区域海关），较2013年下降19.8%。其中，货物出口2.45亿美元，较2013年下降21.7%；货物进口0.13亿美元，较2013年增长48.8%。招商引资项目共192个。当年到位资金241.5亿元，较2013年增长0.5%。当年新建引资项目92个，投资总额82.3亿元。

2014年，新疆生产建设兵团第六师拥有旅游企业18家。其中，国家等级景区（点）8个（4A级2个），全国工农业旅游示范点2家，星级农家乐3个，旅游星级饭店10家，旅行社4家，旅游规划资质单位1家，旅游集团公司2家，导游员5人。全年旅游直接就业人员0.21万人，间接就业人员1万人。

截至2014年，新疆生产建设兵团第六师有各类学校64所，在校学生45861人，较2013年增长3.6%，教职工4284人，较2013年增长1.9%，其中专职教师3558人，较2013年增长2.9%。毕业生12064人，较2013年下降9%。普通中小学在校生34062人，招生8456人，毕业生8304人，教师2942人。小学适龄儿童入学率100%，初中适龄人口入学率100%。幼儿园23所，在校生6203人，教职工324人。

2014年，新疆生产建设兵团第六师承担各级各类科技项目156项，获得各类科技经费总额2614万元，较2013年增长25.67%，项目年经费投入强度每项近17万元。其中，承担实施各类国家科技计划项目11项，到位资金860万元;兵团各类科技计划项目56项，到位资金954万元；师本级科技计划项目89项，下达科技经费800万元。工程技术研究中心1家、高新技术企业4家、兵团创新型试点企业3家。全年有2项科技成果获兵团科技进步奖，其中二等奖1项、三等奖1项；获得师科技进步奖34项，其中一等奖3项、二等奖11项、三等奖20项。全年全师专利申请量45件，获得授权专利量38件，其中发明专利授权量6件。

2014年，新疆生产建设兵团第六师有广播电视播出机构22座，其中师电视台和广播电台各1座，农牧团场广播电视站19座，分场及工矿企业广播电视站1座。广播电视综合覆盖率分别达到90%和85%。实施数字电影放映工程，全年放映3271场次。年末有群艺馆1座，军垦博物馆1座。师建有文化中心（文化宫）1个，14个团场建有文化活动中心。师团有文化广场13个。建有文化信息资源共享工程师级分中心1个、团级分中心7个、连队服务点6个，有不可移动历史文物点26处，兵师级爱国主义教育基地3个。拥有网站1家。年末有公开发行报纸1家，《准噶尔时报》全年发行1.3万份。

2014年，新疆生产建设兵团第六师有各类卫生机构334个（含营利性卫生机构），各类卫生技术人员2381人。其中，执业和执业（助理）医师741人，注册护士1092人。每千人执业（助理）医师2.18人，每千人注册护士3.21人，每千人有医院床位4.87张。传染病报告发病率（甲乙类传染病）378/10万，婴儿死亡率0.341%。

2014年，新疆生产建设兵团第六师最低生活保障累计发放6.8532万人次，下达兵团低保资金预算2918万元，发放低保、补助资金2220万元。发放医疗救助资金936.5万元，1.4万人次得到医疗救助。全年国家抚恤、补助各类优抚对象326万人，接收安置退役士兵140人。年末有各类收养性单位9个，床位数810张，在院收养294人。

2014年，新疆生产建设兵团第六师城镇常住居民人均可支配收入26858元，较2013年增长10.0%；连队常住居民人均可支配收入13860元，较2013年增长10.3 %。全年在岗职工工资总额39.52亿元，较2013年增长12.6%。在岗职工年平均工资47257元，较2013年增长7.6%。

2014年，新疆生产建设兵团第六师参加职工基本养老保险人数178334人、居民社会养老保险参保人数16309人。参加基本医疗保险271508人，其中职工基本医疗保险157951人，居民基本医疗保险113557人。参加失业保险69541人、工伤保险75651人、生育保险72207人。

新疆生产建设兵团第六师主要特产有：巴旦木、切糕、哈密大枣、新疆葡萄等。

青格达湖风景区是国家AAAA级景区、国家水利风景区、兵团自然保护区，位于五家渠市南郊3公里，南距乌鲁木齐市32公里，占地36平方公里，有17平方公里水面、10平方公里的湿地，青格达湖蒙语的意思是“神灵之水”。青格达湖（原名猛进水库），是1952年中国人民解放军六军十七师进驻新疆后，在乌鲁木齐河、头屯河、老龙河的三河交汇口的泉水溢出带上建成，于1955年竣工，名称以六军十七师的代号“猛进”命名，人称“军垦第一湖”。

一万泉景区是国家AAAA级景区，位于新疆兵团农六师奇台中心团场以南天山万泉峰下，距离乌鲁木齐250公里，占地面积4平方公里，是集娱乐餐饮、避暑度假、会议培训为一体的生态旅游景区。

新疆生产建设兵团第六师著名人物有：洪学智、王宏坤、周纯全、许世友、陈再道、黄永胜、向守志、王新亭、李聚奎、王建安等。