1959年冬，新疆军区生产建设兵团会计培训队在乌鲁木齐成立。1961年，会计培训队迁至石河子，更名为兵团财经训练班。次年10月，“新疆军区生产建设兵团财经干部学校”正式成立。1967年因受“文革”影响，学校迁往迁往南疆和静县的哈拉毛墩。次年8月，学校被宣布撤销。1981年新疆农垦总局决定恢复兵团财经干部学校。次年兵团恢复后，兵团党委随即宣布成立“兵团财经学校”，校址设在乌鲁木齐三坪农场，一面筹建学校，一面办培训班。1984年新校址选定与五家渠新城，开始恢复建校工作。1986年筹建、次年经国家教委批准成立了兵团经济专科学校。

1960年4月，新疆军区生产建设兵团决定开始筹建师范学院，同年9月确定为：新疆军区生产建设师范专科学校，学制3年。1962年因国家“三年困难”实行院校调整，新疆军区生产建设师范专科学校停办。1980年8月，新疆农垦总局决定在奎屯市筹建新疆教师进修学校，次年12月，中共中央恢复新疆生产建设兵团，1983年4月，兵团决定在教师进修学校基础上成立兵团教育学院。经4年发展，于1987年3月，在新疆生产建设兵团教育学院基础上建立“新疆生产建设兵团师范专科学校”。

1996年9月11日，石河子农学院与石河子医学院、新疆建设兵团经济专科学校、新疆建设兵团师范专科学校合并组建成立石河子大学，校名由中国共产党中央委员会原总书记江泽民题写。兵团经济专科学校摘牌后被作为兵团农垦职工大学校址，挂牌“石河子大学职业技术学院”。兵团师范专科学校迁至石河子，在原校址组建了石河子大学成人教育学院奎屯分院。2000年8月，石河子大学被教育部确定为西部大开发重点建设高校，次年6月，教育部启动“对口支援西部高等教 育计划”，指定北京大学对口支援石河子大学。2004年，学校被确定为兵团和教育部共建高校，次年6月16日，新疆军区和石河子大学正式签订了为军队培养干部的协议。此后，石河子大学将成为继新疆大学之后，新疆第二所培养国防生的高校。

2008年进入国家“211工程”重点建设高校行列，两年后被教育部评为“全国毕业生就业典型经验高校”。2012年入选国家“中西部高校综合实力提升工程”重点建设高校行列；2017年入选国家“双一流”建设（一流学科）高校；次年入选教育部与新疆生产建设兵团“部省合作共建高校”。2021年1月，石河子大学科技学院整合兵团警官高等专科学校办学资源转设为新疆政法学院。次年，石河子大学入选新一轮国家“双一流”建设高校。2022年3月，共青团石河子大学委员会被中国关心下一代工作委员会办公室拟确定授予“全国青少年普法教育先进集体”称号。次年，由八师石河子市、石河子大学、中国煤科规划院共同发起设立八师石河子市能源研究中心正式揭牌。同年11月，由新疆天鹅现代农业机械装备有限公司牵头，联合石河子大学、塔里木大学、新疆农垦科学院机械装备研究所，与山东天鹅棉业机械股份有限公司等5家单位共同组建成立兵团农机装备制造业创新中心。同年12月10日，石河子大学牵头成立全国智慧能源行业产教融合共同体。

截至2024年3月，石河子大学设有党政机构20个，群团组织2个，教学机构23个，教辅机构10个，科研机构4个，附属单位5个，附属医院6个。

截至2024年3月，石河子大学有23个学院，开设99个本科专业（招生专业90个左右），学科专业涵盖经济学、法学、教育学、文学、历史学、理学、工学、农学、医学、管理学、艺术学11大学科门类。

截至2024年3月，石河子大学有9个一级学科博士学位授权点、1个专业学位博士授权点、30个一级学科硕士学位授权点、31个专业学位硕士授权点。8个博士后科研流动站、2个博士后科研工作站。国家一流建设学科1个、国家重点学科1个、部省合建学科群2个。临床医学、农业科学、化学、植物与动物科学、工程学、材料科学、环境/生态学7个学科进入ESI全球前1%。

截至2024年3月，石河子大学有教职工2721人，专任教师2006人（教授399人、副教授784人）。有中国工程院院士2人，入选国家人才项目40人次，国务院特贴专家76人，全国高校黄大年式教师团队2个，自治区、兵团级人才204人；国家级教学团队3个、国家级教学名师2人。还曾获得过第九届中国技术市场金桥奖“先进个人”、国家自然基金新疆联合基金本地人才等奖项。

截至2024年3月，石河子大学有28个国家一流专业建设点、20个省级一流专业建设点；国家级一流课程16门、省级一流本科课程75门，国家级精品课程4门、精品视频公开课3门、精品资源共享课2门，国家级特色专业建设项目5个、实验教学示范中心1个，教育部第二批虚拟教研室建设试点项目2个。国家级创新创业教育实践基地建设单位，3个团队获得中国国际“互联网+”大学生创新创业大赛金奖。教育部卓越（医生、工程师、农林人才）教育培养计划项目试点高校。

截至2023年，石河子大学获得两次2023年国家级教学成果奖，37项省部级奖项。其中省部级一等奖五项，二等奖15项，三等奖16项，特等奖1项。

截至2024年3月，学校在哈萨克斯坦建立孔子学院，在俄罗斯和哈萨克斯坦分别建立一所汉语中心。先后与美国、俄罗斯、哈萨克斯坦、新西兰、奥地利、日本等国家70余所大学和科研机构开展了多层次、宽领域的交流合作，先后有34个国家1350余人来校留学。自2001年开始，北京大学长期坚持对口支援石河子大学；2010年新一轮对口支援工作开展以来，在教育部大力支持下，以北京大学为组长单位，华中科技大学、华东理工大学、华中农业大学为副组长单位，重庆大学、江南大学、对外经济贸易大学、南京师范大学、华南农业大学为成员单位的高校团队对口支援石河子大学。2018年，中国农业大学对口援建我校农业工程学科。学校先后与30余所国内高校及科研院所达成合作意向；与自治区各级政府、兵团师市签订了合作协议50余个；与30余家企业建立了校企合作关系。　

截至2024年5月，石河子大学拥有7家附属医院，其中包括直属附属医院1所、非直属附属医院5所、附属动物医院1所。

截至2024年3月，有省部共建国家重点实验室培育基地2个，教育部重点实验室2个，农业农村部重点实验室2个，卫生与健康委员会重点实验室1个，兵团重点实验室14个，国家国际科技合作基地3个，教育部工程研究中心3个，国家地方联合工程研究中心1个，国家地方联合工程实验室2个，国家大学科技园1个，国家新农村发展研究院1个，兵团工程技术研究中心3个，省部共建教育部协同创新中心3个，兵团协同创新中心4个，兵团工程技术研究中心（工程实验室）5个，兵团国际科技合作基地3个，兵团农业技术创新中心2个，兵团临床医学研究中心17个，高等学校学科创新引智基地（“111”计划）1个，国家临床医学研究中心兵团分中心3个，国家民委研究中心（基地）2个，自治区和兵团文科重点研究基地5个，兵团新型科技创新智库2个。

截至2024年3月，学校主动承担国家、兵团重大科研任务，立项各级各类项目2703项，科研总经费近10.53亿元。获省部级以上奖励95项，获授权有效专利1641件，以技术转让、技术开发等形式实施知识产权成果转化40件，技术交易额4900余万元。获教育部高等学校科学研究优秀成果奖（人文社会科学）三等奖2项，36项成果获得自治区哲学社会优秀成果奖，其中一等奖5项、二等奖4项、三等奖8项、优秀奖19项。

2018年9月，石河子大学获批2018年度国家自然科学基金项目81项（不含联合基金项目），直接经费3011.3万元。其中面上项目1项、青年基金项目6项、地区基金项目74项；获批15项2018年度教育部人文社科研究项目。

截至2024年3月，石河子大学立项各级各类项目2703项，科研总经费近10.53亿元。获省部级以上奖励95余项，获第八届高等学校科学研究优秀成果奖（人文社会科学）三等奖2项，36项成果获得自治区哲学社会优秀成果奖，其中一等奖5项，二等奖4项，三等奖8项，优秀奖19项。

截至2021年9月，石河子大学图书馆有1个总馆，3个分馆，16个专业馆。馆藏有纸质图书300余万册，电子图书400余万册，万方、维普、CNKI、Springer LINK等中外文数据库110个，以兵团地方文献、中亚文献、古籍文献、硕博论文、石大学子文库及珍稀文献为特色馆藏的各类文献5.8万余种，10万余册。

截至2024年4月，石河子大学博物馆位于石河子大学绿苑区，陈列面积6400平方米，由校史馆、动物馆、昆虫馆、植物馆、新疆历代屯垦史馆五大部分组成。动物馆展出标本472件，昆虫馆展出标本约2万件，植物馆展出标本500余件，新疆历代屯垦史馆，展示了西汉至民国时期中央政权对新疆的开发、治理，各民族共同发展融合的历史事实。

截至2022年7月，石河子大学出版发行了《石河子大学学报（自然科学版）》《石河子大学学报（哲社版）》《新疆农垦经济》《兵团教育学院学报》《农垦医学》5种学术刊物。

《石河子大学学报（自然科学版）》

《石河子大学学报（自然科学版）》是石河子大学主管、主办的综合性自然科学类学术期刊。已入编北京大学《中文核心期刊要目总览》和中国科技核心期刊，连续获得“中国科技核心期刊”“中国高校优秀科技期刊”等称号。被中国科学技术期刊文摘数据库（英文版）、中国学术期刊（光盘版）、美国化学文摘（CA）、中国核心期刊（遴选）数据库、中国生物学文摘、中文科技期刊数据库、中国科技论文统计源期刊、中国科技核心期刊等各大数据库全文收录。

《石河子大学学报（哲学社会科学版）》

《石河子大学学报（哲学社会科学版）》是由“211工程”重点建设高校石河子大学主管主办的人文社科类综合性学术理论期刊。主要栏目有：丝路文史研究、非物质文化遗产研究、政治与社会研究等。期刊加入了国家哲学社会科学学术期刊数据库、中国学术期刊（网络版）、中文科技期刊数据库、中国终身教育学术研究数据库等各大数据库。2011年，被评为“全国地方高校社科优秀学报”。2012年，被评为“民族地区优秀学报”。2014年，首获“全国高校百强社科期刊”等，获得过多项荣誉。

《新疆农垦经济》

《新疆农垦经济》创刊于1981年。是新疆生产建设兵团经济学科领域唯一的一份中国国内外公开出版发行的经济类期刊，曾先后两次被评为中国农业经济类核心期刊、新疆维吾尔自治区社科类优秀期刊。主要栏目有：“三农”问题、丝绸之路经济带研究、兵团问题研究等。被国家哲学社会科学学术期刊数据库、《中国人文社会科学期刊评价报告（AMI）》引文数据库来源期刊、中国期刊全文数据库（CJFD）全文收录期刊等各大数据库收录。

《兵团教育学院学报》

《兵团教育学院学报》创刊于1991年，由兵团教育学院主办。已被中国知网、万方数据、维普全文数据库、中国终身教育学术研究数据库、超星数字期刊等数据库收录。

《农垦医学》

《农垦医学》（原《石河子医学院学报》）是国家“211工程”重点建设高校石河子大学主办的综合性医学学术期刊(双月刊)，国内外公开发行。已被《中国学术期刊(光盘版)》《中国期刊网》“万方数据-数字化期刊群”等数据库全文收录。栏目内容包括基础医学、临床医学、预防医学、药学、口腔医学、传统医学、临床护理、初级卫生保健、卫生事业管理、课题文献综述、新技术新方法讨论、专题讲座、短篇报道、临床病例讨论等。

石河子大学的校徽包括徽志和徽章。学校徽志为双圆套圆形徽标。内圆为绿色，中间是白色草书“天山”图案；外圆为白色，上半部是江泽民同志题写的橙红色校名，下半部是英文书写的绿色校名。学校徽章为题有校名的长方形证章，教职员工为红底黄字，学生为白底红字。

石河子大学的校旗为长方形旗帜，旗面为国旗红标准色，寓意学校建校时间与新中国成立同步；校旗旗面中间印有规定字体的黄色中文校名。

石河子大学的校训为“明德正行，博学多能”。

涵义

1．明德：明，光明，明亮；德，道德、美德。明德，意在使美德发扬光大。语出《大学》：“大学之道，在明明德，在亲民，在止于至善”。

2．正行：正，端正，符合标准；行，行为，行动；正行，意在使行为端正，举止符合礼仪规范。

3．博学：博，丰富，通晓；学，学问，学识；博学，是指学问广博精深。语出《中庸》：“博学之，审问之，慎思之，明辨之，笃行之。”

4．多能：多，很多，多种；能，能力，才能。多能，是指具有多方面才能。

团结 务实 求真 创新

涵义

1．“团结”：团，团聚，会合；结，凝聚，凝结，结合。意为集中各民族力量为实现共同理想而联合起来。

2．“务实”：务，从事，致力；实，真实，实际。意为从事或致力于具体的工作和学习，讲究实际，不尚空谈，不求浮华。

3．“求真”：求，追求，探求，寻求；真，真理，真知，真实。意为工作和学习都要不断追求真理，探求真知，寻求真实。

4．“创新”：创，创建，创造，创立；新，新鲜，新颖，新意。意为工作和学习都要勇于开拓和创造，吐故纳新，推陈出新，破旧立新。

截至2020年，石河子大学有石河子大学冠翔羽毛球协会、石河子大学心理协会、企业模拟协会、九星棋牌协会、知音文学社、阳光志愿者协会等正式注册的社团有105个，涉及体育类、文化类、艺术类、学术类等多方面。学校各社团经常展开一系列活动，例如心缘心理健康协会在校内开展“捐赠一小时”“爱的抱抱”“心灵树洞”等活动；阳光旅游协会拥有导游技能大赛系列活动、博物馆志愿讲解等特色活动。杏坛手工坊定期开展手工技能培训交流会，邀请专业教师开展讲座、培训，培养社团成员的专业手工技能。

石河子大学拥有西部最大的教学楼，坐落于被誉为“戈壁明珠”新疆石河子市，坐在宿舍可远眺雪山。

石河子大学石河子校区位于新疆维吾尔自治区石河子市北四路221号。北三路、北四路将石河子大学的校园分成为北、中、南三部分，校园总面积约114万平方米（截至2009年）。石河子校区拥有图书馆、体育馆、游泳馆、田径馆、会堂、博物馆等一批建筑。

石河子大学五家渠校区位于新疆五家渠市前进东街109号。2024年，根据石河子大学定位定向的决策部署，五家渠校区规划为石河子大学承担非学历继续教育的主要园区；学院职能进一步确定为立足五家渠校区，以非学历教育、在职培训为主，学历提升教育为辅，逐步组织开展继续教育，推进应用型人才培养基地内涵建设。

石河子大学南山校区位于石河子市高新技术产业园内，在石河子市南六路至南八路、东三路至东五路之间，地理位置优越，交通便利。校区占地1440亩，毗邻石河子第一中学、师市党委党校、西北航空职业技术学校、天翔航空学院、天山雄鹰航空学院和新疆农垦科学院国家棉花研发中心。

历任领导（1949.8—1996.6）

历任领导（1996.6—）

石河子大学在学术界、政界、商界、文艺界都有知名校友，如潘世征、刘江等人。