父名日野资康，妹妹日野荣子是4代将军足利义持的正室及5代将军足利义量之母。

1394年（应永元年）继日野业子（康子的姑母，日野资康之妹）之后成为足利义满的妻室，因居住在北山第南御所而被称为南御所，1405年日野业子死后成为继任御台所。1406年，后圆融天皇皇后、后小松天皇生母通阳门院三条严子去世后，义满以天皇二度服丧不吉为由，借关白一条经嗣上下沟通，为日野康子以将军御台所身份成为后小松天皇准母做准备。翌年，康子叙准三后、从一位，得院号宣下为北山院。1408年义满逝世后，康子与妹夫义持的关系疏远。1419年，康子去世，义持对义满的政策的否定直接影响到了康子作为准三后、国母的葬礼仪式，葬礼不很体面。康子死后一月，其居所北山第解体，领地被返还给后小松天皇。