西距琛航岛2800米，东北距永兴岛大约90公里，北距琼海潭门镇170海里。

晋卿岛是中国西沙群岛东北面弧形礁盘上最南的一块岛屿，由于该岛部分区域天生的地貌优势，便于相关企业或部门开辟深水道，兴建码头。从地理位置看，该岛周边有广金岛、琛航岛、珊瑚岛、甘泉岛等岛屿，且都属于中国固有领土。

岛呈椭圆形，长950米，最阔处约420米，面积0.21平方公里（相当于永兴岛原始面积的十分之一），岛东北面有向东北伸出的沙洲。岛上沙堤到中部干泻湖低地生长着茂密的羊角树丛林，步行困难，土质亦为鸟粪土。

晋卿岛礁坪与石屿礁坪为同一大礁体，礁盘大且在水下浅。前者位于西南端，后者位于东北端。

晋卿岛为砂岛，比较大，高约5m左右，植被发育， 在海滩地带比较广泛地发育了海滩岩。环岛有海滩岩发育，沙堤高出海面3-5米。

晋卿岛沙滩洁白，沙粒细小，多姿多彩的贝壳涌到岸边，让拾贝者乐不思蜀，海边漂浮的树干，风吹后的树根又成为摄影师镜头中的焦点。

由于礁盘外缘沟谷系统发育，故小舟入岛方便。礁盘槽沟，可利用来开辟深水道，兴建码头。

西沙的岛不仅是鸟的天堂，有的岛屿还披着葱茏的绿色外衣，晋卿岛便是一个绿色之岛。晋卿岛呈椭圆形，20分钟便能环岛走上一圈。岛上沙堤到中部干泻湖低地生长着茂密的羊角树、麻枫桐、海岸桐、银花树、草海桐、木麻黄等。

此外，这里还有海参场，值于岛北礁盘上。

晋卿岛礁盘大，以产海龟出名，龟门集中于岛的西岸。

晋卿岛东北侧的礁盘上有一个深洞，渔民称“龙洞”，学术界称之为“蓝洞”。目前世界最深海洋蓝洞“三沙永乐龙洞”

南国都市报2012年采访报道：

西沙群岛一带是他们琼海潭门世世代代渔民的传统打渔海域，渔民们除了驾大渔船到深海中打渔之外，为了方便打渔，他们相当一部分人就选择长期居住在各个岛屿上，以打鱼捞螺为生。而在西沙的各个岛屿中，晋卿岛是属于面积相对较大的岛屿，这里还是一个天然的避风港，台风来了，大家也不用躲到其他岛上去，在岛上就可以安全避风。另外，岛上植被也较多，有利于居住生活。

跟黄宏清一样选择在晋卿岛常住的渔民全部来自琼海潭门镇，平时最多的时候，有差不多百号人在岛上，如今休渔期则只有十几人。

渔民来自琼海潭门镇，打鱼捞螺为生，2013年中期居民有90多人，很多渔民从银屿岛搬来。树丛林间，高高低低分布着几十间简陋的油毡棚，这就是岛上渔民日常居住的房子。

2013年初，三沙市政府免费为居民安装了太阳能发电设备，“打鱼归来，洗过淡水澡，用太阳能发的电来看电视，煲饭煮汤，想起来就舒服。”渔民符显兴奋地说，如今感觉在大海中有了家。

晋卿岛的渔民家中都安装上“户户通”直播电视卫星接收设备，能够收看58套节目。

2013-07-22由北控水务集团海水淡化事业部安装了海水淡化设备，结束岛外送水历史。淡化设备按80-100人的供应量设计，每天产直饮水2吨，生活用水28吨，满足岛上居民的基本用水需求。(三沙新闻网记者李庆芳摄)

今后，海水淡化设备在每个有居民的岛屿上都将逐步配备。

常住晋卿岛的居民有90多人，大部分都在南沙海域捕鱼。渔民劳朝登说，5年前，看到晋卿岛植物茂盛，很多渔民从银屿岛搬来这里。直到2012年，渔民的生活还是用电靠柴油，喝水靠运送，洗澡就指着海水和雨水。“这次终于可以好好洗个淡水澡了！”劳朝登高兴得不得了。

2012年4月26日，国家海洋局在官网发布新闻稿称，“原则同意海南省海洋与渔业厅对西沙晋卿岛综合补给基地码头项目用海进行审核“。

该项目拟用海域面积5000多亩，由一家民营企业投资建设，建成后可为南海旅游和渔业开发提供补给保障。南海海域综合补给基地码头项目正在论证中。中国社科院亚太研究所研究员许利平对媒体表示，“在南海主权问题上，中国应在官方上保持低调的同时，在舆论上要尽量高调。即在国际社会发出更多声音，避免国际社会偏听偏信。”。

2015年时，晋卿岛因为目前还没有港口码头，无法停靠大船，出入搬运物资都要用小艇转运。

2015年，在晋卿岛，永乐群岛综合执法救助中心、渔民定居点已经开工，各种机械设备均已运抵岛上，数十名工人在烈日烘烤下，紧锣密鼓施工。

记者从南海航海保障中心西沙南沙航标处获悉，三沙市永乐群岛的晋卿岛和羚羊礁筐仔沙洲两座可抗风17级的灯桩21日建成竣工。

渔民如果病了或受伤了，去西边琛航岛上的小医疗室。