2005年07月，授专业技术少将军衔；12月，当选中国工程院院士。

2010年08月至2011年08月，曹雪涛任中国医学科学院副院长、北京协和医学院副院校长（副局级）。

2011年08月至2015年11月，曹雪涛任中国医学科学院院长、北京协和医学院副校长（正局级）。

2015年11月至2017年12月，曹雪涛任中国医学科学院院长、北京协和医学院校长（正局级）。

2017年12月至2018年1月，曹雪涛任南开大学校长（副部长级）、中国医学科学院院长、北京协和医学院校长。

2018年1月至2022年8月，曹雪涛任南开大学校长（副部长级）。

2018年3月，政协第十三届全国委员会常务委员会第一次会议通过，曹雪涛任教科卫体委员会副主任。

2019年3月至2023年4月，曹雪涛任天津国际生物医药联合研究院院长。

2019年11月16日，曹雪涛当选国际欧亚科学院院士。

2022年7月，任中国工程院第八届主席团成员。

2022年8月，任国家卫生健康委员会副主任、党组成员。

中共十九大代表，第十二届、第十三届、第十四届全国政协委员，第十三届、第十四届全国政协教科卫体委员会副主任。

2022年9月26日，天津市人民代表大会常务委员会公告：南开区选出的天津市第十七届人民代表大会代表曹雪涛因工作变动调离天津，依照代表法的有关规定，曹雪涛的代表资格终止；依照选举法和地方组织法的有关规定，曹雪涛担任的市人大常委会委员职务相应终止。

2023年4月，免去曹雪涛天津国际生物医药联合研究院院长职务。

曹雪涛对树突状细胞（DC）的免疫学和肿瘤的免疫与基因治疗开展了比较系统深入的创新性基础研究和临床应用研究。发现了一种具有重要免疫调控功能的新型DC亚群，且发现成熟DC在基质作用下能进一步增殖和分化；提出了DC的免疫调控新机制并发现其具有两类新的功能；发现的12种新分子获得HUGO正式命名；提出了免疫与基因治疗肿瘤的新途径并开展了其应用研究；发现树突状细胞是人体内数量极少且功能最强的抗原提呈细胞，它为人体建立起一套完善的免疫学“防御机制”

1998年4月发现第一条基因，曹雪涛率领免疫学教研室已做了50000多个基因片断测序，其中有3000多个片断为人类首次发现，已获得人类全长新基因124条。

2021年2月6日，曹雪涛等在《天然免疫与炎症的表观重塑》的文章中首次提出了“Epiregulome”（表观元控组）。

学术著作：

据2020年3月中国科技论文在线官网显示，曹雪涛先后主编专著3部。

学术论文：

截至2019年9月，曹雪涛先后以通讯作者在《Cell》《Nature》《Science》《Nature Immunology》《Cancer Cell》等发表SCI论文260余篇，引用1万余次。代表论文如下：

1. Wang L, Wen M, Cao X. Nuclear hnRNPA2B1 initiates and amplifies the innate immune response to DNA viruses. Science. 2019;365(6454): eaav0758.

2. Jiang M, Zhang S, Yang Z, Lin H, Zhu J, Liu L, Wang W, Liu S, Liu W, Ma Y, Zhang L, Cao X. Self-recognition of an inducible host lncRNA by RIG-I feedback restricts innate immune response. Cell. 2018, 173: 906-919

3. Shen Q, Zhang Q, Shi Y, Shi Q, Jiang Y, Gu Y, Li Z, Li X, Zhao K, Wang C, Li N, Cao X. Tet2 promotes pathogen infection-induced myelopoiesis through mRNA oxidation. Nature. 2018; 554(7690):123-127.

据2020年3月中国工程院官网显示，曹雪涛先后获国家II类新药证书2个。

据2020年3月中国科技论文在线官网显示，曹雪涛先后以第一申请人申报国家发明专利16项，合作申请27项， 已经获得授权13项。

曹雪涛是国家973免疫学项目及国家自然科学基金重大项目的负责人。

据2020年3月中国工程院官网显示，曹雪涛先后以第一完成人获国家自然科学二等奖1项 （2003）、中华医学科技奖一等奖2项、军队和上海市科技进步一等奖2项、上海市自然科学一等奖4项。

截至2019年3月，曹雪涛研究成果先后入选中国十大科技进展（2011年）以及中国高等学校十大科技进展六次（2000年、2004年、2009年、2014年、2015年、2018年）

据2020年3月中国工程院官网显示，曹雪涛先后培养的12名博士生获得全国优秀博士论文。

曹雪涛在第二军医大学、浙江大学和中国医学科学院、北京协和医学院培养了多名研究生。

曹雪涛硕士论文答辩会上，曹雪涛的论文让5位高级专家评委称赞，认为“论文以独特的视角开创了免疫学的又一领域”，“完全达到博士生毕业论文水平”，并建议让曹雪涛破格参加博士生考试。4个月后，补修博士生第二外语完毕的曹雪涛成为跨越硕士直接通过博士论文答辩的研究生。

曹雪涛在感染信号与炎症、免疫调节和肿瘤免疫治疗方面作出了卓越的贡献。（中国医学科学院&北京协和医学院评）

曹雪涛为中国免疫学的发展作出了突出贡献。（《中国科学报》评）

曹雪涛把全部身心和精力都奉献给了祖国的医学事业；他把理想和追求根植于祖国沃土，为振兴中国的医学科技事业作出了突出贡献；他实现了几代中国免疫学人的梦想，为中国人争了光。（人民网评）

曹雪涛潜心探索科学奥秘，勇攀免疫学高峰。（中国科学院评）

曹雪涛将给人类生命科学带来大量福音，也将给中国和人民军队带来骄傲和自豪。（《中国国防报》评）

2014年，伊丽莎白·毕克（Elisabeth Bik）无意间发现了曹雪涛作为通讯作者的三篇论文有着可疑之处。这三篇论文中，有两篇分别于2004年、2007年发表在美国生物化学和分子生物学学会主办的《生物化学》杂志上，另一篇2005年见于美国癌症研究协会主办的《临床癌症研究》中。

在PubPeer上，已经有超过40篇曹雪涛作为论文作者的文章被质疑。

2019年11月18日凌晨，曹雪涛在同行评议网站“pubpeer”发文，回应了爆料者Elisabeth Bik对他部分论文的质询，表示正在仔细检查手稿、原始数据和实验室记录，并补充说，“我仍然对这些论文中得出的科学结论的有效性、牢靠性以及研究的可重复性，充满信心。”

2021年1月21日，科技部发布“针对网络反映的南开大学曹雪涛院士的相关论文涉嫌造假问题”调查处理结果通报：对网络质疑曹雪涛院士的63篇论文，经调查未发现有造假、剽窃和抄袭，但发现较多论文存在图片误用，反映实验室管理不严谨。经联合工作机制审议，决定取消曹雪涛院士申报国家科技计划项目资格1年，取消作为财政资金支持的科技活动评审专家资格1年，取消招收研究生资格1年，责成其对被质疑的论文回应质疑并进行勘误，对存在的问题作出深刻检查，在工程院相应学部通报批评。

2022年4月7日，中国医学科学院/北京协和医学院/南开大学曹雪涛团队在Frontiers in Immunology（IF=7.56）在线发表题为“RNA 2’-O-Methyltransferase Fibrillarin Facilitates Virus Entry Into Macrophages Through Inhibiting Type I Interferon Response”的研究论文，该研究发现病毒感染的巨噬细胞中 poly A+ RNA 上的 2'-O-甲基腺苷 (Am) 增加。功能筛选确定了 RNA 2'-O-甲基转移酶原纤维蛋白 (FBL) 在促进病毒感染方面的作用。

2022年4月13日，中国医学科学院/北京协和医学院曹雪涛团队在Journal of Autoimmunity 在线发表题为”RNA-binding protein hnRNP UL1 binds κB sites to attenuate NF-κB-mediated inflammation“的研究论文，该研究通过在 LPS 刺激的巨噬细胞炎症反应中对 hnRNPs 成员进行功能筛选，将 hnRNP UL1 鉴定为 NF-κB 介导的炎症的负调节因子。总之，该研究增加了对 hnRNPs 在 NF-κB 介导的炎症中的作用的新见解，提出了一种控制炎症性自身免疫性疾病的潜在治疗策略。