广西的租赋多拖欠，征收催缴又非常苛刻严厉，百姓不堪其苦，都逃离家园，但赋税和军饷仍照旧征收。曾翚于是核查拖欠租赋的档案，告知百姓逐渐交纳拖欠的军饷实数，停止对他们的征缴，因此边境的储备逐渐充实。

思明土官知府黄銶与都指挥黄矰是族兄弟。景泰三年（1452年），黄矰杀了黄銶父子，却谎称是强盗所为，案件长久不能决断。李棠传檄曾翚和副使刘仁宅去调查黄矰父子，黄矰派人持千金在路上贿赂他们，并且拥精兵来要挟，请求延缓对此案的审理。曾翚坚决拒绝不接受，把黄矰诱出抓进狱中，于是李棠详细上奏黄矰的罪行。恰逢黄矰因阴谋得以逃脱，他通过上书支持明代宗立自己的儿子为太子，被升为都督同知，与此同时，父子两人都重获自由。尽管众人对曾翚的安危感到担忧，但曾翚本人却表现得若无其事。

太平府与交趾相邻，永乐年间曾运送食盐来供给征讨交趾的军队。等到战争结束，留在太平府的食盐每年都要拨派民丁看守，百姓为此感到痛苦。曾翚上奏请求把这些食盐折价发给官吏作为俸禄，并罢免了看守食盐的民丁，百姓都欢呼庆幸。不久，曾翚因母亲郭淑人去世离职守丧。

景泰六年（1455年），服丧期满，曾翚改任河南参政。当时清军御史竭力多征召士兵来补充军队，曾翚与他们共事，感叹说：“士兵与百姓的户籍不同，怎么可以随意诬陷呢？”有可以分辨清楚的，他总是为百姓分辨。恰逢有人上奏说天下多有冤狱，请求委派官员审理辨别，河南把这个任务交给曾翚。曾翚明察秋毫，详细审理，平反了很多冤案。

天顺元年（1457年），明英宗复位，曾翚入朝觐见，趁机进言说每年兑运的军粮运到临清仓后，又要再兑给军户，出纳环节多有弊端，请求将永次交兑（明代的一种赋税制度，指的是百姓向国家交纳赋税时，需要按照规定的期限和地点，将实物或货币等赋税物品交给指定的官员或机构，完成交纳手续）改为便捷的方式。明英宗答应了他的请求，这个制度一直沿用下去。南阳县有很多流民，众人商议要把他们全部驱逐出境，人心惶惶。曾翚说：“他们不过是因为徭役太重才逃走的，如果逼迫太急，恐怕会生出变故。”于是他与巡抚一起商议解决流民问题，人心才安定下来。

天顺五年（1461年）三月，曾翚升任山东右布政使。他所居住的官署，相传有妖怪，前任官员都不敢居住，但曾翚却毫无疑虑地住了进去。不久，他的妻子和儿子在官署中去世，众人因此劝说曾翚搬家。曾翚说：“生死有命，妖怪又能做什么呢？”山东旧日苦于黄河河道的劳役，又接连遭受水旱灾害，曾翚尽心赈济抚恤百姓，凡是河道劳役所需，都多方筹划，不以此烦扰百姓。曹州有奸诈的百姓指认百姓新开垦的田地为无税田地，献给皇亲国戚，部使者命令曾翚去丈量土地。曾翚说：“按照旧的规定，允许百姓开垦荒地，永远作为世业，现在却要丈量土地并征税，这恐怕不合适吧？”部使者深以为然，于是停止了丈量。

成化元年（1465年）四月，曾翚转任河南左布政使。河南的百姓都高兴地说：“我们的父母官回来了。”荆襄地区盗贼兴起，曾翚考虑到朝廷出兵征讨，必定要经过河南，就预先命令各郡县储备粮食和军用物资，准备好草料，军队一到就供应给他们，百姓因此没有受到骚扰。有一年收成不好，百姓缺粮，而又要赏赐军队数万两白银，官府和百姓都感到筹措困难。曾翚会计核算后，发现开封仓的粮食很多，就拿出官粮一百多万石，平价卖给百姓，饥民因此得以度过饥荒，而军队的赏赐也没有短缺。

成化三年（1467年）十二月，曾翚升任刑部左侍郎，仍享受从二品的俸禄。

成化六年（1470年）二月，明宪宗命令曾翚巡视浙江，允许他便宜行事。曾翚遍历各郡县，询问百姓的疾苦，考察官吏的治绩得失，因不称职而被罢免的官员有几百人，人们都认为处理得当。他减免了繁重的劳役，减少了官府的租税，处罚了奸诈的官吏，禁止了无理的诉讼。工匠因劳役繁重而死亡的，减少他们每年的造作定额；银场因矿藏枯竭而停产的，停止他们每年的赋税；官府机构冗杂的，进行精简；需要增设巡防的，予以增加。百姓都认为这些措施非常便利。

成化七年（1471年），曾翚回朝。有宦官依仗明宪宗的宠信杀人，事情被揭发后，曾翚上奏请求逮捕治罪。奏章上报后，没有得到批复，众人都为曾翚的安危担忧。过了三天，批复下来，最终听从了曾翚的请求。都察院和六科的官员都吐着舌头认为这件事很难办。

成化九年（1473年）十二月，曾翚自己陈述年老多病，恳切请求退休。明宪宗考虑到曾翚确实多病，就答应了他的请求。等到辞别时，特地命令光禄寺设宴为他送行。

曾翚回到家后，很少到城里去。每当风和日丽的时候，他就徜徉在山水之间，吟诗唱歌来自娱自乐。巡抚和布政使商议每年拨给四名皂隶供曾翚家役使，曾翚推辞不接受。

明孝宗登基后，诏令文臣退休，五品以上的进升一阶，廉洁且贫穷的每年发给半数俸禄。有关部门把这件事告诉曾翚，曾翚按照规定进升了资善大夫的职位，却坚决辞谢了俸禄。

弘治四年正月十五日（1491年2月23日），曾翚生了小病，子孙侍奉在旁边发觉有些异样，问他有什么不舒服。曾翚笑着说：“我今天可以死得正正当当了。”他诵读了曾子关于“启手启足”的话，然后就去世了，终年八十二岁。

曾翚在刑部任职期间，处理狱讼公正无私，精通法律，对待权贵也不偏不倚，一律依法处理，因此赢得了贤名；曾翚在陕西司任职期间，处理了大量奏牍，对于涉及权贵的案件，他也敢于接手处理；在广西任职期间，曾翚解决了广西租赋拖欠的问题，通过核查拖欠租赋档案，让民众逐渐交纳实际数目，从而充实了边储；在河南任职期间，曾翚积极救灾，多方筹措资金，赈济饥民，并解决了赏军需银的问题，使得公私皆有所措；在巡视浙江期间，曾翚遍历郡县，问民疾苦，考吏治得失，整顿了吏治，减轻了民众的负担，赢得了民众的称赞。

焦宏：曾主事有猷有为，可大用也。（《资政大夫刑部左侍郎曾公翚神道碑》引）

李贤等：介直刚明，德政懋修。（《明一统志》）

何乔新：公之位不满其德，故施于用者不尽所蕴。然所谓古之大臣者，公无愧焉。（《资政大夫刑部左侍郎曾公翚神道碑》）

刘健等：翚性质实，历官四十余年，勤慎不渝，所在共职同列，心师事之。晚节家居，不入城府。殁之日，家无赢赀，乡人高之。（《明孝宗实录》）

张廷玉等：翚操行谨，所至有声。及归，生计萧然，绝迹公府，乡人以为贤。（《明史》）

据记载，曾翚是一位廉洁谨慎的君子。他清廉得连衣服都破旧不堪，但当他有所坚持的时候，却是万夫莫开，不会因祸福而动摇。自从他入仕以来，就以恬淡退让自守，非常鄙视奔走钻营。他做郎中时，有人劝他只要去拜访一下大臣，公卿的职位就可以立刻得到。曾翚笑着不回答。他执法时从未稍微屈从过，有人认为这不是保全自身和家庭的办法。曾翚说：“我所知道的只是法律而已，其它的不是我所考虑的。”曾翚的职位与他的德行不相称，所以他在任上施展的才能并没有完全发挥出来。

曾翚因年老多病而请求退休，然而，有人却对他提出了三项罪名：贪污受贿、大兴土木建造宫殿，以及招兵买马图谋叛乱。这些指控震惊了朝廷，明宪宗立即命令巡抚前往调查，捉拿曾翚。

巡抚抵达曾翚隐居的山上后，却惊讶地发现，所谓的“九十九根大柱”实际上是曾翚亲手砍削的木棍搭建的草堂；“丈二琉璃瓦”则是覆盖在草堂上的芦苇；“金砖”台阶则是用鹅卵石铺成的。曾翚的生活清贫，以筛子为饭桌，摆篮为门，这与指控中的奢华生活相去甚远。事实上，曾翚在刑部左侍郎任上，曾巡视浙江，罢免了上百名不称职的官吏，并依法处置了18名贪官。这些人对他怀恨在心，一直伺机报复。曾翚一生为国为民，从未考虑个人利益，他的清廉和正直得到了巡抚的证实。

明宪宗在了解真相后，深感内疚，对诬告曾翚的人进行了严厉处罚，并派巡抚安抚曾翚。他赐予曾翚“清风高洁”的匾额，以表彰他的高尚品质。然而，曾翚婉言谢绝了人役和岁银，只收下了匾额。

曾翚著有《龙坡集》，今已失传。

据《江西通志》记载，曾翚墓位于江西省吉安市泰和县南小马坑。