民国2年（1913年）12月，宁波至曹娥段全段完工。

民国3年（1914年）6月11日，宁波至曹娥段通车，长77.9千米。

民国25年（1936年）10月，萧山至曹娥段始建。

民国26年（1937年）11月，萧山至曹娥段铺通，但地理上受曹娥江阻隔，而以当时的财力和技术，无法建造跨江铁路桥，因此萧山至宁波全线未能贯通，二段铁路运输均需渡江换车。

民国27年（1938年），为防日军进犯，沪杭甬铁路管理局奉命将萧甬铁路道轨及枕木逐段拆除。

民国31年（1942年）始，宁绍商车联营处将宁波至曹娥段路基逐段改为汽车路。于是，耗时28年、花费大量财力、精力建造的萧甬铁路化为乌有。

民国35年（1946年），中华民国国民政府拟筹划修复甬曹段铁路，因战事频繁，经济崩溃，修复事宜终成泡影。

中华人民共和国成立后，杭甬铁路萧甬段在原路基上分段重建（仅庄桥站以东为新填路基），并计划延筑至镇海穿山，故曾名萧穿铁路。

1953年7月1日，杭甬铁路萧甬段开始分段重建，萧山至曹娥段先行开工。

1954年12月底，萧山至曹娥江段全部竣工。

1955年1月15日始，修建曹娥至穿山段，6月底修通至余姚，9月底修通至慈溪（今慈城），12月12日修通至庄桥。由于庄桥至宁波南门段因余姚江青林渡铁路大桥两岸地基松软，路堤屡次塌方，而以当时的技术水平，无法解决这一难题，工程无奈暂停。此后一段时间内，宁波市民欲坐火车北上，只能从庄桥上车。至是年底，宁波南门至穿山段完成路基，以及部分桥涵、房建、通讯等工程。同年7月1日，萧山至曹娥江段正式通车。

1956年2月1日，萧山至庄桥段投入临时管理营运，4月30日验收交接，5月1日起正式通车营业。

1957年4月1日，中华人民共和国原铁道部宁波基点试验组在苏联专家帮助下，对余姚江铁路大桥两岸进行软土筑路试验，1959年春告成。是年6月9日，庄桥至宁波南门段续修，9月28日完竣。翌日，在宁波南站举行通车典礼。至此，杭甬铁路萧甬段全线修复。宁波延伸至穿山一段，因故停建。

1982至1984年间，宁波辖境线路路基拓宽，两侧加砌片石矮墙。

1993年，原中华人民共和国铁道部、浙江省共同提出增建萧甬铁路二线可行性研究报告。同年，原中华人民共和国国家计划委员会具文批复，12月，杭甬铁路萧甬段二线工程一期开工，由原中华人民共和国铁道部与浙江省人民政府合资建设。

1998年，杭甬铁路萧甬段二线工程建成通车。

1999年7月，原中华人民共和国铁道部、浙江省政府批准成立萧甬铁路有限责任公司，注册资本20.4亿元，铁道部占87%，浙江省占13%。同年，新增出资方宁波港务局，公司注册资本24.7亿元，上海铁路局占88.1%，浙江省铁路建设投资总公司占9.5%，宁波港务局占2.4%。

2006年11月，杭甬铁路萧甬段电气化改造工程开工，对原萧山站（不含）至宁波站铁路双线实施电化改造。

2009年5月29日，杭甬铁路萧甬段进行接触网热滑试验；次日，第一趟由电力机车牵引的货物列车从江北洪塘编组站开往杭州乔司；同年9月28日，杭甬铁路萧甬段电气化改造完工并开通运营，顺利开行第一列和谐号动车组列车。

2017年6月，利用杭甬铁路富余通行能力开行的宁波至余姚城际铁路开通运营。

2018年4月，利用杭甬铁路富余通行能力开行的绍兴市域城际列车——绍兴风情旅游新干线开通运营。

2019年7月，绍兴风情旅游新干线和宁波至余姚城际铁路贯通运营。

2020年，经过改造的杭州南站将会投用，铁路部门将会安排杭州南至绍兴（上虞）4对8趟城际（市域）列车，其中：杭州南至绍兴2趟，上虞至杭州南6趟。这也是利用萧甬铁路既有线开通城铁列车后，城际（市域）列车首次开进杭州。运营初期，杭州南至钱清免费乘坐，仍需凭票乘车，7月1日，绍兴市委书记正式宣布绍兴城际线“进杭”列车开行。

2017年，中国铁路总公司、浙江省人民政府以铁总计统函〔2017〕288号批复宁波枢纽庄桥至宁波段增建三四线工程可行性研究报告。

2019年7月2日，宁波枢纽庄桥至宁波段增建三四线工程初步设计获得中国国家铁路集团和省政府联合审批。12月，宁波枢纽庄桥至宁波段增建三四线工程开工。

2023年9月19日消息，铁路宁波枢纽庄桥至宁波段增建三四线工程纳入萧甬线，萧甬铁路终点车站由庄桥站调整为宁波站。

2024年6月28日，宁波枢纽庄桥至宁波段增建三四线工程正式启用。

1995年，杭甬铁路萧甬段全线共设24座车站，自西向东分别为萧山站、夏家桥站、钱清站、柯桥站、鉴湖站、绍兴站、绍兴东站、皋埠站、陶堰站、东关镇站、曹娥站、上虞站、驿亭站、五夫站、马渚站、余姚西站、余姚站、蜀山站、丈亭站、叶家站、慈城站、洪塘乡站、庄桥站、宁波站。

2009年，杭甬铁路萧甬段电化改造完成后，全线共设14座车站，自西向东分别为萧山站（2010年更名为杭州南站）、夏家桥站、钱清站、柯桥站（2014年拆除）、绍兴站、绍兴东站（2016年复名为皋埠站）、上虞站、余姚西站、余姚站、蜀山站、慈城站、洪塘乡站（2014年合并至宁波北站）、庄桥站、宁波站。

截至2017年12月，杭甬铁路全线共设14座车站，自西向东分别杭州站、杭州南站、夏家桥站、钱清站、绍兴站、皋埠站、上虞站、余姚西站、余姚站、蜀山站、慈城站、宁波北站、庄桥站、宁波站。

杭甬铁路自沪昆铁路杭州站引出，经杭州市上城区、萧山区，绍兴市柯桥区、越城区、上虞区，余姚市，宁波市江北区，止于宁波站。

东风型内燃机车

1998年，杭甬铁路萧甬段二线工程完工后，运行列车采用东风4型内燃机车。

和谐型电力机车

2009年起，杭甬铁路萧甬段全线完成电气化改造后，大面积采用和谐型电力机车。

“和谐号”动车组列车

2009年9月28日至2013年6月30日，杭甬铁路开行和谐号动车组列车，车型有CRH1、CRH2。

2017年6月，宁波至余姚城际铁路开通运营后；2018年4月，绍兴风情旅游新干线开通运营后，相继投入CRH6F-A型动车组进行运营。

CRH6F-A型动车组，每列4编组，坐席载客量244人，全列额定载客量663人。

杭甬铁路萧甬段运输调度指挥系统采用列车调度指挥系统（TDCS），各站设TDCS分机设备，并预留升级为CTC的条件。系统所需车次号校核系统采用无线通信方式。

宁波通信站设置光纤终端设备（OLT），其余中间站设置光纤网络单元设备（ONU），为沿线车站、所等提供自动电话通道、2/4线音频通道、2/4线音频共线通道、64Kb/s数据通道、2M通道等，杭甬铁路萧甬段各站自动电话通过光纤接入网系统仍然纳入宁波程控交换机。

利用上海局调既有数字专用通信系统设备，杭甬铁路萧甬段各车站均改造为数字专用通信分系统设备，并为无线列调系统提供通道，将列调、货调、无线列调、电调及站场电话系统纳入铁路数字专用通信系统网。

1955年7月，杭甬铁路萧山至曹娥江段正式通车后，每日开行客运列车2对，客货混合车1对，货运列车4至5对。

1956年5月，杭甬铁路萧山至庄桥段正式营业后，每日开行杭州至宁波混合列车1对，货运列车4至5对。

1960年4月21日起，增开97次、98次杭甬快客1对，连前共为4对。

1985年，客运班车增到8对。

1987年4月，又增沪甬持快车1对。

1989年，绍兴站过往客运班车共为9对；绍兴境内每日开行货物列车15对。

1995年末，杭甬铁路萧甬段图定客车8对、货车23对；实际客车8对、货车上行21.8对，下行21.5对。

1956年，杭甬铁路萧甬段当年完成货物发送量24.04万吨。

1989年，杭甬铁路绍兴境内各站完成货物发送量201.9万吨，到发量275.1万吨。

1995年，杭甬铁路萧甬段旅客年发送量为743.06万人，货物年发送量为355.15万吨。

1989年，杭甬铁路绍兴境内各站完成货物发送量201.9万吨，到发量275.1万吨。

1990年，杭甬铁路绍兴市境各站，旅客年发送量442.8万人次，日均发送旅客1.23万人次，春节期间日均超过2万人次。

2017年6月17日至7月17日，利用杭甬铁路开行的宁波至余姚城际铁路“阳明号”列车累计运送旅客73672人次，日均客流2455人次，单日最高发送旅客4411人次。

新塘特大桥位于杭州南站至夏家桥站区间，全长1960米， 共有116个墩台，大桥横跨浙赣铁路，总投资5000多万元，为国家“九五”铁路重点工程项目控制工程。该工程自1998年1月8日开工，于1999年6月建成。

姚江特大桥全长908.14米，是杭甬铁路萧甬段复线的咽喉和控制性工程，为国家重点工程，于2001年11月合龙。

柯桥城区段高架改造工程全长7.8千米，其中柯桥特大高架桥长5.66千米，途经阮四村、阮三村、柯桥村、独山村、柯桥站，总投资12亿元；该工程自2009年11月初步设计方案通过审查，2010年7月正式开工建设，并于2014年1月7日全线通车。

2004年，杭甬铁路萧甬段姚江特大桥工程获2003年度中华人民共和国铁道部优质工程二等奖。

2010年12月，杭甬铁路萧甬段电气化改造工程获2010年度中国铁建股份有限公司优质工程奖。

2017年5月，杭甬铁路绍兴东站及货场迁建工程获中华人民共和国国家铁路局2015-2016年度铁路优质工程（勘察设计）二等奖。

萧甬铁路（杭甬铁路萧甬段）电化改造的实施将有助于实现中国东部沿海铁路电化成网，对加速宁波与杭州、上海等长三角城市的经济互动将起到积极作用。（中国新闻网评）