对形成世界各地的植物区系的植物种进行比较，而把它划分为各具特征的若干个地区的每个区域称为植物区系。相当于动物地理区系方面的动物地理区。植物区系受到该地区地质史的影响较之受生态气候条件的要大；例如即使同是热带雨林，但在马来和南美植物区系构成的成分则有显著不同，所以作为个别的植物区系来处理。植物区系的划分始于J．F．Schouw（1823），今天普遍应用的是经修改的H．G．A．Engler（1896）的划分法（L．Diels．1918；H．Brockmann Jerosch，1935等）区系最大的单位为区系界，分为全北植物区系界、旧热带植物区系界、新热带植物区系界、澳大利亚植物区系界、好望角植物区系界、南极植物区系界等六个区系界。各区系界之下是区系区（或是简单称为地区），在其下又区分为地方（province德provinz）等。实际上，区系区的阶段是最为实用。