1900年7月16日，格里布斯基命令一个不留地逮捕所有的中国人，疯狂的大搜捕开始了，全副武装的沙俄士兵闯进中国人的住宅和商店，不分男女老幼，一律逮捕押走，“就连怀抱的婴儿也被强拉了出来”。1500多中国人逃到城外躲藏，也被俄兵搜出，许多人被刺刀活活捅死，活着的人“像关进兽栏子一样被赶进警察局”。这一天共搜捕了近3500人，警察局容纳不下，当晚又被押送到精奇里江边的一个锯木场里。

1900年7月17日，海兰泡市警察局把所有关押起来的中国人赶到黑龙江边，谎称用船将他们渡过对岸。可是岸边连一条船也没有。到了江边，俄兵便挥动战刀，把所有的中国人“一直赶进水里”。“当妇女们把他们的孩子抛往岸上，乞求至少饶孩子一命时，俄兵却逮住这些婴儿，挑在刺刀上，并将婴儿割成碎片”。一个母亲“把孩子留在岸上，而她自己走进河里”，但走了几步以后，又回来抱住孩子走进水中，最后又不得不上岸“放下她宝贵的孩子”，惨无人道的俄兵便挥刀刺杀了孩子和他的母亲。

一位参与屠杀的俄兵记述了整个大屠杀的过程：

“到达布拉戈维申斯克时，东方天空一片赤红，照得黑龙江水宛若血流。手持刺刀的俄军将人群团团围住，把河岸那边空开，不断地压缩包围圈。军官们手挥战刀，疯狂喊叫：‘不听命令者，立即枪毙!’ 人群开始像雪崩一样被压落入黑龙江的浊流中去。人群发狂一样喊叫，声震蓝天，有的想拼命拨开人流，钻出罗网；有的践踏着被挤倒的妇女和婴儿，企图逃走。这些人或者被骑兵的马蹄蹶到半空，或者被骑兵的刺刀捅翻在地。随即，俄国兵一齐开枪射击。喊声、哭声、枪声、怒骂声混成一片，凄惨之情无法形容，简直是一幅地狱的景象”。

“清扫现场的工作，紧跟在一场血腥的屠杀之后立即开始进行。那堆积如山的‘尸体’，大部分是气息未绝的活人，周身肝脑迸溅，血肉狼藉。不管是死是活，被一古脑儿地投入江流。清扫过后。黑龙江水浮着半死的人们像筏子似的滚滚流去，残留在江岸大片血泊中的只是些散乱丢弃鞋、帽和包袱之类。就是连这些遗物，也都被蹂躏得一无完形”。

瑷珲副都统衙门笔帖式杨继功记述：“二十一日（公历七月十七日）午前十一钟时，遥望彼岸，俄驱无数华侨圈围江边，喧声震野。细瞥俄兵各持刀斧，东砍西劈，断尸粉骨，音震酸鼻，伤重者毙岸，伤轻者死江，未受伤者皆投水溺亡，骸骨漂溢，蔽满江洋”。

目睹这场大屠杀的人，无不感到“毛骨悚然和为之心碎”。就连屠杀者也受到了良心的谴责，一个俄国义勇兵说，“杀人的一方，完全灭绝人性，他们不是魔鬼，便是畜性。在人世间竟能看到如此惨景，…简直就是一场恶梦。如果被杀的人都是些还有挣扎能力的男子的话，也许不会如此凄惨”，但是当看到“一些紧搂婴儿企图逃脱的母亲被纷纷刺倒，从怀中滚落的婴儿被碾得粉碎时”，“只有那些完全没有人性的野兽才能禁得住!”

海兰泡大屠杀从1900年7月16日一直进行到21日，共夺去了5000多名中国人的生命，只有少数人游到对岸而得以逃生。1900年7月22日，阿穆尔当局宣布，海兰泡中国人被全部“肃清”了。事发十几天后，沉溺在黑龙江底的无数死难者尸体浮上水面，顺流淌去，江面漂浮油层，江水为之奇腥。

1900年7月17日，阿穆尔当局举行海兰泡大屠杀的同时，另派出军队扑向江东六十四屯，对中国居民举行了“多次扫荡”。俄兵“驱各屯居民聚于一大屋中”举火焚烧，大部分被活活烧死”。俄兵又“沿村发火”，毁尽房屋，枪杀居民，仅博尔多屯一地就杀害了上千人。最后俄军将“未及过江者，不分男妇老幼，农夫工匠，负贩商贾及民间各行等业一同逼入江中，通共浮水得生者不过六七十人，其余均被逼溺死江中，浮尸蔽江者数日不绝”。至21日，俄军将中国居民的村庄“全部捣毁干净”，这次江东六十四屯惨案，又夺去了二千余名中国居民的生命。

滔滔的黑龙江变成了一条流不尽的血河!这是江上“有史以来最大的屠杀，最大的悲剧，最大的罪恶。”惨案已经过去120多年了，但如今重温这一段血与火的历史，它不仅激起中国人民的无比义愤，而且也不能不激起一切善良人民感情的波澜。人们不禁要问，到底是什么因素促成了这一惨绝人寰的悲剧?

沙俄当局振振有词地说，中国东北地区的义和团运动破坏了俄国修筑的铁路，杀害了俄国铁路员工和妇女儿童，海兰泡与江东六十四屯大屠杀是它采取的“报复”措施。

1900年7月31日，海兰泡市议会举行会议，授权格里布斯基征用江东六十四屯中国居民所遗弃的粮食、家畜，以供民用和军需，拍卖海兰泡中国居民的财产，并利用中国人的住宅和商店作为军用医院和宿舍。中国居民的全部田园财产均被沙俄军事当局征用和没收。

海兰泡和江东六十四屯大屠杀之后，沙俄立即以这两地为基地对中国东北地区举行野蛮的征服。戈罗戴科夫首先派俄轮驶入额尔古纳河、黑龙江和乌苏里江，摧毁中国沿江卡伦和村镇，派骑兵深入乌苏里江左岸大肆烧杀。接着俄军主力扑向黑河屯与瑷珲。他们将黑河屯“未及逃走的居民全部杀戮和投入火堆”，“全部夷平了这个“拥有五六千人口的城镇”。在瑷珲城中“四向焚烧”，使“数千余房，毁尽为墟”，只留下一座营盘和一个火药库供他们作战使用。

1900年8月4日，阿穆尔省军管省长格里布斯基宣称：“根据《瑷珲条约》规定一直归中国当局管辖的前满洲外结雅地区（即江东六十四屯）及阿穆尔河（黑龙江）右岸为我军占领之满洲土地，已归俄国当局管辖。凡离开我方河岸的中国居民，不准重返外结雅地区”。

海兰泡和江东六十四屯两次大屠杀，共有7000多中国和平居民被杀害。美国历史学家贝弗里奇说：“这一惨案是俄国在远东历史中臭名昭著的丑闻”。日本人石光真清指出，这是黑龙江上有史以来“最大的屠杀，最大的悲剧，最大的罪恶!” 俄国人多伊奇认为，“沙俄现 在实行的这种惨无人道的做法，只有与中世纪审判异教徒的宗教法庭和西班牙对异教徒、犹太人和摩尔人的迫害才可以相比拟”。列宁说：“他们杀人放火，把村庄烧光，把老百姓驱入黑龙江中活活淹死，枪杀和刺死手无寸铁的居民和他们的妻子儿女，沙皇政府在中国的政策是一种‘犯罪的政策’”。

中国居民的财产损失没有精确的统计数字。据中国东北地方当局的估计，仅江东六十四屯人民“所遗房产、牲畜、粮食、犁具及资财器物，估计约值五六十万卢布”，另一种估计为三百余万两；此外土地损失为“一百万卢布（每俄亩按十卢布计算）”，总数不少于一百五六十万卢布。海兰泡市仅中国人开设的大商号就有二百三四十家，小商小贩布满全城。中国地方官员指出，中国“商人之赁屋于海兰泡及投于俄人之家者，积财至数十万之多，累日至十年二十年之久，如是者亦不可以数计”。据俄国人记载，“中国人居住区有几百间商店和仓库，其中有价值千百万卢布的贵重物品”；一个中国商人为求活命一次就交出四千卢布的赎金。这些材料足可证明中国商人是十分富有的。海兰泡当局在大搜捕的同时，对中国人的商店和住宅全部封查加岗，被捕者遭到搜身，就连溺尸都被捞起搜查。被难者除随身衣物外，其余财产和物品全被沙俄强盗洗劫而去。海兰泡当局拍卖中国人财产的借口是偿还俄国债权人，但更多的俄国债务人却因中国债权人的被害而受益，两者足可抵销。因而拍卖所得款项基本上部被当局据有。沙俄当局没有也不可能公布劫夺的财产数目，但据以上情况估计，中国商人、雇工、农民、工匠各类人所损失的货物、现金、房产、家私、粮食等，绝不下于一百万卢布，一再加上六十四屯中国居民的损失，总共约为二百五六十万卢布。

沙俄制造海兰泡惨案，屠杀没有任何防御能力的中国和平居民，掠夺他们的财产，是违反国际公法的。中国政府完全有权要求沙俄政府惩办罪犯，赔偿中国居民生命财产损失。

1900年7月和8月，沿着黑龙江和乌苏里江又发生了许多起大规模驱逐中国人、以及在俄国境内（有时甚至越境）有组织地袭击和屠杀中国人垦殖村庄的事情。在涅尔琴斯克（尼布楚）、斯列坚斯克、哈巴罗夫斯克（伯力）和乌苏里斯克（双城子）等地，有几百名中国人遭到杀害。1901年5月，在阿穆尔省成立了军事法庭，对海兰泡屠杀和江东六十四屯屠杀事件进行调查。审讯工作一直到1902年2月才结束，当时俄国内政、司法和陆军大臣取得了一致意见，格里布斯基将军被认为应对“驱逐问题处理失当”而负责，但是鉴于他“过去的功劳”，只是把他调到总参谋部。布拉戈维申斯克城的军事司令官被判处三个月监禁，然后撤销职务。实际负责驱逐中国人过河的当地警察局局长被判处监禁三个月。对于所有其他的控诉，一概不再受理。

1900年7月，沙俄悍然出动10多万侵略军以“护路”为名。从五路大举侵入中国东北地区，洗劫中国居民住宅和商店，随后夺去六、七千中国人的生命制造了骇人听闻的“海兰泡惨案”。

海兰泡是黑龙江畔的一个村庄，原名孟家屯，后改称海兰泡。1858年沙俄强迫清政府签订《瑷珲条约》后，将这里改名为布拉戈维申斯克（意为“报喜城”）。1900年，这里大约有3.8万人，半数以上是中国人，他们长期以来就在这里耕种、作工、经商。当时大小商号有500家。1900年7月上旬，沙俄当局下令通知海兰泡的中国居民，中俄两国要打仗，要把他们送过江去，各家不许闭门上锁，7月15日下午，俄军突然封锁黑龙江，扣留全部船只，不准中国居民过江。

7月16日，沙俄军队强行将数千名中国居民赶进警察署，中国居民的住宅和商店随即被洗劫一空。附近的中国村民也横遭搜捕，凡进行抵抗的都被刺杀，由于被关押的人越来越多，警察署容纳不下，晚上居民们又被带到精奇里江畔一个木材厂的院子里。7月17日，第一批中国居民大约有3000多人，被沙俄哥萨克兵押往海兰泡北六英里的黑龙江边，途中掉队的都被俄兵活活砍死。当时江面最窄的地方仍有700英尺宽，水流湍急，而且一只船也没有。哥萨克兵强迫中国人泅渡，先下水的立即沉溺，不敢下水的遭到俄军的射击和砍杀，半小时后岸上中国人的尸体堆积如山。

当时对岸中国人中的目击者说：俄兵“各执刀斧，东砍西劈，断尸粉骨，音震鼻酸，重伤者毙岸，轻伤者死江，未受伤者皆投水溺亡，骸骨漂溢，蔽满江岸，有随波力拥者过者80余名，赤身露体，昏迷不能作语。……询知惨杀溺毙华侨有5000余名。”从7月16日至21日，俄军在海兰泡共进行了4次大屠杀，夺去六、七千中国人的生命。一份俄国的官方笔录说：“目击者的全部证词令人相信，这实际上不是渡江，而是把中国人斩尽杀绝和淹死。”