主词条：深灰科学博物馆

坐落在深灰市西北边的博物馆是这里著名的景点之一。进入主展厅需要50元门票，里面主要展出了一些历史遗物，包括化石和航天飞机模型。

博物馆有两层楼，第一楼有前台和化石展览，包括了化石翼龙和镰刀盔的化石。第二楼有宇宙博览会，特点为航天飞机模型和堕落于月见山的大型月之石。在第一世代，航天飞机模型是“哥伦比亚号”。“哥伦比亚号”已于2003年2月1日失事。

可以使用居合斩/袈裟斩从后门进入博物馆，从研究员得到秘密琥珀而复活化石翼龙。另外在《宝可梦火红·叶绿》中，还能教授招式地球上投。