2008年7月6日，清华大学撤销应用技术学院建制。

2012年底，软件学院主体搬至东主楼和东配楼。

2021年12月，被公示为首批特色化示范性软件学院。

据2020年5月清华大学软件学院官网显示，软件学院开设软件工程1个本科专业。

据2020年5月清华大学软件学院官网显示，软件学院设有1个一级学科及4个二级学科，所有一级学科、二级学科均有硕士和博士学位授予权；此外还有1个博士专业学位授予权。

博士学位一级学科授权点：软件工程

博士学位二级学科授权点：软件工程理论、软件工程技术与管理、信息系统工程、软件服务工程

博士专业学位授权类别：工程

硕士学位一级学科授权点：软件工程

硕士学位二级学科授权点：软件工程理论、软件工程技术与管理、信息系统工程、软件服务工程

在2017年教育部学位与研究生教育发展中心进行的第四轮学科评估中，清华大学软件工程一级学科的排名位列全国高校A类。

据2020年5月清华大学软件学院官网显示，软件学院建设有2门国家级精品课程，2门课程被评为教育部普通高等教育精品教材，还有5门课被评为清华大学精品课；此外，拥有1个教育部人才培养模式创新实验区。

教育部人才培养模式创新实验区：“清华大学软件拔尖创新人才培养实验区”

国家级精品课程：《软件工程》、《电子商务概论》

教育部普通高等教育精品教材：《电子商务概论》、《Java程序设计教程（第2版）》

据2020年5月清华大学软件学院官网显示，软件学院先后获得北京市高等教育教学成果一等奖1项，清华大学教学成果特等奖1项，国家级教学成果二等奖1项，清华大学教学成果奖3项。

据2020年5月清华大学软件学院官网显示，软件学院共有教师44名，其中1名中国工程院院士，2人入选国家“万人计划”，5人获国家自然科学基金委杰出青年基金资助，5人获国家自然科学基金委优秀青年基金资助，2人入选教育部“新世纪优秀人才支持计划”，2人当选北京市高等学校教学名师，1人荣获北京市教育创新标兵称号，1人当选北京市师德先进个人，1人入选北京市“科技新星计划”，1人获北京市杰出青年基金资助，1人入选北京高校“青年英才计划”，2人入选中国科协“青年人才托举工程”， 1人当选国家示范性软件学院十佳教师，多名清华大学良师益友和1名“清韵烛光——我最喜爱的教师”。

中国工程院院士：孙家广（专职）

国家杰出青年基金获得者：向东、雍俊海、刘云浩、王建民、丁贵广

国家“万人计划”科技创新领军人才：王建民（名单不全）

据2020年5月清华大学软件学院官网显示，软件学院建成了1个国家级工程技术研究中心，1个教育部重点实验室，1个国家级研究院等支撑平台，同时组建了四个研究所；成立了六个研究院/研究中心。

国家级工程技术研究中心：国家企业信息化应用支撑软件工程技术研究中心

国家级研究院：国家服务外包人力资源研究院

教育部重点实验室：教育部信息系统安全重点实验室

院级研究所：软件系统与工程研究所、信息系统与工程研究所、可信网络与系统研究所、计算机辅助设计图形学与可视化研究所

与企业共建研究院/研究中心：清华大学—中车四方所智能装备工业物联网联合研究中心、清华大学—快手未来媒体数据联合研究院、清华大学—永辉智能供应链管理联合研究院、清华大学-石家庄开发区天远科技有限公司智能装备大数据技术联合研究中心、清华大学—湖南中烟智慧企业数字化技术联合研究中心、清华大学-中央国债登记结算有限责任公司金融信息科技创新联合研究院

据2020年5月清华大学软件学院官网显示，软件学院学科发展以国家重大战略需求和国际科技前沿为导向，以计算机科学与技术、信息安全、系统科学、计算数学和应用数学等为依托，注重跨一级学科的交叉与联合。从软件系统的可信性度量和演化的基本规律出发，研究现代软件面临的复杂性、开放性、演化性等挑战性问题，同时立足软件工程应用和产业发展需求，研究提高软件开发效率和质量的方法、技术和工具。

软件工程理论方向：软件工程理论方向强调系统性，强调软件与其环境的动态交互，以适应当前软件规模更大、交互更多、结构更复杂、动态开放等新型软件特征；强调软件工程的理论探索，以软件系统建模和验证为核心，基于形式化方法指导软件全生命周期各阶段的实践，提高软件系统的可信性。该方向将依托软件系统建模验证联合实验室，坚持将理论研究与工业界的现实需求相结合，形成理论研究、工具开发与实际应用三结合的科研模式，构建既可“顶天”、也可“立地”的教学与科研融合的创新平台，走出“以需求牵引学术创新、以研究推动应用创新”的学科建设与发展的新路。

软件工程技术与管理方向：软件工程技术与管理方向以现代软件的生态环境为背景，重点研究新形态的软件体系结构及形式化表示、动态自适应的需求工程方法、基于复杂网络的软件缺陷预测分析、开放网络环境下软件测试理论与方法以及集成化支撑系统平台等关键技术。

信息系统工程方向：信息系统工程方向主要研究以复杂海量数据为核心的信息系统开发方法，包括复杂海量数据管理理论和面向领域的复杂软件系统开发方法与支撑平台。该方向将以研制新一代“大数据”管理平台为载体，研究面向云计算环境的海量数据管理与过程管理技术，重点突破大规模并行过程的建模与行为分析、非结构化数据管理与挖掘、移动端内容版权保护及系统性能工程等新型理论、模型、技术与方法，基于该“大数据”管理平台，开发面向新型网络增值服务和企业信息化应用的支撑软件。

软件服务工程方向：软件服务工程方向以用户需求为导向，基于网络和云架构，依托软件服务管理平台，对原子服务进行动态组合和协同，研究用户需求的获取，软件服务的模型和形式化方法，服务组合和协同理论，以及服务提供机制和管理平台。该方向将研究重点放在移动服务和媒体服务方面。移动服务研究涵盖无线网络通讯协议设计、无线网络定位、网络故障诊断、无线网络安全。无线传感网研究成果将继续深入应用于煤矿、海洋、林业等物联网系统中。媒体服务以自主知识产权的三维数字核心系统为载体，重点研究几何建模、渲染、可视化、图像和音视频处理等，并在建筑、机械、医学与防灾减灾等领域继续应用，形成产学研一体化的创新平台。

据2020年5月清华大学软件学院官网显示，软件学院先后承担国家自然科学基金、973计划、863计划、国家“核高基”科技重大专项及国际合作项目、地方与企业等合作项目，研究出十余项拥有自主知识产权的软件产品，获得省部级以上数十项奖励，包括国家科技进步二等奖、国家九五科技攻关重大成果奖、教育部科技进步一等奖、中国软件行业协会优秀软件奖、863目标产品评测第一名等。

清华大学软件学院以推进办学机制改革，探索软件人才培养模式，培养具有国际竞争力、高层次、创新性、应用型软件人才为使命，坚持“质量第一、素质与技术并重、理论与实践结合”的建院宗旨，以“教学立院、管理建院、学科兴院、科技强院”为办学理念，遵循“练中学、练中闯、练中创”的实践教学思想。

清华大学软件学院院徽主体图案为日晷和“Software”的缩写“S”，代表软件；学院中英文全称环绕图案周围；院徽外圆沿用了清华大学校徽的圆面。

据2020年5月清华大学软件学院官网显示，软件学院有软件学院学生科学技术协会、软件学院研团总支、软件学院研究生会、软件学院学生会、软件学院分团委等学生组织，开展主题学生节晚会、博士生论坛、社会实践等活动。