2012年，Warwick Anderson教授提议在澳大利亚建立一个独立于政府，能够发出具有高水平专业知识的权威声音的健康与医学科学院。

2013年11月，由健康和医学研究领域的活跃领导者组成的发展委员会举行会议，为学院的建立奠定了基础。

2014年6月，澳大利亚健康与医学科学院正式成立。