巴登的玛丽公主于1782年9月7日出生在卡尔斯鲁厄，她是巴登大公储卡尔·路德维希与表姐、黑森-达姆施塔特的弗里德里克·阿玛莉公主的第五个孩子和第五个女儿，她的兄弟姐妹包括巴伐利亚王后弗里德里克·卡罗利妮·威廉明妮、俄罗斯皇后伊丽莎白·阿列克谢耶芙娜、瑞典王后弗里德里克公主、巴登大公卡尔·路德维希·弗里德里希、黑森和莱茵河畔大公夫人威廉明妮公主。1802年11月1日，玛丽与后来的不伦瑞克-沃尔芬比特尔公爵弗里德里希·威廉结婚，弗里德里希·威廉是不伦瑞克-沃尔芬比特尔公爵卡尔·威廉·费迪南德与大不列颠的奥古斯塔·弗雷德里卡公主的儿子。两人婚后生育了二子一女：卡尔二世、威廉和一个死胎女儿。1808年4月20日，在第三次分娩的四天后，玛丽在布鲁赫萨尔去世，享年25岁。