甘肃土木工程科学研究院下设五个专业研究所（防腐蚀、岩土地基、建筑材料、建筑结构、结构抗震），五个专业研究发展中心（岩土工程技术、工程材料、钢结构、工程质量检测、建筑结构加固）、两个分院（工程勘察分院和建筑设计分院）及两个实体公司（兰州有色建筑新技术实业开发公司和兰州金建工程建设监理公司），通过国家技术质量监督局计量认证的中国有色金属工业建设工程质量检测中心和甘肃省工程质量（冶炼）兰州监督站均设在本院。

已具有特种专业工程施工、地基与地基工程施工、防腐保温防水工程施工、钢结构工程施工、工程勘察、工程设计、工程监理、工程咨询、工程招标代理、房屋鉴定、建筑试验、工程质量检测、桩基检测、建筑机械检测等多项资质。主要从事建筑及设备防腐蚀、岩土工程技术、特种建材、工业与民用建筑物可靠性评定及加固等多方面的研究和开发。可进行大中型的酸、碱、盐防腐蚀工程施工；建（构）筑物的检测鉴定及评价：建筑物纠偏、加固设计与施工、诊断与治理；地基基础的加固处理；工程质量检测；工程建设监理；工程地质勘察；大型建筑结构试验；工业与民用建筑的设计。可为用户提供各类砼添加剂（高性能砼外加剂、耐酸、碱、盐砼添加剂）、建筑结构加固材料、钢结构设计、加工、施工，也可为社会提供土木工程技术、工程材料的技术咨询和技术转让。