石矶原为从前女娲的补天之石所化而成，邪恶的千年女魔头，因多年前曾修炼成妖魔为祸人间，被女娲娘娘施法降伏后打回原形，元气大伤，并被镇压于天地之间的擎天柱之下封印悔过；但困得一时，困不住一世，后久经时间流逝，多年后逐渐恢复元气，魔性大增而再次复苏，于是住在恐怖阴森的骷髅山，躲在白骨洞内闭关修炼妖法，直到商朝时期，得知自己的克星哪吒即将出生，并想方设法将其除掉，屡次陷害哪吒。

为了恢复法力，实现统治天地和报复女娲的野心，她选中阴险狡诈的申公豹当自己徒弟和手下。先是用妖法将申公豹引入妖洞，初次相识，石矶利用申公豹给自己找来一百个壮丁，好以吸取人类的血液和魂魄，供自己恢复功力变为人形，为了保住申公豹的脑袋，借三年大旱之际，她将不降雨的旱灾原因嫁祸于李靖一家，后吃人补充元气，练就一身妖法，为了报答申公豹的帮助，石矶施展妖术改变了天气，将冬天换成了夏天，使得商纣王开心，后来还让纣王给自己建庙，强迫众百姓去祭拜。这也同时导致姬昌地盘的军队被洪水淹没，后来在姬昌和姬发父子二人逃亡时，因战败被纣王活捉，乘船擒回朝歌，姬昌被斩首示众而亡，害得小小年纪的姬发可怜自幼丧父，从小被拘禁于地牢中长大。

利用九尾狐妲己从东海偷取龙珠，并同时借机利用龙王之手陷害哪吒，哪吒自刎得救重生，与小龙女和刚吸龙珠的石矶碰面，此时的石矶妖法大增，与太乙真人大战，用碎石阵法困住太乙真人后，又抓住了想逃跑的小龙女，哪吒成功将龙珠带回东海龙宫，太乙真人破了碎石阵和石矶继续缠斗，这时四海龙王和哪吒赶到，共同击败了石矶。石矶见寡不敌众时，伪装成石化状态，被哪吒以乾坤圈砸碎身体而消失。就在申公豹以为石矶死时，骷髅山上妖手浮现，石矶又让申公豹给自己去找一百个壮丁，好以吸足灵魂让自己恢复元气滋补身体。但石矶吸完男子魂魄后，面部也越来越接近男性，石矶大怒，将自己一些残留的杂气排出体外。

后来教唆妲己让纣王让位给自己三天，施法找到大地之脉。只要吸食大量大地之脉的能量，石矶就能拥有大地神力护佑并且可以控制很多妖怪作乱人间。石矶传授申公豹食魂的邪术，还让申公豹附身于雷震子的身体从而打算除掉哪吒，将哪吒、姬发、姜子牙三人引入石矶庙，还被众多妖怪包围，但哪吒却被蝙蝠救走。哪吒为救姬发被李靖用玲珑塔囚禁，殷夫人将哪吒放走搭救姬发，二人一起去阻止石矶吸食大地之脉。

但为时已晚，石矶为了拖延时间放出蝙蝠群抵挡哪吒和姬发，最后已经彻底吸尽大地之脉，拥有了大地力量的庇护，只要哪吒攻击石矶，地上就会受到影响发生灾难，百姓也会受伤害。紧要关头，姬发的护身符发挥神力，将石矶身上的大地之脉力量全部吸收（推测是姬发作为顺应天命的天下共主，让大地之脉作出了选择）没有了大地之脉的力量，哪吒趁机攻击，石矶不敌边打边躲，突然一块石壁上光芒四射，冒出一块圆形石头。此物名叫盘古玉石，乃远古大神盘古的化身所孕育而成，是大地之脉的至宝，石矶攻击哪吒时失手将盘古石毁成两半，石矶和哪吒各抢一半。

哪吒和石矶在抢夺盘古石中被神力波及，元气大伤，各自被巨大能量击落到各方，哪吒和小猪熊掉入到岐山，石矶掉入一片荒地，姬发也被轰飞到一片树林里。石矶的法力一天不如一天，派出申公豹和妲己去偷盘古石，结果被女娲娘娘和太乙真人抓住，侥幸逃回，石矶想利用杨戬对付哪吒，但最后杨戬却被哪吒打败，且看清石矶的阴谋，并反水站在哪吒等人一边，后来石矶又想利用共工对付哪吒，但最后也被共工看破为人，结果反被共工出手一掌打飞，石矶的法力受损，元气再次大伤。就连招架的力气也用尽，逃回骷髅山，无处可逃，被哪吒和小龙女追杀，万般无奈之下只好以毁掉盘古石的理由威胁哪吒，哪吒拿出另一半盘古石祈祷，盘古石神力显灵感应，强制将石矶手里的另一半给吸走，两半盘古石二合为一后越变越大，石矶根本拿不住。

想逃走时被哪吒一乾坤圈打伤，化成一阵妖气再次失去人形，就在哪吒和小龙女以为石矶已经被消灭时，不料石矶又背地里让申公豹将自己带到摘星楼隐蔽躲在地道养伤，暗中派申公豹请人抗周，并给了申公豹一面可以随时随地面对面联系的魔镜。石矶在武王伐纣时派申公豹去海南槟榔岛找自己的老相识“惧留孙”，想利用捆仙绳帮忙对付哪吒，但遭到惧留孙拒绝，后申公豹得知惧留孙的徒弟土行孙喜欢谈交易，于是把土行孙带去攻打周军，土行孙生擒了杨戬和哪吒，晚上因喝多迷路，无意听到申公豹和石矶对话的内容，发现自己被利用，于是放走杨戬和哪吒。

石矶又派申公豹去不周山请来魔家四兄弟帮忙攻打周军，并在哪吒被擒住后，打算用魔镜吸收月光能量除掉哪吒，但哪吒被土行孙暗中救走，最终魔家四兄弟被哪吒、杨戬、土行孙、雷震子四人自创的天极四星阵打走。后来石矶又派申公豹去三仙岛请来赵公明，利用其刚修炼而成的五色神光阵对付哪吒等人。不料赵公明被哪吒等四人联手用天极四星阵打败，并和赵公明化敌为友。之后石矶暗中派申公豹利用“五步穿心酒”毒死了赵公明，并嫁祸给姬发和哪吒，引来碧霄出手对付西周大军。碧霄三番五次攻打姬发时，却在与哪吒交战中屡次失败，最终回到三仙岛。石矶见西周大军不断逼近朝歌城，即将攻打纣王波及自己，于是再次派出申公豹去捉拿李靖夫妇，试图以此威胁哪吒。

就这样，石矶和哪吒斗得你死我活，最终因元气大伤，法力越来越弱，始终逃不过哪吒的掌心，后寡不敌众被杀死。临死前留下最后的王牌，将灵魂寄存于自己吐出的魔石之中，趁哪吒不备砸伤了他的左手臂，通过哪吒左手臂的伤口操纵哪吒的思想，试图让哪吒完全受自己控制从而复活，因此哪吒时不时会失去本性发疯伤人。并用幻觉将哪吒一半意识拉入黑暗之谷的虚幻空间，让其陷入恐慌，一次哪吒从噩梦惊醒后，认为石矶没有完全被杀死，结果偶然听见师父太乙真人和母亲的对话。

得知了石矶的阴谋是想杀死自己借尸还魂，哪吒觉得身体的自控力越来越弱，知道自己久经不住石矶的一再折磨，在为了从痛苦之中解脱的同时又不想伤害别人，只能选择默默离开大家。试着依靠自己的力量来反抗，但还是仍被石矶控制于魔掌之中所摆布，哪吒的母亲殷夫人决定牺牲自己挽救孩子，舍身取义将哪吒送出黑暗之谷，但哪吒清醒后因为失去母亲而悲痛欲绝，认为自己是罪人，祈求父亲李靖用玲珑塔将自己永生囚禁，甚至一心求死，但遭到父亲拒绝，后哪吒绝望得走上悬崖，于心不忍望的着美丽的天下，回忆起之前的时光，决定和石矶同归于尽，以阻止自己变成魔头造成悲剧。一再祈求李靖出手，但身边的亲朋好友一度拒绝，都不愿动手了结自己，哪吒的意志逐渐被石矶侵蚀，已达石矶任意控制的地步，开始失控伤人，打伤师父太乙真人，掐住小猪熊，李靖无奈下及时用玲珑塔将其罩住。

后玲珑塔飞向朝歌城中央的空地，全城许多百姓都纷纷来敬拜哪吒，女娲娘娘和太乙真人飞在半空，看着百姓的哀求，女娲娘娘泪如雨下，滴在玲珑塔上，这股强大的力量让哪吒充满力量，冲破玲珑塔的封印，变出三头六臂的法身。哪吒清醒后法力大增，再一次透入自己的潜意识之中来到黑暗之谷，一枪捅穿妖雾，发出圣光笼罩黑暗，让这片阴森空间的鬼魂怨灵瞬间荡然无存，石矶见末日到来只能服软求饶，并让申公豹魂飞魄散，哪吒以威力巨大的火拳将石矶鬼魂打得魂飞魄散，黑暗之谷也因为石矶被消灭，而从此变成了美丽的仙境世界，哪吒也因此而救回母亲殷夫人，开心地与亲朋好友们团聚。