为此他聘用外国军官来改革步兵和炮兵，并开设了数学、导航和科学院。但是此时奥斯曼帝国已经相当虚弱了，所以他的改革措施没有任何效益。他的体制改革计划立刻遭到了保守的禁卫军和阿訇的反对。

穆斯塔法三世知道奥斯曼帝国的虚弱，因此他试图避免战争，无奈地看着叶卡捷琳娜大帝吞并克里米亚。但由于俄罗斯继续在波兰扩张，使得穆斯塔法三世无法继续忍耐，因此他在死前不久向俄罗斯宣战。

在一系列给叶卡捷琳娜大帝的信中伏尔泰描写穆斯塔法三世为“肥胖和无知”。