1966年，米哈尔科夫因参加电影《呼应》和《不是最成功的一天》的拍摄，从而违反了学校不许学生拍片的规定，被迫退学，但很快又考入了前苏联国立电影学院，直接插入导演米哈伊尔·罗姆的二年级班学习导演（米哈伊尔·罗姆也是米哈尔科夫哥哥的恩师）。

1967年，执导个人首部短片《I ehti guby, i glaza zelyonye》；同年，执导剧情短片《孩与物》。

1969年，由其参演的剧情电影《红色的帐篷》上映。

1971年，执导剧情短片《战争结束时平静的一天》；同年，从国立电影学院毕业后被分配到莫斯科电影制片厂工作。之后，前往远离莫斯科的堪察加半岛的海军舰队，在核潜艇上当了一名水兵。服役期间，米哈尔科夫还自愿参加了一个四人考察小组，以狗拉雪橇为交通工具在坎查加雪原上行程117天，对国内战争时期红军剿匪线路进行了考查。

1974年，自编自导个人首部电影《敌我难辨》。

1976年，执导由叶莲娜·索洛维、罗季昂·纳哈佩托夫共同主演的爱情喜剧电影《爱情的奴隶》，他凭借该片获得德黑兰电影节最佳导演奖。

1977年，执导由亚历山大·卡利亚金、叶莲娜·索洛维、叶夫盖妮亚·格鲁申科联合主演的剧情电影《一首未完成的机械钢琴曲》，影片主要基于契诃夫的第一个剧本《普拉东诺夫》和其他几部小说改编而成，获得第25届圣塞巴斯蒂安国际电影节主竞赛单元-金贝壳奖。

1978年，与人合作创作电影剧本《仇恨》和《横贯西伯利亚的特别快车》；同年，尼基塔·米哈尔科夫获得列宁主义共青团奖金。

1978年，执导由柳德米拉·古尔琴柯主演的爱情电影《五个夜晚》，米哈尔科夫基采用室内剧的形式捕捉了苏共二十大召开时的时代气氛。

1979年，出演由安德烈·康查洛夫斯基执导的战争电影《西伯利亚之歌》。

1980年，执导由奥列格·塔巴科夫、尤里·博加特廖夫合作主演的爱情喜剧电影《奥勃洛摩夫一生中的几天》，该片根据19世纪作家冈察洛夫的长篇小说《奥勃洛摩夫》改编，获得美国影评人协会最佳外语片奖，他凭借该片获得英国牛津电影节最佳导演奖。

1981年，自导自演剧情电影《亲戚》，该片从城乡差异、冷漠的人际关系、爱与亲缘关系的失落等角度入手，以幽默的方式探讨了“亲情“的主题。

1983年，执导由伊琳娜·库普琴科主演的爱情电影《没有证人》，该片获得莫斯科电影节国际影评协会奖，他凭借该片获得全苏电影节最佳导演奖。

1984年，米哈尔科夫被俄罗斯联邦共和国授予人民艺术家的称号。

1987年，执导由马塞洛·马斯楚安尼、玛尔特·克勒尔共同主演的爱情喜剧电影《黑眼睛》，影片以契科夫的《带哈巴狗的女人》为基础改编而成，讲述自己当年同一个他永远无法忘怀的女人之间的浪漫故事，入围第40届戛纳国际电影节主竞赛单元、第42届英国电影学院奖电影奖-最佳非英语片奖；之后，他组建了自己的电影公司，即“3T”公司，由“创作”、“劳动”和“合作”三个词的第一个字母构成，从事电影的制作和放映。

1991年，由其执导的剧情电影《蒙古精神》上映，该片由巴雅尔吐、巴德玛合作主演，入围第65届奥斯卡金像奖最佳外语片奖，获得第48届威尼斯国际电影节主竞赛单元-金狮奖；同年，与娜塔莎·金斯基合作主演爱情电影《被侮辱与被损害的》，他凭借该片获得第26届卡罗维法利国际电影节最佳男演员奖。

1992年，米哈尔科夫成为俄罗斯文化基金会主席团成员。

1993年，被推选为该基金会总裁。

1993年，执导纪录片《回忆契诃夫》；同年，执导纪录片《安娜成长篇》，米哈尔科夫拍摄的大女儿安娜·米哈尔科娃从6岁到18岁成长经历，时间跨度达十二年，影片获得突尼斯儿童电影节金奖，该片在记录安娜成长过程的同时，穿插了大量时政纪录片片段，展现了这十三年间苏联、俄罗斯政治风云的变幻，通过女儿的成长表现历史对个人的影响。

1995年，成为全世界俄罗斯大教堂的主席团成员；同年，莫斯科及全俄大牧首（总主教）阿列克西授予米哈尔科夫俄罗斯东正教最高奖-谢尔盖·拉多涅日斯基一级奖章；之后，成为联合国教科文组织俄联邦委员会成员；同年，莫斯科大学校长维克托·萨多夫尼奇给米哈尔科夫颁发了莫斯科大学奖章。

1995年，自编自导自演剧情电影《烈日灼人》，影片以三十年代斯大林专政时期为背景，描写了红军英雄克托夫遭到诬陷迫害的事件，该片获得第47届戛纳国际电影节主竞赛单元-评审团大奖、第67届奥斯卡最佳外语片奖；同年，担任柏林影展的评审团主席。

1998年，米哈尔科夫被推选为俄联邦电影协会主席；在担任俄联邦电影协会主席期间，米哈尔科夫成立了专门向美国奥斯卡推选影片的俄罗斯“奥斯卡”委员会，创办了俄罗斯电影艺术科学院，设立了俄罗斯电影“金鹰奖”，并加入欧洲艺术科学院；同年，执导由朱莉娅·奥蒙德、欧列格·米契柯夫、理查德·哈里斯联合主演的爱情喜剧电影《西伯利亚理发师》，该片讲述了一个俄国男人和一个美国女人在两种不同的文化背景下所发生了一段悲剧的感情故事。

2004年，米哈尔科夫获得意大利国家授予的大十字骑士奖章及奖金。2005年，第三次连任俄联邦电影协会主席；11月23日，获得俄罗斯最高社会奖——亚历山大·涅夫斯基“劳动和祖国”勋章；同年，担任第58届戛纳电影节电影节短片竞赛单元和电影基金会单元的评委会主席。

2007年，自编自导自演悬疑电影《十二怒汉》，该片入围第64届威尼斯电影节竞赛单元、第80届奥斯卡金像奖最佳外语片奖；同年，获得第64届威尼斯国际电影节特别金狮奖。

2008年10月26日，米哈尔科夫获得第21届东京国际电影节黑泽明终身成就奖。

2010年，获得第45届卡罗维发利国际电影节世界电影贡献奖。

2010年，自编自导自演战争电影《烈日灼人2：逃难》，该片是《烈日灼人》系列的第二部，入围第63届戛纳国际电影节主竞赛单元；同年，获得第45届卡罗维发利国际电影节世界电影贡献奖。

2011年，执导电影《烈日灼人2：碉堡要塞》。

2013年，担任传记运动电影《传奇17号》的制作人；同年，担任第3届北京国际电影节的评委会主席。

2014年，自编自导剧情电影《中暑》，该片入围第18届上海国际电影节主竞赛单元。

2015年，与董亚春联合执导战争电影《战火中的芭蕾》，影片讲述了一段1945年发生在东北边陲小镇上的东北抗联部队带领老百姓与苏联红军同仇敌忾共同抗日的故事。

2015年，获得第46届印度国际电影节终身成就奖。

2016年，担任制作人的动作冒险电影《火海凌云》上映。

2017年，担任运动题材电影《绝杀慕尼黑》的制作人，该片由弗拉基米尔·马什科夫、约翰·萨维奇共同主演。

2018年，担任运动题材电影《最后一球》的制作人，该片由丹尼拉·科兹洛夫斯基执导。

尼基塔·米哈尔科夫的父亲谢尔盖·弗拉基米罗维奇·米哈尔科夫是儿童文学作家，苏、俄国歌的词作者。外曾祖父苏里科夫是19世纪俄国的画家，外祖父尤特·冈恰洛夫斯基是后印象派画家，母亲娜塔丽亚·彼得罗芙娜·冈察洛夫斯卡娅也是作家、诗人，哥哥则是安德烈·康查洛夫斯基。

20世纪70年代，尼基塔·米哈尔科夫与女演员安娜斯塔西亚·维尔金斯卡娅结婚。1966年9月，安娜斯塔西亚·维尔金斯卡娅生下第一个儿子Stepan Mikhalkov。

第二任妻子达吉雅娜曾是名模特，他们有三个儿女，分别是Artem（1975年12月8日生） 、安娜·米哈尔科娃（1974年生）和Nadya（1986年9月27日生）。安娜·米哈尔科娃是纪录片《安娜成长篇》的主角，而Nadya在《烈日灼人》中出演小女儿。

对尼基塔·米哈尔科夫这样始终致力于民族电影事业的导演而言，名目繁多的荣誉奖励仅仅是实现自我梦想过程中的一种点缀。在他的作品中，观众不难看出米哈尔科夫心中澎湃的爱国主义激情以及那份对民族复兴的真切渴求。在他的身上，观众又看到了那种洋溢于他作品间的俄罗斯精神，那种令人敬畏的自信与执着（网易娱乐评）。

尼基塔·米哈尔科夫的影片题材广泛，风格多样，手法新颖，个性鲜明。纵观他的创作，既保持了高度的艺术性，又具有鲜明的个性特征。他的影片从西部片到情节剧，从改编片到室内剧，从内蒙古的大草原到西伯利亚的茫茫雪原显示了作者在样式技巧方面的成熟和多样，而在主题上从对人文精神的探索到对自然景物的哲学思考，从对社会问题的揭示到对斯大林时期的批判，还有对东、西方文化及古代与现代的比较都说明导演对艺术的深刻理解和对人文精神的推崇（搜狐娱乐评）。

（《中国艺术研究院》评）。

2022年12月16日，电影导演尼基塔·米哈尔科夫被列入欧盟第九轮制裁名单。

当地时间2023年1月7日，乌克兰总统泽连斯基签署命令，对119名俄罗斯文化和体育界人士进行包括冻结资产和剥夺国家奖励等措施在内的制裁。其中包括著名导演尼基塔·米哈尔科夫等。