当然，女同性恋者之间亦有进行肛交者，但主要是个人喜好居多。女性由于没有男性生殖器，所以女同性恋者之间进行肛交者，需要借助橡胶质棒状物方能进行。

男男性行为者（men who have sex with men，MSM），MSM是中国HIV感染的高风险人群。无保护肛交（Unprotected anal intercourse, UAI）是MSM感染HIV的主要危险因素。元分析显示MSM中的无保护肛交发生率为43%。MSM伴侣内的发生率高达84%，而伴侣以外的无保护肛交也高达66%。研究发现，MSM社交网络中的个体对MSM性向支持反而会让MSM发生无保护肛交的概率增大，这种结果可能源于MSM在日常社交网络更愿意和支持自己性向的MSM交往。同一性网络的成员，更易分享彼此的价值观，讨论性伴类型、性行为等喜好话题，而同伴中关于安全套的使用的态度和规范影响着他们的性行为。

国内外研究表明，MSM首次肛交年龄（Age at first anal intercourse, AFAI）呈明显下降趋势。对国内7个大城市4491名MSM进行调查发现，MSM首次肛交中位年龄由1940－1959年出生组的（53~72岁年龄组）的33岁下降到1990－1996年出生组（16~23岁年龄组）的18岁。MSM首次性行为情况对其未来性行为模式影响较大。年龄较小的MSM在同性性行为中通常喜欢年龄更大的性伴，而年龄较小的MSM在与大年龄MSM性行为中常扮演被插入的性角色。因此，在成年前发生首次肛交的MSM很可能会在性角色定位上认为自己是被插入方，或在后续的性行为中更喜欢被插入的性角色，更可能在未来生活中发生高危性行为，如群交及无套内射。首次性行为时使用安全套的学生MSM更可能在最近一次肛交性行为中使用安全套。

MSM中有很大一部分人是具有双性性行为者，他们既与男性又与女性发生过性行为，既有与女性的商业性行为，也有与配偶或女性同居者间的性行为。既与男性又与女性发生性行为，可能导致 HIV 在高危人群中与一般人群之间建立了传播的桥梁。

有研究报告17%的被调查男大学生和15%的女大学生曾有过同性性行为，中国男同性恋者性行为以口交为主，肛交所占比例一般不超过50%。

肛交是最容易传播艾滋病的行为。艾滋病病毒携带者不仅血液携带病毒，精液中也携带病毒，具有很强的传染性。男男性行为通常采用肛交，而肛肠的黏膜薄而娇嫩，其下有丰富的毛细血管，发生性行为时极易引起破损出血，使病原体从肛门或直肠的破损处侵入，直接进入血液。

跨性别女性（Transgender women, TGW），TGW指出生时生理性别为男性，性别认同为女性，由男性转变为女性的跨性别者。TGW中无安全套肛交（CAI）的频率高于其他性少数群体和一般人群。对中国两个省份的一项研究发现，81.5%的TGW称并不总是与稳定的伴侣一起使用安全套，70.9%的人不与临时伴侣一起使用安全套。TGW是最易感染 HIV的人群之一，中国TGW自报HIV阳性率高且不断上升。

研究发现，超过一半（54.8%）的参与者报告有心理或身体虐待的经历，大量研究证实了暴力受害与无安全套肛交之间强烈的关联，但其中的潜在机制仍不清楚。从现有的定性研究推测了两种可能的机制。研究者推测，这种关联可能归因于 TGW希望与伙伴建立稳定关系的信任和亲密关系。鉴于不断遭受的基于性别的歧视，许多TGW认为通过稳定的伴侣获得保护至关重要，这将增强 TGW对其稳定伴侣的信任，并降低他们与稳定的伴侣发生性关系时使用安全套的愿望。并且，在经历了暴力之后，安全套使用的谈判更加困难。抑郁在暴力受害与无安全套肛交之间的关系中也具有完全中介作用。

肛交的风险比阴道性交高出很多倍，最大的问题是容易感染疾病，主要原因是直肠很容易吸收液体，以及肛交时容易给肛门的结构造成伤口。如果一方患有性病，例如感染了艾滋病病毒(HIV)、变形虫(阿米巴)、衣原体等，就很容易通过没有保护措施的肛交传染。即使戴上了安全套，肛交过程中也很容易破裂或者脱落而造成危险。肛交还可传染梅毒、尖锐湿疣、软下疳等。肛交特别容易感染人乳头瘤病毒(HPV)，研究发现这种病毒与肛管癌有关，尽管肛交并不直接导致癌症。美国弗莱德哈钦森癌症研究中心研究发现，反复进行肛交的人肛管癌发生率增加7倍。美国疾控中心曾有研究分析指出，经常进行肛交的人群罹患肛癌的概率比其他人群的要高。肛门癌甚至被认为是继艾滋病毒后，同性恋和双性恋的下一个危机。直肠息肉若长期频繁的接受到异物刺激，就有可能会生癌变，及时发现和治疗就显得尤为重要。

阴道是由上皮组织构成的，肛门与之相比就脆弱得多，肛交中阴茎强行插入容易造成肛门直肠黏膜破损。肛门在解剖特点具有两种上皮组织：在肛管皮肤与直肠粘膜相连合处的齿状线以下为多层鳞状上皮，具有皮肤良好的耐磨性以及伸展性，这部分由体神经支配，痛觉比较敏感；齿状线以上为单层柱状上皮，摩擦容易损伤，这部分由内脏神经支配，痛觉不敏感，受伤后也不一定知道。肛交性直肠溃疡在同性恋者中十分常见。溃疡病灶多发生在距离肛门5厘米~7厘米的直肠后壁。溃疡比较深，常常会引起出血。直肠黏膜损伤后形成的溃疡迁延不愈，有时会变硬，容易被误认为直肠癌。治疗方法主要是终止肛交，如果合并感染还要进行抗菌药物治疗。肛门和直肠组织不像阴道那样可分泌液体，起到润滑作用。因此，如果没有使用润滑剂，肛交很容易撕裂肛门括约肌。有些人为了减轻肛门的敏感度，局部涂上酒精等药品，结果更容易发生损伤。肛交可加重痔疮的症状。痔疮是肛门纤维结缔组织出现肥大充血所致，严重的患者进行肛交可发生大出血。

肛门、直肠内有粪便，其中含有大量具有感染性的微生物，即使肛交前进行了灌肠，也往往洗不干净。这些微生物除了令肛交产生的伤口发生感染，还可导致“淫肠综合征”：肛交后手指、性器沾上粪导致细菌传播，污染食物、食具后令细菌进入人体消化道，再经过6~72小时的潜伏期后，患者发生严重的沙门氏菌等感染，可突然出现腹痛、腹泻、恶心、呕吐及发热症状，有的人还有头痛、肌肉痛、背痛，如果治疗不及时、不彻底，很容易转为慢性。他建议出现这些症状后，患者应停止肛交的习惯。如果进行完肛交后没有进行清洁，马上又进行阴道性交，还可把肛门的细菌带入阴道而造成感染。另外，双方都有可能感到疼痛，有时疼痛还相当剧烈。有调查发现，12%的男同性恋者认为肛交太痛而无法进行。造成疼痛的主要原因是肛门括约肌上布满痛觉神经末梢。

安全套的使用无疑会减少肛交过程中肛门的损伤。此外，安全套使用也可减少感染艾滋病（HIV）和性传播疾病（STD）的机会。来自两项大型HIV预防试验的数据表明，对于任何接受性或插入性肛交，安全套降低HIV发病率的有效性为70.5%。世界卫生组织对五项研究的元分析得出了类似的结论，即持续使用安全套可将HIV传播减少64%。

由于肛门的生理特性，使被动肛交过程较为痛苦且非常容易发生肛门损伤。肛交过程使用润滑剂则能较大程度减轻痛苦及最大程度减少摩擦造成的损伤。不同种类的润滑剂有不同的优缺点，油基润滑剂可能会通过降解乳胶而增加安全套破裂的可能性，而水基润滑剂则相对更为安全。

进行直肠冲洗能在一定程度上减少肛门伤害，也可保持清洁、避免尴尬、提高乐趣等。直肠冲洗最常用的冲洗溶液是水，冲洗设施则种类繁多，有淋浴喷头、软管、塑料瓶等。与高渗和低渗溶液相比，等渗直肠冲洗液效果类似但不良反应更少，其中聚乙二醇电解质溶液（增加肠道水分以刺激肠道运动的泻剂溶液）使用起来比其他溶液更为舒适，且不会导致组织损伤。但要注意的是，直肠冲洗可增加艾滋病或性传播疾病感染的风险。

被动肛交可导致肛门损伤和肛门括约肌松弛，甚至出现大便失禁的现象。将排便时长控制在3分钟内、在有便意时及时排便、每日进行提肛运动等均能有效防止或减缓肛门松弛，避免大便失禁的发生。

人类需要通过肛门排便以保持胃肠道功能正常，因此排便后清洁是保持肛门卫生的重要环节。国人最常使用的方式是使用卫生纸进行清洁，但使用卫生纸可能会造成肛周皮肤擦伤、粪便残留等，使用湿巾可以避免这些问题，但要注意湿巾中存在的化学物质可能会刺激肛周皮肤。此外，还可采用利用水清洗肛门并进行干燥的设备（如智能马桶盖），但其较为昂贵且使用受环境限制。因此，更适宜的方式建议使用不含刺激性物质的湿巾进行便后清洁，再用卫生纸擦干，这更方便、实用和有效。

直肠杀微生物剂使用是一种对HIV感染进行预防的方法。直肠杀微生物剂通常与直肠冲洗及润滑剂同时使用。

HPV疫苗现已作为预防HPV感染最有效的生物学方法被广泛推广。中国国内可接种2价、4价、9价的HPV疫苗，但接种人群主要为女性。研究表明，中国MSM肛门HPV感染率高于50%，且感染率随着年龄的增长而增加。接种疫苗能显著降低MSM肛门HPV感染率，且接种年龄越小效果越好。

21世纪以来，中国已经进入“性化”的时代，但大众传媒与公众舆论往往只能讨论人们在性关系方面的变化，却不被允许揭示人们在性技巧方面的急剧发展。调查显示，男人、年轻的、受教育程度更高的、居住在在城市的、收入更高的、未婚同居的、离家外出时间更长的、参加社会交往更多的、非常健康的那些中国人，性技巧的得分越高，简言之，社会地位相对更高的那些人，性技巧也就更加丰富。无论男女，性技巧的得分越高，双方互爱的程度也就越高。性技巧更加丰富，并不是什么羞于启齿的下作之事。当今中国人的生活实践证明，性技巧是性生活和性关系更加美好的重要推动力。