胚胎移植通常在门诊进行，无须麻醉，对精神紧张者可予轻度镇静药。患者通常取妇科检查体位一截石位。医生用窥具暴露宫颈，用一接有注射器的细长的消毒后的转移管吸人含有一个或更多的受精卵的培养液，然后将转移管轻轻地置入子宫腔并将含有受精卵的培养药置于此。

一次可移植一个或更多的胚胎。通常情况下未移植的胚胎可冷藏以备下次融化后再行胚胎移植，当然医生事先应与病人讲明，整个移植过程需10～20分钟，移植完后患者最好卧床1小时左右。