自贡龙的完模标本（编号CV 00261）包括一根部份下颚骨、上颚骨及基枕骨。其他来自于身体各部份的其他骨骼，同样被编入自贡龙属中。侯连海等人认为它很像峨嵋龙，但在脊骨上有所分别。早期的解释指它是属于腕龙科。

于1980年代，中国的蜥脚下目分类出现了很多曲折的情况。1983年，董枝明、张奕宏及周世武从与斧溪自贡龙（Z. fuxiensis）的不同骨骸命名了斧溪峨嵋龙（Omeisaurus fuxiensis），但后来却指它们是同一动物。其后，自贡龙被认为是属于峨嵋龙，或可能是荣县峨嵋龙（O. junghsiensis）的异名。于1990年代中期，学者们改将自贡龙归类于马门溪龙。他们指出自贡龙的化石是来自在峨嵋龙与马门溪龙之间的地层，但与马门溪龙最为相似。而且两者的脊骨神经棘都有轻微的分叉，这个特点却在峨嵋龙中看不到。于是他们将自贡龙重新命名为斧溪马门溪龙。（Mamenchisaurus fuxiensis）。这个主张在很多有关蜥脚下目的文献获得赞同，但仍有一些学者指出自贡龙是独立的属。