更新时间：2024-11-06 17:05
苏州东吴足球俱乐部前身是2008年成立的苏州锦富新材足球俱乐部，2015年更名苏州工业园区东吴足球俱乐部，11月7日正式成立苏州东吴足球俱乐部。2012年首次获得中国足球协会业余联赛总决赛冠军，2015年再次获得中国足球协会业余联赛总决赛冠军，并晋级中国足球协会乙级联赛；2020年递补参加中国足球协会甲级联赛。
2008年5月29日，前江苏舜天足球俱乐部球员李毅等人发起成立苏州锦富新材足球俱乐部。最初是在苏州飞之翔体育文化传播有限公司的协助下成立，球员主要由公司部分员工和苏州地区部分优秀的业余球员构成，目的只是为丰富锦富新材料股份有限公司员工业余生活和促进企业文化，但是随着球队实力不断增强，球队逐渐成为苏州业余足球的一张名片。
2008-2011年，俱乐部多次代表苏州参加加油中国冠军联赛，先后获得2009年加油中国冠军联赛全国总决赛冠军、2010年加油中国冠军联赛全国总决赛亚军。
2012年，以河海大学为班底的苏州锦富新材足球队代表江苏参加中国足球协会业余联赛并获得全国总决赛冠军，从而获得2013年中国足协杯正赛的资格，但是在首轮即被中乙球队大理锐龙队淘汰出局。
2014年，苏州锦富足球俱乐部第二次参加中国足协杯正赛，先后淘汰了中业冠军大连台安老哥们队、中甲球队北京八喜队、中超球队辽宁宏运队进入到第4轮，在1比2遭中超球队上海申鑫队逆转后止步16强。
2015年，苏州锦富足球俱乐部再次参加足协杯正赛，但在第二轮点球被该年度中甲联赛冠军延边长白山足球俱乐部淘汰出局，俱乐部凭此再次获得“业余球队进步奖”。同年，俱乐部更名苏州工业园区东吴足球俱乐部，11月7日苏州东吴足球俱乐部正式成立，并于12月7日完成注册，先后获得中国足球协会业余联赛苏州赛区冠军、江苏省业余足球联赛冠军、中国足球协会业余联赛冠军，从而晋级2016年中国足球协会乙级联赛。
2016年12月21日，创始人汪俊将俱乐部的99%股份转让予上海睿颍管理咨询有限公司。
2017年，苏州东吴足球俱乐部凭借主场11胜2平4负超五成的胜率，获得了中国足球协会乙级联赛南区第六名，总第11名。在中国足协杯赛场上，俱乐部接连淘汰四川安纳普尔那队、梅州客家d队、延边富德队再次闯入第4轮。但在跟上海上港队的16进8比赛中，在先进一球的情况下，由对方武磊在补时阶段扳平比分，最后经过17轮点球大战以14比15（总比分15比16）被上海上港队淘汰。在资格赛两回合击败上海申梵队后，苏州东吴队打进了在天津市举行的第十三届全运会男子足球城市组决赛阶段，最终获得第6名。
2019年，中乙联赛有三个直接升级的名额，且南北区的第1名将直接升入中甲联赛。在南区预赛当中，平均年龄直降5岁的苏州东吴队一路高歌猛进，先是拿下了半程冠军，然后将榜首优势一直保持，不过在第29轮客场不敌赛前落后三分的成都兴城队的比赛中，成都兴城队凭借胜负关系优势反超登顶。预赛最后一轮，苏州东吴队与成都兴城队双双获胜，苏州东吴队和成都兴城队同积67分，因胜负关系屈居南区第二，失去了直接冲甲的第一次机会；在随后的排位赛中，苏州东吴队和泰州远大队相遇，两回合都和对手战平，最终在点球大战中落败，仅获第四名，失去了第二次直接冲甲的机；而在最后的升降级附加赛中，苏州东吴不敌辽宁宏运队，再次与升甲机会擦肩而过。
2020年，由于多支俱乐部退出，苏州东吴足球俱乐部得以递补参加中国足球协会甲级联赛。在中甲联赛第一阶段，苏州东吴队落位A组成都赛区，最终取得2胜1平7负排名成都赛区第5名。在第二阶段保级2组常州赛区，苏州东吴队取得2胜2平1负，获得赛区第1名，最终在中甲联赛第一个赛季获得总排名第8名。
2021年中甲联赛，以“全华班”出战的苏州东吴队高开低走，他们开局一度4战3胜，但随后他们陷入了连续不胜的怪圈，直到第13轮才再次获得胜利，联赛半程仅取得5胜7平5负积22分，排名第11位。联赛后半程，苏州东吴队依然低迷，最终以7胜11平16负积32分的成绩，获得中甲联赛第13名。
2022年，中甲联赛第一阶段，苏州东吴队只获得2胜1平5负的成绩，排名第15位，和降级区球队同积7分；第二阶段开始，俱乐部管理层和教练组大换血，由原江苏舜天足球队队长陆博飞出任主教练，球队有了脱胎换骨的变化，一批“全华班”凭借敢打敢拼的态度，带领俱乐部最终取得中甲联赛第6名。
2023年中甲联赛，苏州东吴队依然没有使用外援，采用“全华班”。苏州东吴队在开始阶段保持了一个很好的势头，但在第11轮对阵济南兴洲队、第12轮对阵青岛西海岸队连续两轮遭遇严重误判后，极大的影响了球队的士气。苏州东吴队自从第13轮客场3比2击败江西庐山队之后，七轮比赛只收获了3平4负的战绩，这段时间的战绩不佳促使陆博飞辞去了主教练职务。在这种情况下，俱乐部迅速聘用牛洪利出任苏州东吴队主教练，尽管他带队前3轮战绩为1平2负，但关键的第24轮，苏州东吴队2比1逆转击败丹东腾跃队，将积分提升到了27分；而第26轮客场0比0逼平济南兴洲队，这1分让苏州东吴队得以提前三轮保级成功。最终，苏州东吴队6胜10平14负积28分，排名中甲联赛第14位。
2024年5月，在中国足协杯赛场上，俱乐部在第3轮2比1击败青岛中青英联，晋级第4轮。