1988年12月至1993年12月，担任四川省第二届科技顾问团科技顾问。

1992年4月至1993年4月，担任四川农业大学农学系主任 。

1993年4月至1996年3月，担任四川农业大学农学院院长、教授。

1994年起，荣廷昭几次通过返回式卫星搭载育种材料，从中选育出新的单基因控制细胞核雄性不育新材料、早熟矮杆新材料和优良自交系A318。

1996年3月，担任四川农业大学玉米研究所所长、教授。

2002年，参加《加入WTO和中国科技与可持续发展——挑战与机遇、责任和对策》会议，发表论文《新世纪初发展我国玉米遗传育种科学技术的思考》。

2003年，当选为中国工程院院士。

据2020年2月四川农业大学玉米研究所显示，荣廷昭对玉米数量性状遗传及育种方法进行了较系统深入的研究。设计并成功实施了自交系、杂交种选育与群体遗传组成研究、群体改良同步进行的育种新方法，提出了中国西南地区玉米育种利用热带种质的新途径，结合西南实际对传统育种方法进行了改良，多途径培育出雄性不育等育种新材料，筛选到了中国西南玉米转基因工程育种急需的优良受体自交系并成功利用。选育了集高配合力、高产、高抗多种病害于一体的玉米自交系30余个和经过国家或省级审定的杂交种40余个，累计推广近亿亩，新增玉米40多亿公斤。此外，为解决在中国南方发展草食性畜牧业所面临的饲料短缺矛盾，还培育创制出能提高与近缘属种远缘杂交结实率的新材料068，进而组配出生长繁茂，抗逆能力强，有的还具有多年生性能并具保持水土功能的新型饲草玉米品种，取得了显著的经济、社会和生态效益。

据2020年2月四川农业大学玉米研究所显示，荣廷昭先后承担了科技部、农业部、教育部、四川省和国际合作等重大科研项目30余项。

据2020年2月四川农业大学玉米研究所显示，荣廷昭作为第一获奖人获国家技术发明二等奖2项、省科技进步一等奖2项、二等奖3项，作为第二获奖人获省科技进步特等奖、一等奖各1项。

据2020年2月四川农业大学玉米研究所显示，荣廷昭在《中国农业科学》《作物学报》《CropScience》《TAG》《PNAS》等中国国内外学术刊物上发表论文60余篇。

据2020年2月四川农业大学玉米研究所显示，荣廷昭出版专著3部。

荣廷昭.2001年. 田间试验与统计分析[M]. 成都:四川科学技术出版社.

荣廷昭.2003年. 西南生态区玉米育种[M]. 北京:中国农业出版社.

荣廷昭.2003年.数量遗传学[M]. 北京:中国科学技术出版社.

荣廷昭认为，未来是年轻人的。他十分注重对年轻人的培养和对团队发展的考虑。在平等、自由、宽容、竞争的团队文化下，玉米研究所涌现出许许多多的优秀人才，这与荣廷昭倡导的“大力支撑、培养年轻人”的团队文化息息相关。

荣廷昭格外重视团队建设和后备人才培养，对年轻研究者充满期望，“做研究是辛苦的事情，需要年轻一代坚持再坚持。”

据2020年2月四川农业大学玉米研究所显示，荣廷昭作为学科主要带头人，在学校国家重点学科作物遗传育种学的建设中发挥了重要作用，出版教材3部，已培养硕、博士50余名。

荣廷昭于1995年1月担任四川省作物学会副理事长，1997年1月至2002年9月担任中国农学会理事；曾担任成都科学研究院院长，四川省科技顾问团院士组副组长、四川省作物育种攻关专家咨询组组长、四川省作物学会荣誉会长。

一刻立志，数十载奔波，他（荣廷昭）用默默奉献的精神，在玉米遗传育种学研究上，用一个个成果回报着祖国。（新华网评）

作为资深农业研究者，荣廷昭身上有一股执着劲儿。（《四川日报》评）

除了在科研上取得巨大成果，荣廷昭一生情系三农，一切为了农民和农业着想。为了农业的发展和农民的致富，他坚持不懈地努力着。（《中国教育报》评）

荣廷昭是玉米行业奠基者，更是引领者。他高屋建瓴，抢占科学研究的制高点进行战略布局，以极具发展性的视野以及突破性的科研成果推动着行业发展。（《南方农村报》评）

荣廷昭用自己的汗水为农民播种了希望，用自己的心血去浇灌农民的庄稼。这就是荣廷昭，一个真正的共产党员，一个心系农民的科学家，一个用心血和汗水为农民播种希望的科学家。（《科技文萃》周刊评）