腓力三世在即位之后立刻请求他的叔叔查理一世与穆斯林的领袖谈判，以期结束这次东征，而他本人却返回了法国。结果十字军与穆斯林签署了一份10年休战协议。1271年8月12日，腓力三世正式加冕为法国国王。不久腓力的另一个叔叔图卢兹伯爵阿方斯去世，由于他没有子嗣，腓力兼并了他的大部分领地。这些新获领地使王室的力量大为扩充。

1284年，腓力三世在教皇的劝诱下（教皇承诺如法国进攻阿拉贡就把阿拉贡王位赠给腓力的儿子瓦卢瓦的查理）率领大军进入鲁西永，企图从阿拉贡王室（他们受到教皇的敌视）手中夺取这个地区。这次战争有时被称为“反阿拉贡十字军”，一些历史学家称其为“卡佩王朝进行过的最非正义，最不必要和最灾难性的军事冒险”。腓力三世开始时取得不小的进展；但法军之中突然爆发了一场痢疾，而在那个时代这种病是极其危险的。腓力本人也染上了疾病。法军被迫撤退，在途中被阿拉贡军堵截，遭到惨败。腓力三世本人没能返回领地就在他的盟友、马略卡国王海梅二世位于佩皮尼昂的宫廷里去世了。他的儿子腓力四世继承了王位。