1998年，与凯文·史派西共同主演动作电影《王牌对王牌》，在片中饰演出色的谈判专家丹尼·罗曼；同年，出演由弗朗索瓦·吉拉德执导的爱情悬疑电影《红色小提琴》。1999年，由其参演的科幻冒险电影《星球大战前传1：幽灵的威胁》上映；同年，与萨弗蓉·布罗斯、托马斯·简联合出演科幻惊悚电影《深海狂鲨》。

2000年，与克里斯蒂安·贝尔共同主演动作电影《杀戮战警》，在片中饰演纽约警察局酷劲十足且下手精准的出色警探约翰·沙夫特；同年，获得法国杜维尔电影节终生成就奖；同年，与汤米·李·琼斯共同主演动作惊悚电影《交战规则》。2001年，与布鲁斯·威利斯联袂主演悬疑科幻电影《不死劫》，在片中饰演商店的主人伊利亚；同年，在剧情电影《迷离感应》中担任主演和执行制片人；12月，与艾米莉·莫迪默搭档主演的动作电影《51号公式》上映。

2002年，与本·阿弗莱克共同主演惊悚电影《变线人生》，在片中饰演保险经纪人多伊尔·吉普森；5月，由其参演的电影《星球大战前传2：克隆人的进攻》上映；6月，与米拉·乔沃维奇合作主演的动作犯罪电影《追风战警》上映，他在片中饰演意外撞见一帮作暗中抢匪而被当成人质的警察杰克；8月，与范·迪塞尔、艾莎·阿基多联合出演的动作冒险电影《极限特工》上映。

2003年，与约翰·特拉沃尔塔合作主演的犯罪电影《基地疑云》上映，他在片中饰演总是对黑人士兵派克很严厉的军士长韦斯特。2004年，由其出演的电影《杀死比尔2》上映；2月27日，与艾什莉·贾德、安迪·加西亚联袂主演的悬疑惊悚电影《熄灯追杀令》上映；同年，参与配音的动画电影《超人总动员》上映，他凭借该片提名第32届安妮奖最佳动画电影配音。

2005年，与罗伯·布朗、罗伯特·理查德联袂主演的篮球励志电影《卡特教练》上映，在片中饰演在一所黑人社区的里士满高中任教的肯·卡特教练；同年，由其参演的电影《极限特工2》上映；5月，由其出演的电影《星球大战前传3：西斯的复仇》上映。

2006年2月，在好莱坞中国剧院前的星光大道上留下了自己的手印和脚印，“塞缪尔·杰克逊之星”位于好莱坞罗斯福饭店附近，是星光大道上出现的第2159颗星；同月，与朱丽安·摩尔、威廉·弗西斯联袂主演的悬疑惊悚电影《自由地带》上映，他在片中饰演经验丰富的黑人老警探劳伦佐·康塞尔；9月，与克里斯蒂娜·里奇共同主演的剧情电影《黑蛇呻吟》上映；12月，与杰西卡·贝尔合作主演的动作战争电影《星条旗永不落》上映，他在片中饰演伊拉克战场上的军医队队长威尔。

2007年，与约翰·库萨克、玛丽·麦克科马克联合主演的惊悚悬疑电影《1408幻影凶间》上映，他在片中饰演海豚酒店经理杰拉尔德·奥林；1月，与艾德·哈里斯、伊娃·门德斯等联合主演的惊悚犯罪电影《凶案清理员》上映，他在片中饰演在血案发生后帮助被害人家属料理后事的退休警察汤姆；8月24日，与乔什·哈奈特、凯瑟琳·莫里斯等共同主演的运动电影《重整旗鼓》上映，他在片中饰演曾经是拳击赛场上最有前途的天才拳击手鲍勃·萨特菲尔德。

2008年，由其出演的剧情电影《福音小镇》上映；2月14日，与海登·克里斯滕森共同主演的科幻动作电影《心灵传输者》上映，他在片中饰演神秘的组织“游侠”的成员罗兰；5月2日，与小罗伯特·唐尼、格温妮斯·帕特洛等联合出演的科幻动作电影《钢铁侠》上映；9月19日，与帕特里克·威尔森合作主演的惊悚悬疑电影《合法入侵》上映，他在片中饰演严厉古板、不苟言笑的黑人警官阿贝尔·特纳；11月7日，与伯尼·麦克、莎朗·莉尔联袂主演的音乐喜剧电影《灵魂歌手》上映，他在片中饰演曾是红极一时的歌唱表演者路易斯；12月25日，与加布里埃尔·马赫特共同主演的奇幻电影《闪灵侠》上映，他在片中饰演中央城的犯罪集团头目“章鱼。

2009年，与娜奥米·沃茨、安妮特·贝宁联袂主演剧情电影《母与子》。2010年，由其出演的电影《钢铁侠2》上映；6月15日，与迈克尔·辛共同主演的惊悚电影《战略特勤组》上映；8月6日，与威尔·法瑞尔、马克·沃尔伯格联合主演的动作喜剧电影《二线警探》上映，他在片中饰演纽约警局的超级警察海史密斯。

2011年，与汤米·李·琼斯合作主演的剧情电影《日落号列车》上映；同年，由其出演的科幻动作电影《美国队长》上映；10月，与凯南·鲁兹、金大贤联合主演的动作惊悚电影《竞技场》上映；此外，还在纪录片《重返侏罗纪公园》中出镜。

2012年，与莱丝莉·比伯、卢克·威尔逊联袂主演悬疑犯罪电影《遇见恶魔》；同年，由其出演的科幻动作电影《复仇者联盟》上映；5月，与卢克·柯比合作主演的惊悚电影《撒玛利亚人》上映；12月，与杰米·福克斯、莱昂纳多·迪卡普里奥联合主演的动作西部电影《被解救的姜戈》上映，他在片中饰演糖果庄园黑奴管家史蒂芬。

2013年，与奥尼·托姆米拉、雷·史蒂文森联袂主演动作冒险电影《冰峰游戏》，在片中饰演美国总统；9月，由其出演的科幻动作剧《神盾局特工第一季》首播。2014年1月，与海莉·斯坦菲尔德、托马斯·曼联合出演动作喜剧电影《刺客学妹》；同年，与多米尼克·库珀合作主演的惊悚犯罪电影《合理怀疑》上映；2月，与乔尔·金纳曼、加里·奥德曼等联合参演的科幻动作电影《机械战警》上映；4月4日，由其出演的电影《美国队长2：冬日战士》上映；8月，与英迪娅·埃斯利等共同主演的动作电影《风筝》上映，该片改编自日本梅津泰臣1998年的同名动漫作品。

2015年，与科林·费尔斯共同主演动作喜剧电影《王牌特工：特工学院》，在片中饰演思想偏差的科技天才瓦伦丁，他凭借该片提名第25届MTV电影奖最佳反派；4月30日，与海莉·斯坦菲尔德、托马斯·曼联袂出演的动作喜剧电影《刺客学妹》上映；5月1日，由其出演的电影《复仇者联盟2：奥创纪元》上映；12月，与库尔特·拉塞尔、迈克尔·马德森联袂主演的西部动作电影《八恶人》上映，他在片中饰演聪明，精于算计，无所畏惧的联邦战士马奎斯·沃伦；12月4日，与尼克·卡农、泰娜·帕丽斯联袂出演的剧情电影《芝拉克》上映。

2016年，与约翰·库萨克合作主演惊悚电影《夺命来电》，在片中饰演勇敢而聪明的地铁司机汤姆；7月1日，与亚历山大·斯卡斯加德共同主演的动作冒险电影《泰山归来：险战丛林》上映，他在片中饰演前雇佣兵，讲义气的乔治·华盛顿·威廉姆斯；12月，与阿沙·巴特菲尔德、伊娃·格林等联袂主演奇幻冒险电影《佩小姐的奇幻城堡》，在片中饰演拥有永生能力的科学家巴伦。

2017年，与瑞安·雷诺兹共同主演动作喜剧电影《王牌保镖》，在片中饰演由重兵护送前往国际法庭作证的职业杀手大流士·金凯德；1月20日，由其出演的动作电影《极限特工：终极回归》上映；3月10日，与汤姆·希德勒斯顿共同主演的动作冒险电影《金刚：骷髅岛》上映，他在片中饰演为人勇敢的美军指挥官帕卡德上校；9月，与布丽·拉尔森搭档主演的喜剧电影《独角兽商店》上映。

2018年，与汤姆·赫兰德、杰克·吉伦哈尔联合主演科幻电影《蜘蛛侠：英雄远征》，在片中饰演前神盾局局长；5月，由其出演的电影《复仇者联盟3：无限战争》上映；6月，与格雷格·T·尼尔森、霍利·亨特共同参与配音的冒险动画电影《超人总动员2》上映；9月，与奥利维亚·库克、奥斯卡·伊萨克联合出演的爱情电影《一生》上映。

2019年1月18日，与詹姆斯·麦卡沃伊、布鲁斯·威利斯联袂主演的悬疑电影《玻璃先生》上映，他在片中饰演犯罪团伙的主脑普莱斯；3月8日，由其出演的电影《惊奇队长》上映；4月26日，由其出演的电影《复仇者联盟4：终局之战》上映；6月14日，与杰西·厄舍、理查德·朗德特里联合主演的动作犯罪电影《夏福特》上映；6月16日，由其主演的电影《王牌保镖2》上映；6月28日，由其出演的电影《蜘蛛侠：英雄远征》上映；10月25日，与塞巴斯蒂安·斯坦、艾莉森·苏朵儿联合主演的战争电影《最后一搏》上映；12月，参与配音的科幻动作电影《星球大战9：天行者崛起》上映。

2020年，与李美琪、迈克尔·基顿联合主演动作惊悚电影《门徒》；6月10日，由其参演的电视剧《舞台剧第一季》首播；同年，与安东尼·麦凯、尼古拉斯·霍尔特联袂主演传记电影《银行家》，在片中饰演豁达幽默的黑人企业家乔·莫里斯。

2021年5月14日，与克里斯·洛克、马利索·妮可联合主演的恐怖电影《电锯惊魂9：漩涡》上映，他在片中饰演在警局备受尊敬的资深警官马库斯；6月，与瑞安·雷诺兹共同主演的动作犯罪电影《王牌保镖2》上映；7月，参演由马修·沃恩导演的谍战动作电影《Argylle》，该片根据同名谍战系列小说改编；8月11日，参与配音的动画片《假如…？第一季》首播；同年，在纪录片《修正案：为美国而战中》出镜。

2022年，与沃尔顿·戈金斯共同主演电视剧《托勒密·格雷最后的日子》；2024年5月24日，参与动画电影《加菲猫》上映，在片中为加菲猫的父亲维克配音。

2023年6月21日，主演的电视剧《秘密入侵》播出。5月，主演的动作惊悚片《毁坏》首爆剧照。9月，参演的间谍动作片《阿盖尔：神秘特工》首曝预告。

2024年2月2日，出演的间谍动作片《阿吉尔》全球院线上映；9月5日，参演的电视剧《战斗之夜：百万美元大盗》播出；11月8日，主演的电影《钢琴课》在北美选定影院上映。

塞缪尔·L·杰克逊和他在影片中常常口无遮拦言辞粗犷彪悍的形象相当接近，一副大大咧咧玩世不恭的样子（新浪娱乐评）。

塞缪尔·L·杰克逊的外形绝对不属于那种特别英俊的，他的脸甚至有点凶恶，和众多的黑人演员一样，他也是慢慢熬出来的。尽管塞缪尔·L·杰克逊属于大器晚成却一发而不可收拾，他凭借多方面的才华与那沉默中蕴含的智慧，成为一名杰出并受人尊敬的演员。在电影《丛林热》中，他有着出色的表现，塑造的盖特比较真实。而且， 他还有着细腻、真实的演出。在电影《低俗小说》中，他的表演令人击掌叫绝。在电影《杀戮时刻》中，他把绝望的父亲表现得入木三分（《电影》评）。