1979年，被任命为中山大学副校长。

1980年11月，当选为中国科学院生物学部委员（院士）。

1981年，担任广东省生态学会第一届理事会理事长。

1984年，被任命为中山大学顾问。

1989年，被选为国际有害动植物防治组织东南亚分部理事。

1991年，当选为广东省科学技术协会第四届名誉主席。

1997年12月31日0时45分，因病医治无效，在广州逝世，享年86岁。

早在20世纪50年代末，蒲蛰龙便开始研究和利用赤眼蜂防治甘蔗螟虫，在生产实践中广泛应用。他在总结以往用化学农药防治病虫利弊的基础上，着手开展以虫治虫的研究，并将以虫治虫推广到生产实际中去。他首先从事甘蔗防治甘蔗螟虫的研究，首次发现蓖麻蚕卵作为繁殖赤眼锋的优良寄主，使利用该蜂防治甘蔗螟得以大面积推广应用，被誉为“中国独创”。1956年，广东顺德建立了全国第一个赤眼蜂站，接着，全国10多个省份陆续大规模应用赤眼蜂防治多种害虫。这项研究与试验的成功，使蒲蛰龙成为中国将以虫治虫从实验室推广应用到大田生产中去的第一人。随后，蒲蛰龙的生物防治研究组先后完成利用澳洲瓢虫和孟氏隐唇瓢虫防治甲虫的科学实验工作。接着又解决了湘西黔阳地区柞蚕放养问题，成功地完成了利用平腹小蜂防治荔枝病害的科研项目。特别是1973年春在广东四会开始防治水稻病害虫的研究和试验工作的成功。他还加强利用微生物防治害虫的研究，查阅大量有关资料，带领年轻教师进行对苏云金杆菌、白僵菌、昆虫病毒、昆虫类立克次氏体及昆虫疾病的理论和应用技术的研究。为弄清昆虫病毒的超微结构，他长时间在电子显微镜下进行观察研究，并用昆虫病毒进行田间试验，这一研究，为昆虫病理学研究打下了基础。1979年以来，开展利用苏云金杆菌以色列变种防治幼虫的研究试验工作，肯定了利用这种杆菌来防治蚊子幼虫高效、经济、安全、不污染环境，完全可以代替化学杀虫剂。广东一些地区采用这一方法防治蚊虫，取得明显成绩。

根据2012年6月中山大学网站显示，蒲蛰龙先后在国内外学术刊物发表学术论文近200篇，专著6部。还参加《中国大百科全书》和《中国农业百科全书》有关昆虫方面的撰稿，还担任联合国粮农组织委任主编的《发展中国家的害虫生物防治方针》一书及撰写，专供发展中国家参考及研究，开展此项工作之用。与此同时，整理主编30余万字的《昆虫病理学》专著。

蒲蛰龙认为：“作为一个自然科学工作者，胸怀要豁达，意志要坚定，要扩大视野，重贤器才。”“科学实验一定要和生产实际紧密联系，如果在实验室里搞科研，得出成果不投入实际生产应用，那只是纸上谈兵。这不是我们科学工作者要走的路。”

蒲蛰龙于1962年创立中山大学昆虫生态研究室。1978创建中山大学昆虫学研究所。1995年建立生物防治国家重点实验室。他负责的昆虫学科也是我国首批博士点、博士后科研流动站和中国国内访问学者接受点，1987年被定为国家级重点学科。

蒲蛰龙是中国恢复招收研究生后的第一批博士生导师之一，他的许多弟子已成为教育、科技战线上的专家、教授。

蒲蛰龙于1964年起连续当选为全国人大代表（第二、三、四、五、六、七、八届全国人大代表），还担任国际有害动物、植物、生物防治组织东南亚分部理事，中国昆虫学会副理事长，中国生态学会、中国昆虫学会荣誉理事，第二、三届广东省科学技术协会主席，第四届广东省科学技术协会名誉主席；《昆虫学报》《动物分类学报》编委和《中国动物志》编委以及主编《昆虫天敌》杂志。

蒲蛰龙教授学识渊博，硕果累累。他的研究领域涉及到昆虫学的各个方面，他在害虫生物防治和综合防治方面的成就举世公认，被美国某杂志誉为“南中国生物防治之父”。蒲教授知识渊博，平易近人，既满腹经纶，又风度翩翩，无论走到哪里，都特别受人尊敬与爱戴。（中山大学校报评）

作为一名昆虫学家，蒲蛰龙没有埋首故纸堆、关起门来搞昆虫分类研究，却耗费了近一生的时间和精力到农村下稻田、果园搞起实地昆虫研究。作为一名教育工作者，他为中国国内早期的昆虫生态领域培养了一大批人才。（《南方日报》评）

蒲蛰龙严谨治学、谦虚谨慎的崇高风范堪称教育和科学工作者的楷模。他以虫治虫、以菌治虫、养鸭除虫等成果，更是调节人类与生态环境和谐发展的重大成就。（新华网评）

1998年12月31日，蒲蛰龙院士纪念室在马文辉堂举行揭牌仪式。

2009年11月，华南农业大学院士雕塑广场落成，南中国生物防治之父蒲蛰龙院士的雕像，永久“落户”华南农业大学。