嘉靖二十二年（1543），任右佥都御史、甘肃巡抚。鲁迷（今土耳其）贡使留甘州者九十余人，总兵官杨信使唤他们抵御敌军，死者十分之一。詹荣说：“彼以好来，而用之锋镝，失远人心，且示中国弱。”下诏罢免杨信的官职，收敛死者送归。番人感悦。一年多以后，大同巡抚赵锦与总兵官周尚文不和，下诏詹荣与赵锦对调。俺答数万骑入掠，詹荣与周尚文破之黑山阳，进右副都御史。敌军再次大举进犯中路铁裹门、鹁鸽峪，参将张凤等阵亡。詹荣与周尚文及总督翁万达严兵防御阳和，而派遣骑兵邀击，多所杀伤，敌军退去。代王府奉国将军朱充灼行劫，詹荣上奏夺其俸禄。朱充灼等勾结小王子入侵，进攻大同。詹荣让周尚文缉捕，朱充灼等皆服罪而死。詹荣以大同无险，乃筑东路边墙一百三十八里，堡七，墩台一百五十四。又以守边当积粟。而近边弘赐诸堡三十一所，延亘五百余里，辟治之皆膏腴之田，可数十万顷。于是上奏请求召军c从事耕种，复其租徭，移大同一年市马费市牛赋之；秋冬则聚而抵御敌军。明世宗马上采纳。敌军入侵，与周尚文破之弥陀山，斩一部长。