辛普森沙漠的波纹通常以沙丘的形式出现。这些沙丘沿着长长的垂直线起伏波动，贯穿整个沙漠表面。夏季的时候，来自澳大利亚北部的雨水偶尔也会流入辛普森沙漠，让干枯的河槽和枯竭的湖床重新焕发生机。

在极其偶然的情况下，雨水会流入一个名为“艾瑞尔湖”的巨大湖床，让这里变成一个浅显的内海，吸引成群的鸟类前来繁殖后代。辛普森沙漠因其红色的沙丘而出名，也被称为The Big Red。这片沙漠中的沙丘呈平行排列，均为南北走向，由于植物的作用，沙丘处于静态，并不移动。西面的沙丘只有三米来高，而东边的一般在30米高。