陈民藩构建“湿热论治、以通为用、内外并治、存体寡损、形神兼顾”的学术思想和临床模式；首创以化腐、生肌、镇痛结合的“枯痔疗法”；研制黄白胶囊、紫白膏获院内制剂批号。

在医学实践中，陈民藩提出并形成了“湿热论治、以通为用、内外并治、存体寡损、形神兼备”的肛肠病诊疗和康复思想，建立起“陈民藩中西医结合诊疗肛肠病模式”。

陈民藩教授主要学术思想有：1，注重地区、季节、体质变化，肛肠疾病病位属下焦，多为湿热下注而致；2，重视顾护“脾胃之气”；3，强调整体观念，内治外治并重，辨证辨病结合；4，强调理论联系实际重在创新，疗法应用有常有变；5，手术手法轻巧细致，重视非观血疗法、少损伤疗法的应用；6，肛肠疾病防治并重，预防为先；7，选方用药内外并重，内治法多从湿热论治。

据2023年9月福建省人民医院网站数据，陈民藩已发表专科论文70余篇，编写有《肛门科临床手册》《肛门常见病临床治疗》《陈民藩学术思想与临证经验》等专科专著4部。

陈民藩作为创始人之一创建了福建省中医肛肠学科，作为学术带头人的陈民藩带领的福建中医药大学附属人民医院肛肠科先后通过“福建省中医肛肠重点专科”““十一五’国家中医药管理局重点专科”、首批“国家临床重点专科建设项目”“国家中医药管理局中医肛肠病继续教育基地”等项目的评审。

陈民藩讲学、会诊的足迹已踏遍中国国内外及东南亚等地。截至2017年8月，已主持举办了全国及福建省肛肠病学科新技术学习班50多期。

陈民藩指导培养的学生有福建中医药大学附属人民医院主任医师石荣、蔡而玮，福建省人民医院主任医师梁瑞文等。

“陈民藩为中国肛肠学科的建设和发展做出较大贡献。”（福建省人民医院评）

“陈民藩是福建省中医肛肠学科重要创始人，从事中医肛肠学科医教研工作六十五年，功绩卓著，成果颇丰。”（《福建卫生报》评）

“陈民藩是中国肛肠学科领军人物，对中国中医外科技术的进步做出了重要贡献。”（福建省卫生健康委员会评）

“陈民藩用对中医的拳拳之情，用自己的魅力影响着一大批后辈，为中医发展默默奉献。 ”（福建省卫生健康委员会官方公众号“福建健康”评）