康熙十五年（1676年）进士，时人谓“才大如海，心细如发，其置身于台谏，卓荦一时。”曾任广西道监察御史，官至两淮都转盐运使司盐运使，康熙二十七年（1688年）被罢官。早年云游四海，来往于霍同洞天，遇方外至人，传以修养秘法，研习丹法要旨，康熙三十四年（1695年）与仇兆鳌有往来。著有《参同契脉望》、《悟真约注》，并修订元朝陈致虚的《金丹大要》、明朝彭纯一外丹书《承志录》、明朝陆西星的《玄肤论、金丹就正篇》，集作《道书五种》——即《参同契脉望》三卷、《悟真篇约注》三卷、《金丹大要》一卷、《金丹就正篇玄肤论》一卷、《承志录》三卷。晚年其事不详。

按其好友丹家仇兆鳌所言，陶素耜得孙教鵉一派嫡传，后来的西派李涵虚与之有极深的渊源，李所著《道窍谈》一书，多引其说。