隆安年间(397～401年)，改顿丘郡为顿丘县，治所在今安徽来安县东1公里处,隶秦郡。南北朝，刘宋移顿丘县治于新昌城(今安徽滁州市区)，为新昌郡治。梁大同二年(536年)立南谯州，顿丘县为州郡治所。天保三年(552年)入北齐，改顿丘为新昌县，仍为谯州治和新昌郡治。太建五年(573年)入陈，太建七年三月，移盱眙之北谯州镇于新昌城。太建十一年，入北周，复置顿丘县，仍为南谯州治和新昌郡治。隋开皇九年(589年)，废新昌郡，省高塘、乐钜入顿丘，改名新昌县。