更新时间：2024-05-18 18:38
祖籍山东蓬莱，先祖马英曾为辽东保义副将，因此占籍辽阳左卫。明朝天启元年（1621），努尔哈赤攻陷辽阳，马鸣佩被俘为奴。
十七岁时，补博士弟子员以文学受知皇太极，被拔出奴籍，召入直文馆。后金天聪三年（1629），授工部启心郎，仍直文馆。天聪六年（1632），与同官罗绣锦疏论输粮令。
清崇德元年（1636），甄别文馆诸臣，列二等，赐人户、牲畜。汉军旗制定，隶镶红旗。崇德八年（1643），考满，授云骑尉。
顺治元年（1644），清军入关，授山西冀南道。顺治二年（1645），鸣佩改任湖广湖南道。
顺治三年（1644），授户部侍郎衔，总督江南粮储兼理钱法。疏言钱法首禁私铸，犯必诛，并请设钱法道专其责；江南军饷不足，请留关税佐之：皆议行。
顺治八年（1649），入为户部侍郎。顺治十年（1651），改任总督仓场侍郎。
顺治十一年（1652）二月，命以兵部左侍郎兼右副都御史，擢宣大总督，劝垦宣府、大同荒地三千馀顷。盗发平阳，马鸣佩令副将许占魁等捕治，分兵扼隘，诛其渠张五等二百八十馀人，降其党九十馀。
郑成功为寇海上，陈其纶、汪龙等为明将，号为侯、伯，据郡县，遥相呼应郑成功。马鸣佩檄总兵胡有升等攻陈其纶于瑞金，破大柏山寨。陈其纶走宁都天心寨，寨民获以献。复获汪龙于九江，并击破郑成功部将胡宁等。
南明鲁王朱以海部将张名振聚船海上，屡犯崇明。马鸣佩参劾总兵王燝防剿无能，请黜罢。下部察议，部臣以海寇登岸焚掠，提督张天禄疏于防备失责，马鸣佩不据实入告，坐包庇罪，降二级留任。
张名振以舟师侵崇明，马鸣佩亦以舟师御之，张名振败走，得其副将林正礼等。复周历松江、崇明诸郡邑，视形势，疏陈水陆攻守之策。给事中张玉治言江宁（今江苏南京）提督当移驻苏州，吴淞宜增兵，顺治帝令马鸣佩覆议。马鸣佩请令江宁提督分兵守刘河、福山，苏松提督驻吴淞，不烦更增兵，但令与江宁提督互策守御为犄角。得旨，如所议。
十二月，张名振兵复侵崇明，以舟师断海港，官军莫能渡，马鸣佩密令民束草削柹，佐军焚敌舟，俘馘无算，张名振夜引去。顺治十三年（1654）正月，招降所置总兵顾忠，副将黄忠、董礼等百馀人。顾忠故剧盗，号“纲仓顾三”，善水战，至是降，南明军队士气越加受到打击。复率参将吴守祖等出海，至浙江独山破敌。分兵讨吉安、赣州盗曾拱震等，败之上坪。讨徽州盗，剿花桥诸寨。
闰五月，以目疾乞休，进三等阿达哈哈番。康熙五年（1666）正月，卒，赐予祭葬如例，祀江南名宦祠。马鸣佩墓志出土于北京玉泉山黑塔村（今海淀区黑塔村），民国年间辗转运往沈阳故宫，最后移交辽宁省博物馆收藏。
父：马与进（？~1621），曾任明朝辽阳训导。明朝天启元年（1621），努尔哈赤攻陷辽阳时被杀。
子：马雄镇（1633~1677），官至广西巡抚，卒赠兵部尚书、太子太傅，谥文毅。
孙：马世济（1650~1714），字符恺，历任大理少卿、光禄寺卿、刑部侍郎、兵部侍郎、吏部侍郎、贵州巡抚，官至漕运总督。
曾孙：马国桢（1666~1720 ），马世济之长子，官至江南江常镇道。
玄孙：马日炳，监生，历任文昌县知县、杭防同知，撰修《康熙文昌县志》。