2007年，与李翰滔、赵箭联合执导古装武侠剧《碧血剑》，该剧根据金庸的同名武侠小说改编。2008年，执导由陈浩民、何中华、吴毅将联合主演的动作电影《小李广花荣》；同年，执导由陈龙、陈德容等共同主演的剧情电影《碧瑶霜迷案》；11月3日，与李惠民合作执导的古装武侠剧《少林僧兵》在央视八套黄金时间播出。

2009年3月26日 ，执导的古装电影《雷横与朱仝》在中国大陆上映，该片由焦恩俊、萧蔷、吴樾联合主演，获得第9届百合奖一等奖影片。2010年，与陈亚洲、金鳌勋、黄伟明联合执导古装神话剧《聊斋三》，该剧由林文龙、邱泽、薛凯琪联袂主演；2月14日，执导的古装神话剧《浙版西游记》上星播出，该剧由陈司翰、费振翔、谢宁联袂主演。

2011年12月8日，执导的古装电影《双鞭呼延灼》在中国大陆上映，该片由钱小豪、冯淬帆合作主演；同年，执导由居文沛、修庆搭档主演的剧情电影《金毛犬段景柱》。

2012年1月23日，与蒲腾晋合作执导的古装剧《刁蛮俏御医》上星首播，该剧由张娜拉、TAE、高昊联袂主演；8月28日，与曹华合作执导的近代革命剧《东北往事之江湖儿女》在山东齐鲁频道首播，该剧由胡兵、陈紫函、郭珍霓联袂主演；同年，执导由何中华、梁小冰、蒋一铭联袂主演的古装动作电影《金枪手徐宁》；此外，还执导了由谭凯、梁家仁合作主演的动作电影《病尉迟孙立》，该片讲述了梁山好汉孙立在攻打祝家庄时发生的故事。

2013年10月27日，与周家文、胡国华联合执导的都市时尚剧《一克拉梦想》在深圳卫视黄金剧场首播，该剧由蒋梦婕、阚清子、姚元浩联袂主演。

2014年4月21日，执导的古装爱情剧《金玉良缘》在深圳卫视和江苏卫视首播，该剧由霍建华、唐嫣合作主演；4月29日，执导的古装战争剧《薛丁山》在陕西卫视播出，该剧由迟帅、傅淼共同主演。

2015年，执导由吴毅将、徐亮共同主演的动作电影《六扇门之绝战》；同年，执导由吴毅将、徐亮、陶洋联合主演的古装剧《六扇门传奇》；5月5日，执导的古装神话剧《聊斋新编》在浙江卫视播出，该剧取材自蒲松龄的短篇小说集《聊斋志异》。

2016年2月9日，与鞠觉亮合作执导的古装武侠剧《新萧十一郎》在北京卫视、广东卫视首播，该剧由严屹宽、李依晓、 朱一龙联合主演；7月18日，执导的古装武侠剧《新边城浪子》在北京卫视周播剧场播出，该剧改编自古龙武侠小说《边城浪子》，讲述了傅红雪为了查清父亲白天羽遭人埋伏意外身亡的真相，所发生的故事；10月8日，执导的古装玄幻剧《莽荒纪》在新疆开机，该剧由刘恺威、王鸥主演

2017年1月3日，执导的古装奇幻剧《奇星记之鲜衣怒马少年时》在优酷、PPTV聚力首播，该剧由吴磊、陈翔、张予曦联袂主演；同年，执导由侯明昊、敖犬、白鹿联合主演的神话剧《西游记女儿国》；此外，还执导了科幻剧《逆境游戏》，该剧根据网络同名原创小说改编。

2024年2月2日，执导的电影《兽王》上映。

黄祖权擅长执导历史剧和武侠剧，他始终坚持做好每一部剧的原则，兢兢业业的态度让他的作品一直都是高质量的保证，并且始终追求创新，勇于突破自我，向新兴起来的网剧作品发起挑战（网易娱乐评）。在浙版《西游记》中，黄祖权大胆表现出孙悟空的个人感情，塑造出充满喜怒哀乐的齐天大圣形象。不管是萧十一郎还是傅红雪都能被黄祖权打造成为“有故事背景”的主角形象，被赋予人之常情，有缺陷的一面，也有挫折的时候，这样的设定丰富了人物性格，更加引人入胜（新浪娱乐评）。