宋乾道三年（1167年）三月，日本国派遣使节致书四明（宁波）郡庭问佛法大意，太守召集众僧研读使函，无人敢出面应命。栖心寺维那忻然而出，当场拆封读信，随读随掐纸指出日本来书的7处错误，后逐条进行了分析解答，使日本来使惭惧而退。栖心寺维那为国家、为佛教争光，被太守尊称为“天下维那”。

元代时，栖心寺仍以弘扬《法华经》教义为主，为甬城重要的天台宗道场。

明洪武二年（1369年），寺院遭火灾，遂以法堂原址及舍利塔后地块改创养济院。

明洪武二十年（1387年），负责海防的将军汤和为抗御倭寇侵扰，实行坚壁清野策略，将海岛居民迁徙内地，焚毁普陀山宝陀寺（普济寺前身）殿舍300余间，迎观音菩萨圣像于宁波府栖心崇寿寺内供奉。栖心寺住持惟摩（一作惟拳）舍地以建宝陀寺；寺东三分之一面积复建栖心寺。同年，太祖诏改寺额为“补陀寺”。同时，因寺前建有7座佛塔（喻示过去七佛，为禅宗法脉源头表征），民间俗称“七塔寺”。

明永乐四年（1406年），栖心并入补陀，两寺合一。

明永乐二十二年（1424年），住持汝庆建圆通宝殿。

明宣德七年（1432年），永诜建毗卢阁。

明天顺二年（1458年），文彬建藏经宝阁、大悲弥陀殿及廊庑等。

明嘉靖年间（1522年-1565年），建十王殿。日本国遣明副使策彦周良等曾5次到寺参访，与寺僧多有交流联谊，史迹备载其《初渡集》《再渡集》。

清顺治年间（1644年-1661年），住持拳石行沃重修佛殿、方丈、山门、钟楼。

清康熙二十一年（1682年），住持超珏建大悲殿及廊庑诸室，自天超育建云来庵于一都地，为该寺塔院。

清咸丰十一年（1861年），寺经太平天国兵火，毁为废墟。

清同治十年（1871年）始至光绪年间，宁波江东迎春弄医生周文学及其母亲蔡氏（一作陈氏）发心重修佛殿，早磬晚鱼，募化多年，最终建成天王殿、圆通宝殿及两侧厢房、山门等，可惜未竣全功。

清光绪十六年（1890年），天童寺退居方丈慈运灵慧禅师应地方绅董之请，出任七塔寺住持。自此广集净资，大兴土木，重修了主佛殿、天王殿，复建了三圣殿，新建了法堂暨藏经楼、祖堂、客堂、禅堂、念佛堂、大钟楼、七佛塔等，塑千手观音圣像，梵宇一新，衲僧云集，两度传戒，夏讲冬禅。

清光绪二十一年（1895年），慈运禅师晋京请颁《龙藏》一套，并蒙光绪皇帝敕赐“报恩寺”额，自此全称“七塔报恩禅寺”。慈运禅师为禅门临济正宗第三十九世传人，住寺期间，大弘临济禅法，七塔禅寺因此被尊为中国近现代临济宗中兴祖庭之一。后人缅怀慈运禅师之功德，建“慈荫堂”（楼上为玉佛阁，民国八年智圆和尚建）以纪念之，尊其为七塔禅寺中兴之祖。

民国时期，觉圆和尚担任住持时，礼请华严学大家溥常法师在寺内创办了七塔报恩佛学院。道亨和尚担任住持时，增建了云水堂暨华严阁、监斋殿、五观堂、大厨房等，使道场规制更趋完善。圆瑛大师任住持时，在好友庄严法师的襄助下，于鄞州五乡同岙庾山岭辟建了塔院道场，为七塔寺年老僧众修行安养之所，设立普同塔，供奉圆寂僧人灵骨。

七塔禅寺自创建以来，屡经兴废变革。1959年僧散寺空、法器荡然，中轴线主要殿堂成为土产公司仓库，东、西两厢建筑分别被四明纸盒厂与万兴纱厂占用做厂房，寺院名存实亡。

1980年，党的宗教信仰自由政策落实，成立七塔寺修复小组，由宁波市佛协会长月西法师任组长。在党和政府领导重视与四众弟子支持之下，月西法师筚路蓝缕、费求撙节，逐步收回殿堂土地，塑造佛像法器，作育僧才，兴隆佛事，经过10余年苦心经营，终于恢复七塔道场，使寺貌焕然一新。

1993年，月西法师圆寂后，其高足可祥法师秉承师父遗训，带领全寺僧俗四众，按照“修旧如旧”原则，将全寺各主要殿堂、厢房、库房、厨房等次第修缮一新；又改建了花岗岩七佛塔、冲天云柱式山门牌楼及栏墙；新立了花岗岩普门柱，彰显观音道场；新建了鼓楼，弥补了寺院只有钟楼的缺憾，并请传印长老撰写了《新建鼓楼碑记》；增建了天王殿东西厢房，辟为法物流通处、消防治安室；法堂西侧复建华严阁（两层），以与东侧玉佛阁相应；改造原老旧招待所，成古典式“云来居”楼；收回西北角被占地块，新建成禅学堂、报恩大讲堂、栖心图书馆及地下停车场等；租用寺东土地，增建图书馆（二期）、艺术馆、素斋馆等。

七塔禅寺为典型的禅宗伽蓝七堂建制，坐北朝南，整座寺庙现占地面积19632.04平方米，建筑面积16969.07平方米，由南向北纵深排列，其主要建筑有天王殿、圆通宝殿、三圣殿、法堂、藏经楼、祖堂暨方丈室依此排列在中轴线上，均为七开间规模，大多建成于清末慈运长老之手。轴线两侧则有钟鼓二楼、厢房客堂，以及报恩大讲堂和栖心图书馆。山门外矗立着七塔寺的标志——七尊青石佛塔，喻过去七佛，一字排开于山门前。

山门牌楼为新建，高8.8米，宽11.5米，为冲天云柱式样，精巧典雅又不失巍峨庄严。牌楼正门高悬赵朴初居士手书的“七塔禅寺”四字，与左右两额颜体“东津禅院”“栖心兰若”相呼应。牌楼主楹联“南海步慈云，千手遍护持，光明如是；东津沐法雨，万邦昭感应，真实不虚”，乃是七塔寺住持可祥法师所撰，普陀山戒忍法师所书。边联“镜师始作，弘临济正宗，广传圣教；慈老中兴，仰观音灵感，代出高僧”，亦为可祥法师所撰，由中国书法家协会副主席尉天池先生所书。牌楼背面正额为可祥法师所书“同登彼岸”，左右两额为弘一法师书体“般若径”和“解脱门”。中间楹联“古刹建晚唐，临济绍家风，两浙禅林推巨擘；分灯溯南海，观音蒙化雨，四明佛殿逊恢宏”为宁波张秉全居士撰，书法家沈定庵先生所书。边联“古刹重光，市尘别开清净境；禅门永焕，梵宫长护吉祥云”乃杭州詹瀛生先生撰，当代著名红学家冯其庸先生所书。

山门牌楼分左、中、右三门，分别装以古铜色铜质大门，门上饰以莲花、手印等佛教图案。门柱内外分别雕刻八只雄狮，或坐或卧，形神兼备，守护山门。牌楼两侧为六十余米长的石质栏墙。栏墙外分左右摆设十坛铁树，内则各植八棵罗汉松。

天王殿，面宽七间，进深五间，重檐歇山，上檐下横匾书“天王殿”，下层檐下横匾书“七塔寺”。殿前有七座宝塔（东侧四，西侧三，成一线排列）。原塔建于清康熙二十一年（1682年），现塔为近年新恢复。殿内正中供“布袋和尚”“韦驮”，前者为香樟木雕，后者为泥塑，两侧为四大天王塑像，其中东侧为增长天王、持国天王，西侧为广目天王、多闻天王。四大天王像高8米，彩塑甲胄，神采飞扬，凛然不可逼视。天王殿后门楣上高悬“三洲感应”匾额，为著名书法家启功先生所书。门楣上“韦驮殿”三字匾额为广州著名书法家连登先生所书。天王殿东西两侧为新建厢房，分设法物流通处和报恩佛学书店。厢房与天王殿之间有护墙相连，中开亭门以通内外，东西门楣分别镌刻“补陀示迹”和“临济正宗”，为书法家张海先生所书。

圆通宝殿，面阔七间，进深六间，乃是清同治年间周文学母子发心所建，后又经过屡次破坏、维修，如今容光焕发，更显气势恢宏。其建筑样式为重檐歇山顶，前围梅花石石栏，殿堂四周石柱上镌刻着清代名家张家骧、童华、顾文彬等人所书的联语。殿堂匾额“圆通宝殿”四字则为当代著名书法家谭建承先生所书。大殿正中供奉四十八臂（喻千手千眼）观音菩萨塑像一尊，其上悬挂匾额“济世慈航”，为七塔寺观音道场的显著特色。本尊观音塑像为1980年月西法师住持时以香樟木雕刻而成，高五米三，重三千余斤，外部妆金，结踟趺坐于莲台上，妙相庄严，见者称叹。背后供奉杨枝观音画像一帧，高两米五。四十八臂观音圣像后面，左文殊菩萨，骑青狮，其上悬挂匾额“慧海慈云”；右普贤菩萨，跨白象，高两米有余，其上悬挂匾额“圆通妙谛”。东西边墙壁上，镶嵌光绪二十年（1894年）砖刻五百罗汉像，为国内所稀有，弥足珍贵。殿内东侧前方悬宋南宋景炎三年（1278）所铸大钟一口，重七千斤；西侧前方架法鼓一面，直径近两米。殿后门楣上悬挂“慈航普度”匾额，为天童寺广修长老所书。

三圣殿，面宽七间，进深六间，重檐歇山式建筑。檐柱是石方柱，前柃柱是木方柱，其余均为圆柱。檐间横医书“三圣殿”。楹联有：由来号崇寿历韧重新喜佛决普照十方长为照朝资圣寿，何处觅栖心随缘且住总僧众挣参三味直从觉路澄禅心。自悬海有宝陀寺名普渡慈航作津迷，仿灵山为诸大众说宏开梵宇广灯传。万纫现全身南海祥光瞻满月，七熏留宝塔东郊獴靖拓栖露。殿内对联：十方来十方去十方共成十方事，万人舍万人施万人同结万人缘。殿内正中供奉三圣佛，各高8米多。背后为千手观音立像，均为香樟木雕贴金。三圣像背后，供奉千手千眼观世音菩萨鎏金圣像一尊，形容殊胜，端庄慈悲。三圣殿后门楣上悬挂“莲邦净域”匾额，为上海书画家陈佩秋先生所书。

法堂楼，殿广五间二弄，有前后廊，为重檐硬山顶，法堂楼前有小石桥，桥下为锦鲤池。一楼法堂，匾额“法堂”由中国佛教协会会长传印长老所书。法堂正中供奉一米三高汉白玉释迦牟尼坐像一尊，佛像前高设法座，良辰吉日，住持和尚于此升座说法，传授法徒，故称“法堂”。周围为红木茶几座椅，相向陈设，古意盎然。楼上为藏经楼，“藏经楼”三字匾额为著名学者南怀瑾先生所书。楼内藏乾隆版《大清龙藏》、影印《宋碛砂藏》、日本《大正新修大藏经》、《续藏经》等，及二百八十余片梵文贝叶经。

玉佛阁， 重檐硬山顶楼房。由智圆和尚创建于民国八年（1919年），建筑古朴典雅，内供奉玉佛一尊，庭前假山玲珑，秀竹婆娑，苍松挺奇，幽兰飘香。“玉佛阁”三字匾额为寒山寺性空长老所书，为七塔寺常住开会、学习场所。楼下为慈荫堂，“慈荫堂”三字匾额为民国陶思曾所题，为纪念中兴祖师慈运长老之所，中间供奉慈运长老画像和塑像。法堂西侧为华严阁。

方丈院，面宽七间，重檐硬山马头墙，全部力士透雕，工艺精细。寺内还存有唐咸通十四年（873年）岁次癸己六月甲午朔廿八日立，清光绪丙午（1906年）住持慈运重修的心镜禅师塔，上刻“唐敕赐心镜掸师真身舍利塔”十二字。此塔为唐墓塔，分塔座、塔身、塔顶三部分，圆形，造型庄重，线条优美，塔上有铭文记叙了心镜禅师的历史和僧人建塔的事迹。出自唐人手迹的铭文，现仅存117个字。

七塔禅寺寺内有寺院开山祖师心镜藏奂禅师舍利塔，上刻“唐敕赐心镜禅师真身舍利塔”等字样。宋代大铜钟两口，各重达七、八千斤，分别铸于南宋绍兴四年（1134年）和南宋景炎三年（1278年）。清雍正十三年（1735年）刻印、光绪颁赐之《龙藏》一部。梵文贝叶经一束280片。清代砖刻五百罗汉造像图，工艺精妙，形神兼备，佛门珍品，备受瞩目。

七塔禅寺因此被尊为中国近现代临济宗中兴祖庭之一。

1983年，七塔禅寺被国务院批准为全国首批重点开放寺院。

2011年1月7日，七塔禅寺被列入浙江省重点文物保护单位。

1983年4月9日，被中华人民共和国国务院批准为全国汉传佛教重点寺院。

七塔禅寺位于宁波市鄞州区百丈路183号。

途径线路：2路、微72、509路、55路、55路、2路、微71、微1、区际快线一、788路、784路、771路、705路、707路、709-4路（支线）、717路、720-1、728路、755路、703-2