更新时间：2024-10-12 15:45
人类补完计划(Human Instrumentality Project)是该片中隐藏比较深不太容易理解的概念之一。
《新世纪福音战士》一共有所谓的“两个结局”其一是动画片TV版的第25、26话，以意识流式的心理分析中结束（国内2000年引进TV版，由于过于血腥暴力后半部分的碇真嗣的内心世界是重新剪辑出来的，所以，国内TV版本后半部分在剧情有些讲不通）。另一个就是在电影版The end of Evangelion中，描述的第三次冲击的发生为结局。
关于“人类补完计划”及其内容，一直是“EVA”研究者们争论的焦点，因为这个“计划”是整个故事的基础环节。然而，在动画中却始终没有给出明确的答案。
比较通行的观点是：人类（无论是肉体还是心灵）都是由脆弱的物质构成的，所以也就非常容易受到伤害，而在人与人之间，心灵的世界是彼此隔绝的，要使人类向更高的领域进化，就必须使人的心灵摆脱躯体的束缚，重新回到人类的诞生之地“莉莉丝之卵”中。唯有如此，才能最终拆除人与人之间的心灵屏障，使不同的心灵世界能够相互补充，走向进化的终点——成为永生的“神”。人类补完计划就是为了实现这个神圣目的而创立的。
另一种观点认为：《圣经》中记述了伊甸园里有着被称为“智慧之树”和“生命之树”的树木。因为受到化身为蛇的魅惑天使的诱惑，亚当和夏娃偷吃了被视为禁忌的“智慧之果”，从而拥有了神才有的智慧和“羞耻之心”。神因为亚当和夏娃悖逆了自己最初的告诫，将亚当和夏娃赶出了伊甸园。并命令智天使（Cherubim），手持悬垂之剑，把守伊甸园的大门（Heaven’s Door）。“人类补完计划”的最终目的是打败把守大门的天使，取得“生命之果”，使人类得到永恒的生命，所以又有“迈向神之道”计划的别称。
第一种观点可能比较接近于“人类补完计划”的原始含义，而且在动画片中也有很多旁证和引证，也足以支持第一种观点。至于第二种观点可能是根据《圣经》与故事的联想，与作品内容似乎没有直接的联系。
尽管只有一个“人类补完计划”（将人类从原罪中解救出来的计划），但是碇元渡和Seele却同床异梦。不过，至少在寻找生命之树这一点上还是一致的。而关于如何找到生命之树就能进行赎罪仪式并让全人类回归到原始状态的过程，都记载在“死海古卷”不为人知的另一面中。按照这一人类赎罪的“剧本”，要接近生命之树必须打倒神所安排的守护者，也就是使徒。
人类，占据智慧之果的物种面临着危机，诚信的危机。
人和人之间的距离其实就是人类之间心灵上的隔阂。
心魔蚕食着人类的心。
看不懂身边的人，身边的人也看不懂自己。
暴力、犯罪、性冲动、欺骗都是人类保护自己的卑劣的手段。
照相机能够拍下人的表情，可以揣摩人的思想，但是没有东西可以了解人类的心灵。
人类的精神已经受到了太多的污染,人类的肮脏已经到了无法挽回的地步，只有重新回归母体，重新开始人类的历史才能避免悲惨的结果。
阴天压抑著人的心灵，雨水刺激著人的兽性。
人类需要觉醒，需要回归。
事物的占有，是人类发展的开始，也是人类灭亡的徵兆。
财富的占有把人类的自私膨胀到了极点，心灵已经受到了污染，而这种污染随着物质社会的发展不断扩散，最终人类的心灵会被没有生命的物质所控制而被引导至灭绝的地域。
对现有的不满足刺激人类利用智慧之果不断创造出新的物质来满足人类天生缺陷的心灵。
心灵的缺陷永远无法通过创造来填补。
这种填补只会扩大心灵的缺陷。
原本黑色、代表沉睡的夜晚被人类创造出来的火破坏。
血腥的食物被人类扭曲了原本的含义。
创造是灭亡的先兆，灭亡是创造的最终结果。
人类走向灭亡，伴随著坏死的心灵。
心灵的缺陷无法通过创造来补完。
只有心灵的忏悔才能完成心灵的补完。
只有慢慢消亡的占有欲望才能达到最终的补完。
自灭是现唯一的自由。
淡化生存的空间，满足现有的状态才能慢慢的停止缺陷的扩散。
人类，为了自己所创造出来的东西而自残。
放弃虚幻的物质，放弃引向灭亡的创造，和万物一起呼吸才能补完坏死的心灵。
智慧之果是人类创造世界的工具，也是被永久剥夺生命延续的缘由。
智慧，是死亡之树的毒果，把人类引向了地狱的大门。
人类的智慧是欺骗自己和欺骗自然的技巧，而自然对人类的智慧表示了最大的嘲讽和报复。
恶化的环境、越发复杂的人类之间的游戏、失败者悲惨的结局都是人类最终走向灭亡之路上已经付出的代价。
人类最终会接受来自自己的末日审判。
人类的智慧没有因为一代代人的消逝而消逝，反而更加散发出更加耀眼的黑色之光。
人类心灵隔阂的造成都是源自积累的智慧，没有智慧，人类可以永远生活在和谐的自然之中，和其他生物一起缘生缘灭。
而智慧的传递使人类和其他生物隔绝，也和同类产生了距离和矛盾。
没有智慧的人类，不会因为一丝不挂而感到羞愧，这是自然的力量所赐予人类最美好的容器。
人类的智慧已经进化到一个无法突破的死角，等待人类的是不断的徘徊和最终心灵的坏死。
智慧是罪恶的根源，人类在高速发达的社会中产生的犯罪、矛盾、强权都是智慧的恶果。
人类心灵的补完需要的是放弃智慧的存在，让人类心灵的隔阂逐渐消亡。
智慧不能带给人类文明的永生，只会让人类永远无法寻找到生存的真理。
拒绝放弃智慧的人类，面临的只能是完全沉默的心灵。
人类自己所制定的道德标准把人类从广阔的天地带入了一个充满教条、约束、无法展现人类自我价值的黑色且阴冷的房间。
人类把自己捆绑在了自己的所创造的世界中，是人类最终陷入发展死角的无知。
人类自以为是真理的道德其实是人类无法约束自己行为的枷锁。
人类补完最终要取代道德，人类最终是近似完美的形态。
在道德无法约束人类行为的时候，道德的价值是无法经受考验，人类推崇的价值还是要被人类自己抛弃。
人类反复无常地把自己所创造的价值当作玩偶，任意摆弄。
当耶稣被永远的钉在十字架上的时候，就已经证明了道德的无用。
人类需要的不是在道德的空间中生存，人类心灵的补完是人类对自傲的忏悔，是回归自然的过程。
遵循自然的条例才是补完唯一的途径。
人类以道德的价值和自然的教条所并撞，最终人类会受到审判。
没有了道德的束缚，人类就开始了补完。
在EOE结局中，人类补完计划展开，全体人类化为LCL液体，只留下因为拒绝补完所以没有融入LCL之海的碇真嗣和明日香。真嗣虽然接纳了自己和世界，凭借自己的意志勇敢地踏出LCL之海走向现实，但是对于他人即地狱的恐惧依然留存于他的心中。明日香则代表了剩下的讨厌和孤立真嗣(当然是真嗣自己这么认为)的全人类，真嗣厌恶不来拯救自己的明日香，同时厌恶冰冷的人世间，所以真嗣把所有的厌恶集中在了明日香身上，所以有了结局真嗣想掐死明日香的这一幕。但是明日香并没有反抗，反而触摸真嗣的脸庞说出那句足以概括全篇的：你真恶心。
在剧场版最后碇唯曾说过：“不用担心，任何灵魂都会有复原的能力，只要有活下去的信念。”绫波丽也说过，“只要能用自己的心去创造自己的形象，任何人都能恢复人形。”从这两句话可以看出，化为LCL液体的人类是很有可能再次变回人形的，只是在于自己的灵魂是否愿意接受这一切了。生命不久之后就将重归，遍布于整个星球。但地球生态和人类文明已经全部毁灭，在恶劣的自然环境和匮乏的精神滋养之下，人类能否生存下去的未来仍然是无法解开的谜。
『EVA』中虚构了一设定：死海古卷缺少了相当的一部分，而那上面就记载着关键的有关出现生命之树的情报。此外，还需要找到隆基努斯之枪和加福之所——希伯莱神话中住着天神之魂魄的地方，准备出生到人间的孩子们，会首先在那里获得灵魂。而当这里的门打开时，也就打开了世界的开始和终结之门。
第23话中Seele的台词：“已经打倒了第16个使徒”“那么死海古卷中记载的使徒还剩最后一个”“也就是说约束之日已经临近了。”
《死海古卷》确有其物，是在1947年在死海附近一个洞穴内发现的诸多古基督教经书的抄本文物，据考证其年代约于公元前三世纪到公元一世纪。
2000年9月，人类在南极设立的葛城科研站（其直接目的是研究南极大陆下方的第一使徒亚当）在对亚当进行研究的过程中（其根本目的是将亚当还原成卵状并封印，避免使徒溯源与之相遇后引发第二次冲击），拔出了插于亚当胸口的朗基努斯之枪，结果导致亚当觉醒，后想插回朗枪去抑制其觉醒结果无效，并由于人为导致的亚当的基因与人类（第十八使徒）的遗传基因的接触，释放出了超出预想值以外的反AT力场（人类的智慧之果和使徒的生命之果结合时就会产生和神同等的力量）。结果导致亚当觉醒后暴走，第二次冲击爆发，白之月被破坏。第二次冲击结束后 ，亚当失去了光之巨人的体型，其肉体被SEELE回收并在被还原成了手掌大小的卵装后被封在了树脂中。亚当的灵魂最终也被SEELE找到，并被融入亚当根据潜入其身的人类遗传信息而创造出的拥有人类外形的第十七使徒、新生的自由天使（即渚薰）的躯体之中。
后渚薰以第五适格者的身份被SEELE派往NERV，过去的经历除出生日期之外全部被抹消。作为全作中少数了解世界的核心的存在，他的诸多谜一般的言语常常暗示着未来的发展。
这两个计划对于人类补完计划都是必须的，原本亚当计划和E计划是一个概念，但是后来逐渐分开了。
亚当计划：复原原始形态的亚当的计划。虽然也可以说是为了制造EVA（E计划）才复原的亚当，但Seele的赎罪仪式也有使用亚当来进行的计划。而碇元渡为了自己的计划，也曾利用过亚当。
E 计划：为了消灭使徒并进行仪式，按照计划需要至少12台EVA。在当夏娃计划开始之前是使用莉莉丝来制造EVA，但是在亚当再生计划开始后，二号机以后的EVA都是从亚当制造而来。（随二号机来日本的，就是加持所带来的亚当）
消灭使徒是生命之树出现的条件。通过EVA初号机等的努力，这个目标基本实现。对于Seele来说，生命之树是不可缺少的重要道具；对于碇元渡来说，他需要的是生命之果（实际上初号机在此之前已经获得了S2机关，也就是生命之果）——共同目标都是要打倒使徒。尽管在朗基努斯之枪、S2机关和Nerv的对人防御系统（这点最后让Nerv遭到进攻时吃了大亏）等问题上相互拆台，但是Seele和碇元渡双方还算是勉强合作一直撑到了所有使徒都被消灭。
【冲击】及【人类补完计划】的本质
【冲击】和【补完计划】在某种程度上是近似的，正如渚熏所语：“这个世界上，生物大量灭绝并不少见。生命本来就是在不断适应环境而进化。 而【Lilin】并不是在适应环境，而是在改造环境。人工促进的进化，以牺牲远古生命为代价，以其生命果实，促进【Lilin】的进化。这一切都是从太古就被注定了的灭绝程序。而这，被NERV称之为【人类补完计划】。”
这里，【Lilin】是使徒对人类的称呼，“远古生命”包括了使徒。使徒是人类的阻碍，人类和使徒只有一方得以存在。存在者才有希望进化。
在《死海文书》的记载中，【第1次冲击】是【神】为了净化地球而降下，是为了使人类进化。这种举措在《圣经{启示录}》也有记载，也就是通常所说的【世界末日】：这世间的最后，苍穹之上，神袛宣判。那罪恶的人会上不得天国。原来的惩罚之处则转为新世而轮回。
EVA接近【神】，使用【神】的能力和工具（EVA、【尼布甲尼撒钥匙】、【卡西乌斯枪】和【朗基努斯枪】、【莉莉丝】的粒子、【莉莉丝】的尸体让【莉莉丝】复活，和“【亚当】的容器”结合创造新世。）让世间再次轮回，促成人类的进化。这，就是【冲击】，也是【补完计划】的实质。
【第2次冲击】和【第3次冲击】不是单纯的意外，而是为了新的轮回做准备。
计划中的【第4次冲击】，进而发动的【补完计划】，才是【第1次冲击】的延续。
NERV的计划
绫波丽留在初号机里的另一个目的就是可以舍弃【莉莉丝】，而改用初号机和“【亚当】的容器”进行发动【冲击】和【补完】。这样做既减低了风险，也保证了【补完计划】的效率。这也是【使徒】的一再侵扰下所作出的符合碇源堂利益的计划。并且，变相的使Seele同意，决定这一结果。但【第3次冲击】是碇源堂的私下做法，虽然《死海文书》也预言到这一事态的端倪，不过，NERV的解释却是意外：由初号机导致。在Seele的计划里不存在这一设想。
首先是tv版第25、26话的心理分析课，可以说，EVA的前面全部24集都是为了这最终的人类补完计划来做的铺垫。在这里，所谓的人类补完就是人内心的进化，其实就是心理进化、解决病态的心理问题。片中以生存的意义，存在的目的为核心话题，以人的孤独为对象，进行了长篇的心理描述，意在使观众（也就是和Eva中人物有相同心理的观众）在了解了片中人物的心理解决过程中也解决了自己的心理问题。最终，碇真嗣也走出了自己阴晦的心理，完成了自己内心的补完，这时，所有的人都恭喜他走完了自己相当重要的心理历程。在片的最末尾，写下了“然后祝福世界上所有的孩子……”就这样，Eva就在这样的话语中结束了。然后，又推出了电影版The end of Evangelion，以描写故事的形式完结了新世纪福音战士。所谓的描写故事不过就是在以故事为基础进行心理分析而已，其实整个新世纪福音战士故事中都是为了进行心理上的补完而设置的。
作品描述了绫波丽与碇真嗣之间的逐渐沟通，逐渐了解，也逐渐的补充对方的过程。在这个过程中，丽逐渐的了解到人之间感情的意义，从一个不知感情为何物的“机器娃娃”到逐渐的与真嗣产生感情，最终为了真嗣而牺牲了自己。而在EOE中绫波丽终于冲破了自己的宿命，作出了自己的选择，离开了碇源堂，不再作他的玩偶，而坚决的作出了自己的选择。
明日香在经历了长期的畸形心理状态时期之后，终于，在EVA二号机中由于与母亲的灵魂交流终于走出了过去的自己。完成了与Eva二号机的同步，其同步率达到了400%，终于找到了妈妈的明日香也真正找到了自己。她说“绝对领域保护着我……”一切与其他外人没有什么关系，一切都是为了自己。绝对领域并不是隔断心之间的墙壁，而是用来保护自己的。飞翔在天际的Eva二号机正是自由翱翔在自己意识中的明日香啊。选择是痛苦的，然而不能选择就连痛苦都没有。
碇真嗣在整部EVA中都是生活在严重的心理压力之下。这也正是他作为男主角的宿命吧。当绫波丽把一切都交给他时他的内心还是充满了矛盾。怕伤害别人和被别人伤害而自我封闭的意识还是深深的埋在他的内心深处。最终，还是由于他的这种思想引发了第三次冲击。而在LCL生命之海中，他看到了自己本来所希望的世界——人们混合成了一个整体，然而他领悟到有矛盾的世界才是真实的，虽然可能残酷，但也存在着幸福。这时碇真嗣真正明白了无论在什么状态，自己内心不改变的话世界是不会有任何改观的。最终，他选择了回到原来的世界，决定改变自己，决定接受一切。
在剧场版最后唯的话中曾说过：“不用担心，任何灵魂都会有复原的能力，只要有活下去的信念。”从这句话可以看出，那些化为LCL液体的人也是很有可能再次变回人形的。只是在于自己的灵魂是否愿意接受这一切了。
经过了这样一段辛苦了历程，evangelion的少年们终于走出了自己的心理怪圈，走出了自己的心理阴影，可以说Evangelion给他们的心灵进行了补完。同时也就给全世界的少年带来了福音。
《EVA》的故事正是根据这些我们以前从未听过的古怪传说展开的，一切的一切都是由于它而起：EVA和绫波丽的制造、真嗣的出现、神秘的幕后组织......人类补完计划是为了把所有人类的灵魂摆脱肉体的躯壳，回归到一个集合体之中，摒弃人与人之间心灵的隔阂，超脱成为更进一步的生命！为此而建立的组织“SEELE”、碇元度和那些不想死的人都有自己的小算盘，围绕着这个计划各自开始了自己的活动。
本来想先说SEELE的计划，但是考虑到比较难写，所以还是先看看碇元度是怎么进行这个计划的吧。看来碇元度真的很爱碇唯，他进行人类补完计划的最终目的就是想在最后关头获取使徒的力量自身成神复活亡妻。至于冬月，他可以算在碇元度那一伙，不过我想他也是爱着碇唯的，但是既然她被碇元度泡去了，自己只能把思念留在心底了。为了见到碇唯他加入了碇元度的nerv。碇元度为了实现自己的计划，处处在下面搞小动作，挖seele的墙脚，不但控制了亚当和lilith、让初号机搭载了s2机关，还把隆基奴斯之枪扔到了月球轨道上。最后由于被察觉到自己只是被碇元渡利用的绫波丽的背叛，他未能如愿。
至于seele，他们的计划就是让人类回归LCL的形态（近似液体形态），完成心灵上的补完。
葛城美里、加持良治、那“三条友”（日向庚、青叶茂和伊吹真夜）、明日香、以及一些国家的政府可以说是不想死的人。美里一开始就被蒙在鼓里，到最后偷偷知道了第二次冲击的真相和人类补完计划的目的后就开始阻挠这个计划的实施。至于日本政府则是被seele骗了，以为nerv要发动第三次冲击，结果成了seele排除异己的工具。后来美里破坏初号机和五号机的计划失败，第三次冲击才得以发生。
网上有的说法是seele和nerv各自有自己的第三次冲击计划。