更新时间：2024-02-23 17:06
此站有JR东日本的中央本线与山手线2条路线以及都营地铁的大江户线停靠，是转乘站。都营地铁的车站编号为“E 26”。
JR东日本车站的所属线是中央本线。同是复复线的中央本线、山手线中，本站只停靠行驶中央本线缓行线的中央·总武线各站停车以及行驶山手线电车线作为环状路线的山手线电车，中央线快速、埼京线、湘南新宿线以及特急列车都不停靠。依据特定都区市内制度属“东京都区内”与“东京山手线内”。山手线的车站编号是“JY 18”、中央·总武线各站停车是“JB 11”。
JR东日本
本站是2面2线侧式月台与1面2线岛式月台组成，共3面4线的高架车站。
位于中间的2、3号线（岛式月台）可让往中野方向的中央·总武线与往涩谷、品川方向的山手线乘客进行跨月台转乘。月台的新宿侧有高低差，设有栅栏保护。另外，往中野方向的中央·总武线与往池袋、上野方向的山手线可在下一站新宿站进行跨月台转乘。
出入口分为西口、东口与北口共三处，西口与北口设有指定席售票机，另外还有大江户线的转乘口。东口位于山手货物线（埼京线）路盘下，通道狭窄，是典型的圆顶型出入口。
北口付费区大厅有电扶梯通往各月台，北口出口另有电梯通往大江户线剪票口。东口、西口付费区大厅除有电扶梯通往各月台，另设有斜坡与多功能厕所。
北邻的新宿站由于进行多次改良工事，不断向本站延伸。2016年本站月台北端与新宿站5、6号线月台南端距离仅有100米左右。
月台配置
（来源：JR东日本:车站构内图）
东京都交通局
本站是1面2线的岛式月台地下车站。副站名是“山野美容专门学校前”。到站前的车厢广播亦包括此资讯。以前的副站名为“代代木动画学院前”
A3出口与大厅之间设有电梯连通，电梯两侧皆有门，因此JR北口民众也可使用。付费区大厅与月台之间设有楼梯与电扶梯。
月台配置
东日本旅客铁道
中央·总武线（各站停车）
千駄谷（JB 12）－代代木（JB 11）－新宿（JB 09）
山手线
原宿（JY 19）－代代木（JY 18）－新宿（JY 17）
都营地铁
大江户线
国立竞技场（E 25）－代代木（E 26）－新宿（E 27）