2、基本思想的不同

国家创新系统的理论与国家技术创新系统的理论相比，在基本思想上有三点不同：（1）增加了知识和人力资本的作用。（2）把生产、扩散和应用经济上有用的知识作为系统的功能。（3）系统的活动包括新知识、技能和新技术的创造、储存和转移等。

有的学者认为，国家技术创新系统与国家创新系统，是两个学派，而不是国家创新系统理论发展的两个阶段。这种观点有一定道理。因为，从结构要素和基本结构看，国家创新系统所涉及的结构要素一直存在，创新系统的基本结构并没有因为从国家技术创新系统到国家创新系统的变化而发生质的变化，只是结构要素的比例大小有所不同而已。

当然，国家创新系统不仅是一组与创新相关的机构，更是国家促进创新的政策系统。机构组成是国家创新系统的物质基础，创新政策是国家创新系统的活的灵魂。

事实上，从国家技术创新系统到国家创新系统的演变，主要是基本思想和政策观念的根本变化，而不是结构要素和基本结构的变化。思想和观念是国家创新系统的理论内核，要素和结构是国家创新系统的外观形式。

3、理论基础的不同

国家创新系统的思想和观念的变化，与经济增长理论中人力资本理论和新增长理论崛起是一致的。国家技术创新系统的思想和观念与经济增长理论中的技术创新理论和技术进步理论是一致的。

国家创新系统以技术创新理论、人力资本理论和新增长理论为理论基础；国家技术创新系统以熊彼特创新理论、技术创新理论和技术进步理论为理论基础。

如果说国家创新系统是一种理论，那么，把从国家技术创新系统到国家创新系统的转变，看成是理论发展的两个阶段，而不仅是理论的两个学派，似乎与实际情况更加符合。

在从工业经济向知识经济转移的过渡时期，国家的知识创造能力和技术创新能力成为竞争能力的决定因素，知识和人力资本成为经济增长的动力和源泉。国家创新系统的结构必然反映这种经济发展趋势。在过渡时期，国家创新系统的基本结构、基本要素、主要功能和基本政策等都发生了变化。

1、基本结构

根据伦德华尔、麦特卡尔夫和OECD等的观点，国家创新系统一般由政府、企业、教育与培训机构、科研机构、中介机构和基础设施等组成。在欧美发达国家的国家创新系统中，如美国、德国、英国和法国等，企业从科技经费比例到科技人员比例都处于多数，高达60－70%；中等发达国家如意大利、加拿大和澳大利亚等，企业的比例在50%左右。教育与培训机构的比例一般在20%左右，科研机构的比例也在20%左右。从历史角度看，企业的科技投入和支出占全国的比例呈上升趋势，而政府科技投入和科技支出占全国的比例呈下降趋势。

2、国家创新系统的基本要素

国家创新系统有六个基本要素，即创新活动的行为主体、行为主体的内部运行机制、行为主体之间的联系、创新政策、市场环境和国际联系。

（1）创新活动的行为主体，主要是企业、研究机构、教育培训机构、政府部门等。企业是创新投入、产出及其收益的主干，因而在国家创新系统的起着关键作用。

（2）行为主体的内部运行机制，决定国家创新系统运行效率的重要因素。系统由构成系统的要素及各要素间的相互关系所组成，各个要素的自身优化是系统整体实力和效率的基础。企业、研究机构、教育培训机构和政府都具有良好的运行机制，才能保证运行效率的提高，从而保证国家创新系统整体效率的提高。

（3）行为主体间有效的联系和合作，是与国家创新系统运行效率密切相关的重要因素。创新资源在行为主体间高效的流动，有助于分担创新风险、减少创新成本、加快创新速度、提高创新效益，各行为主体之间的密切联系有助于国家创新系统的整体效率。

（4）创新政策，指能对创新活动产生影响的法律、法规和政策。通常分为供给、需求和环境等几大方面的政策。创新政策与国家的科技政策、经济政策、产业政策、财政政策、税收政策、教育政策等有密切的关系。

（5）市场环境是企业创新活动的基本背景。市场作为一种资源配置的方式，对企业及其他行为主体的创新活动具有重要影响。一个国家市场的发育程度、规范程度和运行效率，对国家创新活动的规模、效益、效率等都是至关重要的。

（6）国际联系是每个国家的国家创新系统与国际大环境进行资源交流的重要环节，也是每个国家创新活动的行为主体进行国际竞争与合作的的途径和方式。在当今世界经济一体化和科学技术国际化趋势日益加强的条件下，各国的国内市场日益与国际大市场接轨。因此，对各行为主体而言，国际联系更具有参与国际大市场竞争，开展国际化经营的意义。

3、国家创新系统的主要功能

国家创新系统的主要功能是促进和进行新知识和新技术的生产、扩散和应用。具体地讲，国家创新系统具有创新活动的执行和评估、创新资源（包括人力、财力、信息资源等）的供给和配置、创新制度与创新政策建设、创新基础设施建设等功能。

（1）创新活动的执行和评估：以企业为主体，同教育培训机构和科研机构一起，从事新知识和新技术的创造、传播和应用。中介机构为创新提供良好环境。政府可根据国家的目标，采取组织重大创新计划和项目、组织产学研合作、推广创新成果、开展国际合作与交流等多种形式，促进创新活动。

（2）创新资源的供给和配置：以市场为主体，市场和政府联合发挥作用，生产、提供和配置创新资源。创新资源系统应包括有利于创新活动的财政金融管理体系、创新人才的教育与培训体系、创新信息服务体系和创新资源的分配体系。

（3）创新制度与创新政策建设：国家创新系统应为全社会的创新活动提供良好的制度环境，具体的工作包括政策和法律的制定、知识产权的保护、社会保障体系、创新风险保险系统、维护国家和公众的利益、规范创新主体的行为等。

（4）创新基础设施的建设：国家创新系统应能为创新活动提供良好的条件，这些条件是创新活动必需的，而且不可能由单个行为主体自行解决的基本条件，包括国家科技基础设施、教育基础设施、情报信息基础设施等。

4、政策变化

随着世界经济向知识经济的转移，国家创新系统的结构、功能和政策都发生了变化。从过去分别制定教育政策、科技政策和经济政策的传统习惯，逐步向制定系统的创新政策过渡。