1950年6月，设立孤山区。

1958年9月，成立孤山公社。

1984年5月，改设为孤山乡。

1997年11月，撤乡建镇。

截至2011年末，孤山镇辖尚庄、岳家寨、徐家峁、沙坬，五里墩、李家洼、南关、杨家沟、庙山、沙牛峁、花塔、房塔、孙家畔13个行政村；下设95个村民小组。

截至2020年6月，孤山镇下辖11个行政村。人民政府驻地南关村。

孤山镇地处府谷县中部，东与府谷镇接壤，南连田家寨镇，西邻新民镇，北接木瓜镇。辖区东西最大距离20.7千米，南北最大距离15.6千米，总面积180.25平方千米。

孤山镇地处黄土高原梁峁丘陵区，地势为西高东低、南低北高。

孤山镇气候属温带半干旱大陆性季风气候。其特点是冬夏长，春秋短；日照时间长，太阳辐射强。多年平均气温9.1℃，最热的7月平均气温23.8℃；最冷的1月平均气温-8.5℃。无霜期年平均176天。年平均降水量450毫米，降雨主要集中在每年的7—9月。

孤山镇境内河道属黄河流域，主要河流有孤山川1条，境内流长12千米。

孤山镇境内主要自然灾害有干旱、洪涝、冰雹、霜冻等。境内灾害年均发生一次，最严重的一次洪涝灾害发生在清光绪十九年六月二十日（1893年8月2日），当日午后境内出现暴雨，孤山川高涨数丈，堡城南关商号居民庐舍财物损毁过半，下游两房屋田地飘荡无存，人畜死亡不可胜数。

截至2011年末，孤山镇辖区总人口11411人，其中城镇常住人口568人，城镇化率5%。另有流动人口3052人。总人口中，男性5961人，占52.2%；女性5450人，占47.8%；14岁以下1837人，占16.1%；15—64岁8238人，占72.2%；65岁以上1336人，占11.7%。2011年，孤山镇人口出生率17‰，人口死亡率5.2‰，人口自然增长率11.8‰。人口密度为每平方千米62.7人。

截至2018年末，孤山镇户籍人口12223人。

2011年，孤山镇农民人均纯收入9057元。

2018年，孤山镇有工业企业40个；其中，规上企业6个。

2018年，孤山镇有营业面积50平方米以上的综合商店或超市个数2个。

2011年，孤山镇农业总产值达到4786万元，比上年增长16%，农业增加值2876万元，占国内生产总值的3.8%。农业耕地面积6.9万亩，可利用草地面积2.1万亩，林地面积0.88万亩。

孤山镇粮食作物以玉米、马铃薯、谷子、糜子为主。2011年，孤山镇粮食生产3176吨。

孤山镇主要经济作物有油料作物、西瓜、蔬菜等，2011年，孤山镇油料作物种植面积1268亩，产量126吨；西瓜种植面积280亩，产量420吨；蔬菜种植面积816亩，产量1100吨。

截至2011年末，孤山镇累计造林2.3万亩，林木覆盖率8.4%。2011年，孤山镇水果种植面积0.005万亩，产量13吨，主要品种有苹果、桃子、杏、海红果等。

孤山镇畜牧业以饲养生猪、羊、牛、家禽为主。2011年，孤山镇生猪饲养量4046头，年末存栏1266头；羊饲养量1.26万只，年末存栏6544只；牛饲养量634头，年末存栏506头；家禽饲养量13万羽，上市家禽3万羽。2011年，孤山镇生产肉类251吨，其中猪肉126吨，牛肉27吨，羊肉32吨；禽蛋1200吨；畜牧业总产值2421万元，占农业总产值的50.6%。

孤山镇初步形成了以煤、焦、电化为主的工业体系，重点规划了恒源、三江等资源型产业集群。2011年，孤山镇工业总产值达到12亿元，比上年增长20%，工业增加值7.2亿元，占国内生产总值的96%。2011年，孤山镇有规模以上工业企业13家，职工0.8万人，实现工业增加值3.8亿元，比上年增长18.6%。

截至2011年末，孤山镇有商业网点580个，职工6800人。2011年，孤山镇社会消费品零售总额达400万元，比上年增长12%；城乡集市贸易成交额140万元，比上年增长8.5%。

截至2011年末，孤山镇有邮政网点3个，投递路线单程总长度60千米，投递点13个，乡村通邮率100%；征订报纸0.215万份、期刊0.001万册，业务收入15万元。

截至2011年末，孤山镇有电信企业1家，服务网点2个；电话交换机总容量1000门，固定电话用户48户，电话用户普及率1.4%；移动电话用户2000户；互联网端口总数42个，宽带接入用户20户。全年电信业务收入45万元。

截至2011年末，孤山镇金融机构各类存款余额2.15亿元，比上年增长20%；人均储蓄17028元；各项贷款余额1.45亿元，比上年增长26.1%。

孤山镇境内有孤武公路、野大公路、府店公路（301省道）3条县镇级公路过境，总长36千米。截至2011年末，孤山镇镇区道路总长度1.2千米，人均拥有道路长度1.37米；城镇桥梁2座，总长度20千米。

截至2011年末，孤山镇有镇文化站1个；公共图书室1个，藏书500多册。

1999年8月，孤山镇开通有线广播站。2010年3月开通数字有线电视。截至2011年末，孤山镇有线电视用户400户，其中数字电视用户150户，入户率11.7%。

截至2011年末，孤山镇有幼儿园1所，在园幼儿172人，专任教师10人；小学3所，在校生502人，专任教师53名，小学适龄儿童入学率100%；初中1所，在校生582人，专任教师41人，初中适龄人口入学率、小升初升学率、九年义务教育覆盖率均达100%。

2011年，孤山镇财政预算内教育经费达1415.3万元。

截至2011年末，孤山镇有各级各类医疗卫生机构1个，其中卫生院1个；病床21张，其中公共卫生机构床位6张，固定资产总值96万元。专业卫生人员16人，其中执业医师3人，执业助理医师1人，注册护士9人。2011年，孤山镇医疗机构（门诊部以上）完成诊疗12775人次，出院病人685人次。新型农村合作医疗参合人数12172人，参合率100%。

2011年，孤山镇有城镇最低生活保障户数12户，人数16人，支出3.96万元，月人均206元；城市医疗救助16人次。农村最低生活保障户数200户，人数477人，支出107.7万元，月人均188元；农村五保分散供养60人，支出27.5万元；残疾人477人，补助资金22.8万元；老年人生活补贴9.6万元；农村医疗救助83人次，民政部门资助参加合作医疗60人次，共支出0.6万元；农村临时救济980人次，支出62.2万元；救济支出19.2万元。国家抚恤、补助各类优抚对象28人，抚恤事业费支出5.4万元。参加新型农村社会养老保险3776人，参保资金97.42万元，比上年增长670人，参保率87%。

截至2011年末，孤山镇镇区有自来水厂1个，铺设干线水管4千米，生产能力104.1吨／日，居民自来水普及率100%。排水管道4.6千米。

截至2011年末，孤山镇镇区拥有35千伏及以上变电站1座，主变压器2台，总容量15兆伏安，高压输电线路3条，总长度108千米，用电负荷8315千瓦。年售电量累计完成0.3亿千瓦时。综合电压合格率98%，供电可靠率99.2%。

从一些零散的史料如石刻、碑记、遗址和传说可知，自古以来孤山川就是一条西北地区通向河东非常重要的通道。孤山川秦汉称翠云川，唐宋叫折水川。清称孤山川在黄河入口处附近称小河川。古代，孤山由于地形险峻，成为保卫府州、河东的天然屏障，所以又是各个军事集团必争之地。保不住孤山，就难保府州，府州不保，河东难保。

秦始皇长子扶苏修筑万里长城时，曾在孤山驻军，并补修了“昊天宫”。唐贞观二年（628年）征东突厥时，大将张说迷路，后以昊天宫定向，许下口愿。灭东突厥后，于贞观八年（635年）由张说督工补修“昊天宫”和折塘关。并任征东突厥立有战功的折华为府谷镇遏使，兼守折塘关。

晚唐时，折华后代折宗本、折嗣伦父子参加镇压黄巢起义有功，于唐僖宗年间任折宗本为振武军沿河五镇都知兵马使，折嗣伦为麟州刺史。从那时开始，一直到五代末，折嗣伦与儿子折从阮、孙子折德扆先后对折塘关进行了几十年的维修和扩建。到后周时，折塘关成为驻有几千军民的边关重镇。后汉乾佑元年（948年），后汉在府州设置永安军，折从阮任节度使，其子折德扆任团练使。为了加强防御能力，先后在折塘关四周修了十多个关寨。并在宝珠山对面青龙庙顶的石畔上铸立一铁塔，以镇龙脉。

北宋景祐二年（1035年），对百胜寨进行了维修和加固。政和年间在孤山寨西南十五里修筑了古城墕关城（原名不详）。北宋时折德扆、折御勋、折御卿、折惟昌、折继闵、折继祖、折克行、张元等在孤山川，特别是新城川（清眉浪年）、沙梁川与西夏和辽国大战不下三十次。庆历二年（1042年），西夏王元昊带领几十万大军进攻麟州，并亲自带领10万大军进攻府州。因中堠寨、百胜寨、三道湾等险关难过，就绕道经沙梁、庙沟门、木瓜从后河川入侵府州。后百胜寨虽然失守，但退入深山老林中的近百名军士，每到晚上就扰乱敌军，并放火烧了元昊屯在折水川的部分粮草。元昊缺粮缺草，急攻府州城七天七夜，城没有攻下，反被守将折继闵射伤，败北而逃。

南宋初（1129年），折可求带领麟、府、丰三州九寨投降金国，孤山寨归金国所有。金皇统二年（1142年），西夏侵占府州，孤山寨很多建筑和军事设施被破坏，折家东、西瑜头两座祖坟，地面建筑焚毁殆尽。

北宋灭亡后，150多年间，西夏、金国为争夺麟府属地，在孤山川、沙梁川、新城川、木瓜川、三道湾打了几十仗，孤山时属金国，时属西夏。

明朝时，孤山成为延绥东路第一雄关。正统二年（1437年），设孤山堡。这时古麟州城已废，县址迁到今神木县城。神木到府谷共有十二溏，孤山为第十溏，所以也叫十溏关（和古折塘关谐音年）。成化三年（1467年），鞑靼一支几千兵进攻孤山不下，于是就将孤山川的青年男女和财物掠走。孤山参将汤允绩明知不敌，但为了救出掠走的民众，就带领一百多军士，奋不顾身，追赶敌人，天黑时追到长城口子上，与敌接战。这时夜幕昏暗，飞沙走石，允绩声如洪钟，军士齐声呼喊，敌军毫无准备，不知来了多少敌人，一时阵势大乱，被掠走的青年男女趁机逃进两面山谷。允绩带领军士在敌阵中冲了几个回合，虽杀伤了几百敌军，但众寡不敌，只好入邮舍。敌人合围攻击，刀枪混鸣，惨声不断。第二天黎明鞑靼退去，邮舍灯光闪亮，寂无声息，院内死尸几百，一大将手拄大刀，双目圆睁，横眉冷竖，站在舍门前，已经殉世。人们进入邮舍，见墙上用血写下诗一首：“手持长剑斩渠魁，一箭哪知中两腮，戎马踏来头似粉，乌鸦啄处骨如柴，交游有义空挥泪，弟侄无情不举哀，血染游魂归未得，幽冥空筑望乡台”。孤山民众捐棺，将牺牲的全部将士装殓。允绩灵柩寄放孤山撒散寺，民众祭奠，三年后运回杭州安葬。

明成化初年，阿鲁人（蒙古一支年）两次入侵孤山，被孤山游击将军王玺击败。成化七年（1471年），鞑靼再度进攻孤山，延绥巡抚余子俊率孤山守将朱永、许宁等将敌击退。后鞑靼又三次入侵孤山，都被守将许宁击溃，保卫了府谷，阻止了鞑靼东进南下。成化十年（1474年），孤山定为长城沿线三十六堡之一。隆庆年间，东协移驻孤山堡，派副总兵镇守，孤山城内修建衙门（后人所说的古衙门年），同时将铁塔移到孤山河西高家湾对面的铁塔湾，并在孤山川沿川河畔新修补修了三十六大寨，三十六小寨，七十二烽火台。到万历初年，孤山驻军达到2600人，是当地民众的几倍。这时明将涂宗睿上疏朝廷，孤山城已破旧，要求朝廷补修。于是明政府派涂宗睿督工，于万历三十五年（1607年）重修孤山城。重修后的孤山城，规模是原孤山堡城的一半，来到南延用原堡城的城墙。城形如一只鞋底，从东北向西南倾斜。从东北至西南长约200丈，西北——东南宽约50丈，周长约510丈。城墙厚三丈，高三丈，全部砖石包罩。城墙铺底都是1尺2寸宽8寸厚6尺长的花岗岩大石条，共5层。再上是用7寸宽，1尺2寸长的大砖双层起墙。顶上是6尺高的城垛，垛上有瞭望孔和箭豁。城开四门，南门、北门都有瓮城，顶上有双层城楼；西门无瓮城，但有城楼；东门是4尺宽7尺高的小门洞，洞外有30多个台阶通向城下。城门都是铁皮镶包6寸厚的榆木大门。城的四角建有哨所。南门外有长50丈宽3丈的砖石道路，通过两座牌楼升向前河湾，东去西来之人，只能从南门、西门进出。西城下是20多丈深的大渠，南城下是20丈深的悬崖，东城下是30多丈的陡坡，所以此城易守难攻，孤山城修好后，曾有一位游人杨一清写下一首诗：“簇簇青山隐戎楼，暂时登眺使人愁，西风画角孤城晓，落日晴沙万里秋。甲士解鞍休战马，农儿持券买耕牛。回思未筑边城日，曾得清平似此不？”可见关城的重要。

明天启六年（1621年），四月初四，发生地震，孤山西城墙塌陷36丈，南城墙塌陷9丈，入地2丈7尺。清乾隆三十三年（1768年），知县郑居中全部补修完好。清末，南城墙坍塌12丈，民国初年补修好。解放初，孤山镇基本完好，但随着机关单位的建设和当地群众修建房屋，到文革后期，城墙上的砖石全部挖完，城墙土胎也已不完整了。后人有小诗一首：“三千甲士几年功，血汉浇铸一座城，不孝子孙贪小利，千年古城瞬时倾。”

清康熙年间，洪水冲断了孤山西边的龙泉山，河水顺直而流，从此过往之人再也不用走南门和西门，只要顺着冲断的河谷走就行了。而空出的旧河湾中间建了一条长约200米的小街，街的两边修建了几十处作坊、商号、民房。为了方便地方经济交流，当时县政府决定，每月逢三逢八过集，几百年来未变。文化大革命时期为了限制商贸活动，全县各乡镇统一定为逢一逢六过集。

由于新河道不宽，遇特大洪水流不出去，所以孤山街从康熙年间建街以来，先后于乾隆二十二年（1757年）年、嘉庆二十年（1825年）、光绪十九年（1893年）和1977年被洪水冲毁过四次。道光年间，孤山守将又将铁塔迁到孤山城对面龙泉山的山腰上，文化大革命中，以破四旧名义毁掉。

孤山是历史上的文化名城，古建筑很多，各种寺庙有几十座。这些寺庙历朝毁了再修，修起又毁，反复多次。明清以来出名的就有四大寺，八大景，其中昊天宫和千佛塔（铁塔年）被列入《中华名胜大辞典》，折家坟、古衙门、龙泉寺等建筑也很有名。

七星庙

七星庙始建于唐贞观年间，现存大殿、前庭两处主体建筑。大殿屋顶为九脊歇山式，殿前过道为卷棚式，单檐斗拱，磨砖对缝，从底到顶，以砖砌成，融合有西北少数民族的建筑风格，是研究中国民族建筑不可多得的珍贵实物资料。

2013年5月3日，七星庙被国务院列为第七批全国重点文物保护单位。

孤山地处边陲，多数历史名人是武将，如唐、五代、宋的折家众将和明时的总兵戴布边，操守戴冕，明威大将军戴辰、都督佥事、备倭总兵戴延春、总兵戴天宠等。