据记载，松赞林寺与七世达赖剌嘛格桑嘉措还有着一段深厚的“法缘”。六世达赖“飞升”后，拉萨三大寺祈求卜认定的转世灵童（即后来的七世达赖）遭到蒙古和硕特部藏王拉藏汗的揎害于是灵童被僧人们护送至松赞林寺避难。灵童将牛奶奉于水源程序，祈祷此水成为乳汗以养育众生，此水由此成为“奶子河”。后灵童又转由青海塔尔寺供养，终于得到当时的皇帝康熙的认可支持，并加封“宏法觉众”的封号。因此，七世达赖对后来松赞林寺的扩建一直给予支持。

1936年夏，贺龙率领红二方面军长征经过香格里拉。贺龙、萧克等亲临归化寺，拜访活佛、喇嘛，并题赠“兴盛番族”锦幛一幅（现存中国军事博物馆）。归化寺为红军筹粮 2万多斤，还派出僧侣为红军当向导，支持红军北上抗日。

松赞林寺内历代珍品众多，有五世达赖、七世达赖时期的八尊包金释迦牟尼佛像、贝叶经、五彩金汁精绘唐卡、黄金及各种精美的鎏金或银质香炉、万年灯等。金寺收藏有《甘珠儿》十部（其中两部为金汁手书）、《丹珠儿》等两百余部。

松赞林寺内历代珍品众多，有五世达赖和七世达赖时期的八尊包金释迦佛像、贝叶经、五彩金汁精绘唐卡、黄金灯。松赞林寺收藏有《丹珠尔》十部，其中两部为金汁手书，以及各种精美鎏金或银质香炉、万年灯等。

天降金鹜为该寺选址时，达剌喇嘛占卜得神示：“林木深幽现清泉，天降金鹜戏其间。松赞林寺内有清泉淙淙，春夏不溢，秋冬不涸，并能常见一对金鹜出入。

在扎仓大殿三楼崩主活佛的经房外有一张梅里“日月同辉”的照片，有人说它象一张酥油灯，也有人说象藏民族敬奉的白塔顶上的日月星辰。据说，何金武曾经三去梅里都没有看到其真容，在第四次去的时候，他先到松赞林寺觐见了克思活佛，活佛为他做了法事。于是他看到了不是一般的风景，就拍下了这张照片。

扎仓的下属僧侣组织就是“康参”，藏语意为僧团，即按僧侣籍贯或来源地的地域划分，将大寺僧侣划分为若干团体，形成教区区域性组织。康参由老僧主持，下设念哇、格干等办事人员，相对独立地管理教区的行政、宗教、经济事务。松赞林寺的八大康参为：独克康参、扎雅康参、东旺康参、绒巴康参、洋朵康参、结底康参、卓康参、乡城康参。前6个康参代表了香格里拉地区区域内村落形成的教区区域组织。卓康参则为江边地区（今上江、金江、三坝、洛吉）等地的纳西族僧侣组织。而乡城康参是指香格里拉与四川省的乡城和得荣两县僧侣的康参。

寺院扎仓、康参之下的最基层僧侣组织称为”密参“，意为一户或一户人，一般以特定的同一区域内僧人形成一个居住单位，共同生活，人数多在一二十人左右。

寺中僧侣分为活佛和扎巴两类，除活佛外的僧侣按学历及资历分为格西、格弄、班卓等，按所承提职责分则有喀姆、老僧、香追、第巴、英则、格干等十数种职务。

崩主活佛在香格里拉县僧谷中有较高声望，任香格里拉县政协副主席。

截止2012年松赞林寺有僧侣700余人。

噶丹·松赞林寺有着严格的系统组织，寺中每一个僧侣都处在组织系统的某一个层面的某个点上（引用民国香格里拉县志的资料来说明，以期更接近历史真实）。

拉西会议是扎仓的最高组织，由全寺的活佛、堪布、格西等高僧组成，专管寺院的教规教义、寺院的重大建设等。

洛张，即掌教官。管辖由堪布选任的乡佐、念哇。堪扎会议，由乡佐及用户大老僧组成，行使该寺对内对外一切行政事务。念哇专管大寺服务人员及神民（拉迪）庄户70户。

觉夏：设迪哇2员（为僧侣的最高职务，卸任后免去僧人的一切义务，所有布施茶薪都要送到私舍中），念哇2员，聪本8员，任期新3年、旧3年，共6年，管理教民（吹遣）300户，及大寺日常每月三朝众僧的酥油茶斋饭等。

西苏：设迪哇1员、念哇l员、聪本8员，任期仍为新3年、旧3年，专管寺庙节日供品及费用。

其他如薄思（公积金）、吹则古哇（管理寺内装饰）、耐念（粮管）、规格（铁棒喇嘛）、扎玛（茶管）等均为一年一任的管事。

康参即分寺，有东旺、扎雅、朵克、吉迪、洋塘、乡城、卓（纳西）、绒巴等八个康参，俗称八大康参，康参的最高管理机构是康参老僧慧，由每一个明参（即僧人的基层组织，每一个舒卡的僧人为一个明参），选一老僧组成。下设格干为管理本康参的僧众及小沙弥的学经。负责新年及十月二十五日的昂曲节的费用。另念哇、古哇两个组织，分别负责本康参的其他育经及佛事费用。归纳起来，就可以制成以下简略示意图。

以上三者的各种组织的综合，体现了噶丹·松赞林寺管理机构的全貌。

松赞林寺地处高海拔地区，海拔3300多米，即使在8月也有可能飘落几朵雪花。建议带上外套、羽绒服、手套、防滑靴。加上气候干燥，紫外线辐射强，女士应准备好防晒霜、遮阳帽、太阳镜，特别是10月份以后探访更要带足御寒衣物。每年6月到9月是迪庆高原的雨季。通常人们选择春夏季游玩。

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