另外，直属信长的军团阵容则有：

2月3日，森长可、团忠正的先锋部队首先自岐阜城出发，河尻秀隆由本队派往担任军监。2月6日，森、团两队由木曾口、河尻队由伊那街道进入信浓。伊那街道沿途的武田诸城为此感到恐慌，在织田先锋进入信浓的同日，通往岩村的关隘・泷泽（长野县下伊那郡阿智村・平谷村周边）的领主下条信氏的家老・下条九兵卫立刻放逐了信氏向织田军投降，并引导河尻军进入信浓，2月14日松尾城（饭田市）的城主小笠原信岭亦投降织田军。

2月12日，信忠本队与泷川一益队各自从岐阜城及伊势长岛城出阵，两日后进入美浓岩村城，翌日一益自信长处收到“辅佐年轻的信忠”的请求书状。2月16日，武田军在鸟居岭遭到木曾义昌跟远山友忠、织田长益、稻叶贞通、丹羽勘介等来援的织田军击败，迹部治部丞、有贺备后守等四十多名武将遭到讨取，翌日信忠到达平谷，隔日进攻饭田城，同日，饭田城主保科正直放弃了城池逃往高远城（之后投降，并在战后成为高远城主），听闻饭田城沦陷的武田信廉（信玄之弟）战意顿失，亦自大岛城（下伊那郡松川町）出逃。2月18日、德川家康自滨松城出发进入挂川城、2月20日包围了依田信蕃据守的田中城，并遣使劝降，依田信蕃于是开城，三枚桥城、兴国寺城等骏河城池也在武田家灭亡后投降德川家。

北条氏政则派遣先峰进入相模和甲斐边境的小佛岭与御坂岭，并在2月下旬进攻骏河东部。2月28日攻陷武田在骏河、伊豆边境的户仓城，接着在3月攻陷位于沼津及吉原的泉头城等地方。上野方面，北条氏邦对厩桥城的北条高广持续施压，并威胁到真田昌幸的领地。

2月28日，河尻秀隆接到来自信长的为了攻略高远城而建造据点的命令。3月1日，织田信忠包围了武田胜赖弟・仁科盛信的高远城。信忠派遣当地僧侣前往劝降，却遭到盛信拒绝并将使者的耳鼻削去后送还，2日，三万名织田军开始对高远城发动总攻，由于仁科盛信与小山田昌行等少数人英勇奋战，亦使织田家蒙受不小损失，包括岩仓家出身的织田信家战死。然而织田军最后仍挟其数量优势突破了城门，仁科盛信及小山田昌行自杀，高远城沦陷。

悉数逃亡的武田军当中，只有仁科盛信奋战至最后一刻，令人见识其武田精神。盛信没有头颅的遗体被当地崇拜他的居民埋葬，埋葬处后来被称做“五郎山”。

2月28日，武田胜赖放弃了诹访，逃亡新府城（韭崎市）。追击胜赖的织田信忠在高远城陷落的隔天，立刻进入了诹访，烧毁了武田庇护下的诹访大社，镇守信浓要冲深志城的马场昌房也献城投降，由织田长益入主深志城。3月1日，武田氏一族的穴山梅雪与德川家康内通，投靠了织田侧。3月4日，家康在穴山梅雪的带入下入侵甲斐。

3月3日、武田胜赖从新府城召开军议，决定要逃往真田昌幸的岩柜城（群马县吾妻郡东吾妻町）或是小山田信茂的岩殿城（大月市）。昌幸以岩柜城的要害性质力劝胜赖前往、信茂则以至岩柜城路途遥远加之积雪甚深，劝其前往岩殿城。胜赖最终决定采纳小山田信茂的意见，将修筑中的新府城一把火烧了，前往岩殿城。

3月5日，织田信长自安土城出发。3月6日到达揖斐川。织田信忠在此时献上高远城主仁科盛信的首级，后于长良川河原示众。

1582年3月7日，织田信忠进入甲府，搜出了多名武田族人及重臣，包括一条信龙、诹访赖丰、武田信廉等人，全数遭到处刑。

3月9日胜赖与嫡子武田信胜一行在前往岩殿城途中的笹子岭（山梨县大月市）遭到小山田信茂攻撃，并且拒绝让其进入岩殿城。（关于这点众说纷纭，一说小山田并非武田从属而是武田领内的一个小的大名，为了战祸波及领民且为守护领地而不得不做出此行动，也有一说事实上攻击胜赖并非小山田信茂而是织田军。）总之武田胜赖至此不得不放弃逃至岩殿城，转而进入武田氏先祖曾自杀的场所天目山（山梨县甲州市大和町）。逃亡之际将家宝御旗及楯无铠藏于塩山（甲州市）的寺中，得以免于战火波及。

3月11日、德川家康与穴山梅雪会面织田信忠，讨论关于今后的计划。同日，胜赖一行在天目山附近的田间被泷川一益队寻获。土屋昌恒、小宫山友晴等浴血奋战，土屋昌恒此战的活跃使其得到“片手千人斩”之名、安倍胜宝突入敌阵战死、胜赖本人亦奋力击退织田军。

然而终究寡不敌众，先是信胜在织田军的围攻下战死，胜赖亦因饥饿及疲劳失去抵抗能力，被后来成为福岛正则家臣的伊藤伊右卫门永光所讨取。胜赖之妻（北条氏政妹）自杀，长坂光坚、土屋兄弟、秋山纪伊守等殉死（据说迹部胜资亦殉死，也有一说死于诹访保卫战。皆与‘甲阳军鉴’记载的长坂、迹部逃亡说相反）清和源氏新罗三郎义光以来的名门甲斐武田氏嫡流终告灭亡。

3月14日，胜赖父子的首级送达滞留于美浓岩村城的信长处。

3月16日，武田信丰遭家臣下曾根觉云斋（信恒）背叛杀害，小山田信茂亦因“背叛主君”的罪名在甲斐善光寺遭到处死。依田信蕃亦被信长下令处刑，但在德川家康帮助下逃走，其人在本能寺之变后重新在信浓、甲斐投靠了家康、并对平定甲斐做出贡献，其他许多武田家臣在后来都成为了德川的部下。

信玄的次男・因失明而出家的海野龙芳则在儿子逃亡后自杀，其子后来因大久保长安的庇护而得以延续一族血脉。

3月21日织田信长到达诹访，接见北条氏政庆贺战胜的使者。3月23日与3月29日发表了对参战诸将的封赏：

武田家灭亡后，上野国一带的武田家臣如真田昌幸、内藤昌月、仓贺野秀景、北条高广、小幡信贞、和田信业、安中久繁等人被纳为泷川一益的与力；北信浓方面的武田家臣如高坂昌元、小幡光盛、市川信房等人则归为森长可的与力；骏河国方面的曾根昌世、冈部正纲、伊丹康直、小滨景隆、向井正纲等人则归于德川家康的家臣。

泷川一益在会议上曾请求赐予茶器“珠光小茄子”但未得信长答应，另外对于被调离近畿则感叹“今后再也得不到茶道的庇佑了”。另外还在未获允许的情况下自封关东管领。北条氏政仅被称赞“在骏河干得相当不错”，此外没有任何奖励。

4月，信长进入甲斐，在途中的台原（北杜市）有生以来第一次目睹富士山。4月3日，造访武田氏历代的本据地踯躅崎馆被烧毁的城迹。另一方面，织田信忠队开始追讨不愿投降织田家的武田余党，包围了残党聚集惠林寺（甲州市），寺院方面拒绝了交出武田余党的要求，织田信忠于是放火烧寺，寺内和尚快川绍喜说出了“灭却心头火自凉（心头灭却すれば火も自ら凉し）”的辞世之句。

其他像是诹访刑部、诹访采女、段岭某、长篠某等人皆被农民杀害，将其首级献与织田军。在黄金悬赏的诱惑之下，农民前仆后继投入追捕武田氏残党的行列。

部分不愿臣服织田家的武田遗臣，则是受到德川家康秘密藏匿庇护，这些人材在之后的天正壬午之乱及军制再编上做出莫大贡献。

4月5日，武田遗臣芋川亲正联合长沼城主岛津忠直发起一揆对抗织田军，包围进驻饭山城的稻叶贞通，入驻海津城的森长可赶忙联络织田信忠，得他派来团忠正援助，两军合流后击破武田遗臣一揆，森长可军斩杀2450名一揆军，芋川亲正和岛津忠直兵败逃往越后国依附上杉景胜。

4月10日，织田信长自甲府出发，前往游览东海道。4月13日抵达江尻（静冈市清水区），16日抵滨松，21日回到安土城。

入驻海津城的森长可对周遭势力剿抚兼施，以抵挡北面的上杉氏。上杉氏也加紧攻势，5月27日柴田胜家等人经信越边境前往北国支援，接著进入了越後的二本木，直指春日山城，获报的上杉景胜急忙返回春日山城。然而，织田信长在不久後即在本能寺遇害，森长可弃城回到本据地、河尻秀隆则在武田旧臣的一揆中死亡，武田遗领在一时之间成为无政府状态。