弗雷从政后，积极推动智利民主化进程，1988年他创建了促进自由选举委员会，在当年10月举行的公民投票中，弗雷投了反对票，反对奥古斯托·皮诺切特继续出任总统，在1989年12月举行的总统大选及议会选举中，弗雷作为圣地亚哥选区候选人以高票当选为参议员，1990年3月11日，弗雷正式就职参议员，任期8年，1991年11月23日~1993年5月3日担任智利基督教民主党主席。

1993年，弗雷在民主联盟内部的总统候选人竞选中，以60%的选票击败里卡多·拉戈斯·埃斯科瓦尔，弗雷被以基督教民主党为主体的民主联盟推举为当年的总统候选人，参加总统竞选。在当年12月11日的总统竞选中，基督教民主党人弗雷获得4040497张选票，占总票数的57.98%，击败独立民主联盟的候选人阿图罗·亚历山德里·贝萨（获得1701324张选票，占24.41%）、独立人士何塞·皮涅拉·埃切尼克（获得430950张选票，占6.18%）、智利生态运动曼弗雷德·马克斯·内夫（获得387102张选票，占5.55%）、独立人士欧亨尼奥·皮萨诺（获得327402张选票，占4.70%）和绿色人文合作候选人克里斯蒂安·莱兹·坎波（获得81675张选票，占1.17%），弗雷成功当选为智利总统，1994年3月11日正式就职，任期6年。

弗雷执政期间，努力协调军队与文人政府之间的关系，1997年起开始实行义务兵和志愿兵相结合的兵役制度，规定适龄青年先自愿报名服兵役，如名额不满再按义务兵征集。服役期为1年。适龄青年须在每年的1月~9月间进行兵役登记，在校或有特殊原因不能服役的青年，可以推迟服兵役时间，实行职业军官和职业军士制度，军官和军士工作满20年后可享受退役金，总统批准空军花费8500万美元购买29架幻影战斗机；对海军进行现代化建设，政府制定了南美洲最庞大的造舰计划，准备在21世纪头20年，在智利本国建造新的军舰，以逐步代替当前服役的、已经改进过的驱逐舰和护卫舰。

弗雷政府进行了进行司法改革，这是智利100年以来最重要的司法改革，1997年8月，智利议会批准了一项宪法修正案，其内容包括建立一个国家检察院。检察院的建立以及其他一些司法改革，将彻底改变以往拖拉、混乱和复杂的审判制度。

弗雷执政期间，继续保持宏观经济稳定，执政头两年经济增长率超过7%。虽然智利经济在1998年~1999年受到亚洲经济危机的影响有所下滑，但在弗雷执政这6年间，智利经济还是保持了快速增长的趋势，总体运行良好。

私有化政策

加速私有化进程，将瓦尔帕莱索港出租给私营企业，1998年智利政府进一步做出规定：国营港务局下属的10大港口全部对私人资本开放；全国65%的自来水公司将实行私有化；国家电力公司到2000年全部实行私有化。总统宣布国有企业最后将减少到12家或15家。私有化的主要方式有：在市场上公开出售国有企业的股权；把一些国有企业拖欠的债务“资本化”，变成股权，卖给本国或外国投资者；将萨尔瓦多·阿连德·戈森斯总统执政时期国有化的私人企业无偿还给原业主。对于少数仍属于国家所有的企业，政府确定了自主经营、自负盈亏的原则，取消补贴和优惠政策，让它们在市场竞争中改善经营、提高效益。同时政府还采取了一系列相关措施为企业创造良好的发展条件。总的来说，私有化政策取得一定的成效，使私人资本的经营范围扩大，发挥了私人部门的经营积极性，政府的财政负担大大减轻，国库收入增加，私营企业的管理水平和经营效益明显改善。由于外资参与了智利国内企业私有化进程，大量外资的流入对经济的发展起到了积极作用。

吸引外资

积极推进贸易自由化，大力吸引外资，加速智利经济国际化进程。弗雷政府1996年向亚太经合组织提交的单边行动计划中，宣布将全面实行自由贸易的承诺，到2010年将实行零关税，到2020年，将实现商品、劳务和投资领域内全面自由化目标。广泛签署自由贸易协定，1995年与厄瓜多尔、1996年与巴拉圭和南方共同市场签署自由贸易协定，成为南方共同市场的联系国，1997年智利与加拿大、1998年与秘鲁和墨西哥、1999年与巴拿马、哥斯达黎加、洪都拉斯、危地马拉等中美洲国家签署双边自由贸易协定。1999年智利总统弗雷在发表国情咨文说：“我们已经与世界上许多国家建立了稳定的关系，并签署了一系列协定，以支持和深化智利经济国际化的目标。我们不但要维持和巩固这些关系，而且要在充满挑战的国际舞台上完善和发展这种关系。”

改善民生

政府重视解决社会问题，改善人民的生活条件。弗雷政府加大扶贫力度，提出“经济增长、消灭贫困”作为政府的两大目标。制定了几十个脱贫计划，宣布到2000年时，智利将消灭极端贫困，把贫困人口降到占全国总人口18%，政府坚持与通货膨胀作斗争，使通货膨胀率到2000年下降至4.5%。

1994年，爱德华多·弗雷·鲁伊斯-塔格莱政府明确提出，为了提高生产率和成功地走向21世纪，国家要把教育放在第一位。通过教育改革来增加人力资源投资。政府提出教育四大任务，其内容是：1.教学内容现代化。在校学生在整个受教育的过程中，其教育内容要符合智利经济和社会发展的需要。2.教育的实效性。要培育有社会经济头脑的人才，在其结束学业后，就能投身到社会经济发展的实践中去。3.学校特别是中等教育学校要更多的吸收低收入家庭的子女就读。4.改善教育系统的管理，以保证资金的有效使用。

在注重发展教育的同时，弗雷政府还特别强调高等教育改革的重要性。弗雷总统曾在议会一次专门研究高教工作的会议上指出：“我们必须从长远的观点看，在当今世界里，对民族的发展和昌盛而言，知识是如此重要，它赋予高等教育和科学技术以至关重要的地位。为此，从战略决策的角度出发，我们必须为建立新的高等教育和科学技术体系而奋斗。为了保证扩大招生后高等教育的质量，我们必须进一步确定和发展在学术界实施的评估制度。为了高等教育的进一步发展，我们必须寻求新的办法，根据国家需要，通过招标、竞争等方式，吸引民众的兴趣，把公共资金和私人资金很好地结合起来，以解决高等院校的财政问题。此外，我们还必须做好工作，使高等教育的发展同民族和地区的发展紧密结合。”为了提高教育的质量，90年代智利着重对高等教育进行了重大改革。除对高等教育进行改革外，智利还对初、中等教育进行深入改革：实行全日制，使每周课时增加约20%。到2002年，所有学校都必须这样做。届时，政府将对实施全日制的学校增加补贴。

弗雷执政期间，制定的外交政策遵循以下几点原则：第一，强调外交政策是一项“国策”，是以实现国家的持久目标为宗旨，应在国内各主要力量取得共识的基础上来制定，以保持外交政策的连续性和稳定性。第二，奉行并捍卫西方世界的价值观，不干涉别国内部事务，捍卫人权的原则高于不干涉原则。第三，遵循现实主义原则，对外交往与国家的资源条件和能力相适应。第四，奉行多元主义。积极发展与政治制度不同的国家之间的关系。第五，实行多样化的、平衡的外交。

智利政府重视同美国的关系，美国亦把智利作为优先考虑发展关系的拉美重点国家之一弗雷执政后，表示愿在平等、公正的基础上同美国保持良好的关系。1994年6月，弗雷总统访问美国，寻求加入北美自由贸易区的途径。12月在迈阿密举行美洲首脑会议时，美国总统威廉·杰斐逊·克林顿宣布同智利开展自由贸易协定谈判。智利能成为北美自由贸易区向外扩展的首选对象国，是智利外交的一大成绩。后因美国国会拒绝授予克林顿总统“快速处理权”，使智利加入北美自由贸易区的谈判多次被推迟。1996年，美国国务卿沃伦·迈纳·克里斯托弗访问智利，智利外交部长何塞·米格尔·因苏尔萨任内两次访美，1997年2月弗雷再次对美国进行国事访问，1998年4月克林顿出席在智利举行的第二届美洲国家首脑会议并访问智利。5月，美国国防部长威廉·科恩访问智利。9月，智利新任国防部长何塞·弗洛伦西奥·古斯曼·科雷亚访美。1999年8月智利外交部长胡安·加夫列尔·巴尔德斯访美，11月智美两国国防部长互访。10月， 智美双方签署了自由贸易谈判意向书。1996年，弗雷总统访问了加拿大，会见了加拿大总理让·克雷蒂安。

弗雷执政后，重视巩固和发展同西欧国家的传统友好关系，积极推动和参加同欧盟的各种贸易谈判。弗雷在执政期间先后访问了英国、法国、西班牙、德国、意大利、比利时、丹麦等西欧国家，弗雷政府先后接待了西班牙国王、芬兰总统、比利时首相、挪威首相、意大利总理等西方国家领导人访问智利。通过互访加强了智利同西欧国家之间的政治、经济关系。与此同时，智利政府还建议本国企业界向欧盟派出常驻代表，以便能及时抓住商机，了解欧洲的贸易和投资动向，从而更好地开拓和利用欧洲市场。1996年6月，智利与欧盟签署了双边合作框架协定，其最终目标是结成一个政治、经济联盟。该合作框架协定包括四个方面内容：1、政治对话。2、促进贸易自由化。3、加强经济特别是投资和劳务的联系。4、在新的领域进行广泛合作。

1996年弗雷总统访问英国，会见了英国女王伊丽莎白二世和英国首相约翰·梅杰，同年智利先后接待了西班牙国王胡安·卡洛斯一世、瑞典国王卡尔十六世·古斯塔夫、英国经济、财政大臣肯尼斯·克拉克的访问，1997年弗雷总统访问了法国，会见了法国总统雅克·希拉克，芬兰总统马尔蒂·阿赫蒂萨里、比利时首相让-吕克·德阿纳于同年访问智利，1998年，弗雷总统访问了西班牙并出席了在葡萄牙波尔图召开的第八届伊比利亚美洲首脑会议，会见了西班牙国王胡安·卡洛斯一世、西班牙首相何塞·马里亚·阿斯纳尔·洛佩斯、葡萄牙总统若热·桑帕约和葡萄牙总理安东尼奥·古特雷斯，同年智利接待了瑞典首相约兰·佩尔松、荷兰首相维姆·科克、挪威首相谢尔·马格纳·邦德维克、西班牙首相何塞·马里亚·阿斯纳尔·洛佩斯和意大利总理马西莫·达莱马的访问。当年智利同法国签署了《军事合作条约》；同荷兰签署了《投资保护协定》；同意大利签署了两国政府间《社会保障协议》。1999年3月，弗雷总统对法国进行了正式访问，并出席在巴黎举行的泛美开发银行第十四届年会，会见了法国总统雅克·希拉克、法国总理利昂内尔·若斯潘4月出访了德国，会见了德国总理格哈德·施罗德和德国总统罗曼·赫尔佐克，同月，智利——欧盟自由贸易谈判宣布启动，之后弗雷总统访问了意大利、比利时和丹麦，会见了意大利总理马西莫·达莱马、意大利总统卡洛·阿泽利奥·钱皮、比利时首相居伊·伏思达、比利时国王阿尔贝二世、丹麦首相波尔·尼鲁普·拉斯穆森和丹麦国王玛格丽特二世。

1998年10月，应西班牙法官巴尔塔萨·加尔松等人的要求，智利前军事领导人奥古斯托·皮诺切特在英国伦敦就医时被英国警方扣留。加尔松指责皮诺切特在军政府期间杀害了数百名西班牙人，拟将其引渡到西班牙受审。弗雷政府曾多次与英国和西班牙交涉，并利用出席联合国等国际会议机会表明，智利维护国家司法主权、反对外来干涉的坚定立场，要求英国放皮诺切特回国并由智利司法机关审理。2000年1月，英国政府以皮诺切特身体状况恶化，不宜将其引渡至西班牙受审为由，3月2日将皮诺切特释放回国。

弗雷政府重视发展同东欧和俄罗斯之间的关系，1996年，捷克总统瓦茨拉夫·哈韦尔、保加利亚副外长科里斯分别访问智利。1997年，智利外长何塞·米格尔·因苏尔萨访问克罗地亚、乌克兰和俄罗斯。同年，匈牙利外长科瓦奇·拉斯洛首次访问智利，两国签署了《鼓励和相互保护投资协定》。智利还同乌克兰和俄罗斯签署了《空间技术合作协定》。1998年，智利先后接待斯洛伐克、斯洛文尼亚和罗马尼亚等国外长访问。1999年3月~4月，弗雷总统先后对捷克、波兰进行国事访问，会见了捷克总统瓦茨拉夫·哈维尔和波兰总统亚历山大·克瓦希涅夫斯基，并接待乌克兰外长访问智利。2000年，智利同俄罗斯的贸易额为1.21亿美元，与该地区其他国家的贸易额相差不大。

弗雷执政期间，重视同拉美国家间的关系，与拉美国家的经贸关系不断发展，1998年，弗雷总统先后出访了哥斯达黎加、巴拉圭、巴拿马、萨尔瓦多、巴西和阿根廷等国，并接待了厄瓜多尔、秘鲁、巴拉圭、墨西哥等国总统的访问。1995年智利与厄瓜多尔、1996年与巴拉圭、1998年同墨西哥签署了自由贸易协定。

重视地区性政治协调，1995年，智利同秘鲁签订了《经济互补协定》，从而完成了同所有南美国家双边和多边的自由贸易谈判进程，同时正式启动了与中美洲的自由贸易谈判，1999年同巴拿马、哥斯达黎加、洪都拉斯、危地马拉等中美洲国家签署双边自由贸易协定，这是中美洲国家与南美洲国家签署的第一个自由贸易协定。

1995年4月，智利同古巴恢复了中断近22年的外交关系，之后智利同古巴签署了《部分商品特惠关税协定》。1996年12月，智利与阿根廷签署了《两国关于南部冰区协定》议定书。1998年，智利总统弗雷访问了阿根廷，会见了阿根廷总统卡洛斯·萨乌尔·梅内姆，同年与秘鲁签订了《经济互补协定》。1999年，智利同阿根廷解决了最后一个领土纠纷——南部大陆冰川，同年智利还与秘鲁签署了1929年和平条约的执行协议及补充协议，解决了多年来两国间就该条约有关条款的遗留问题，智利还同古巴在拉美自由贸易协会框架内签署了部分协议。重视同南共市各国的关系，1996年6月，智利与南共市正式签订了《自由贸易协定》，于当年10月1日生效，智利成为南共市的联系国。1997年12月，在南共市首脑会议上智利被接受为准成员囯，全面参与南共市各个机构的工作和一切政治活动。1998年7月，智利与南共市举行经济合作协议管理委员会会议，决定加快贸易自由化进程，建立必要的检查机制。1999年6月，弗雷总统参加在巴拉圭首都亚松森举行的南共市首脑会议上表示，由于南共市国家间经济金融政策方面缺乏进展等原因，智利还不愿成为南共市成员国。1999年6月28日~29日，弗雷总统出席了在巴西里约热内卢举行的首届欧盟-拉美国家首脑会议，因苏尔萨外长出访了委内瑞拉；巴尔德斯外长访问了阿根廷。8月，弗雷总统先后对厄瓜多尔、哥伦比亚进行了正式访问。12月，弗雷出席了阿根廷总统权利交接仪式，并接待了阿根廷、秘鲁总统的访问。巴尔德斯外长表示，将在出席下届里约集团会议期间就包括出海口等双边关系问题与玻利维亚外长进行磋商；2000年，弗雷总统实现了34年来智利总统首次对秘鲁的国事访问，会见了秘鲁总统阿尔韦托·藤森。

弗雷政府重视同亚太地区国家的关系，把加强同亚太地区的关系放在其外交的重要位置，弗雷政府认为21世纪将是太平洋国家的世纪，发展同该地区的关系对智当前和长远经济发展都具有重要战略意义。1994年11月智利成为亚太经合组织成员国，弗雷总统先后访问了澳大利亚、印度尼西亚、日本、韩国、菲律宾、马来西亚和中国。会见了澳大利亚总理保罗·基廷、印度尼西亚总统苏哈托等领导人，印度总统尚卡尔·达亚尔·夏尔马、马来西亚最高元首端古·加法尔·伊卜尼等先后访问智利。1996年韩国总统金泳三对智利进行了国事访问，这是历史上韩国总统首次访智。日本首相桥本龙太郎访问智利，成为37年来第一位访智的日本首相。弗雷总统在1996年11月25日出席了在菲律宾苏比克举行的第四届APEC领导人非正式会议，并访问了新加坡，会见了新加坡总理吴作栋。1997年智利承办了太平洋经济理事会第十二届大会、亚太基础设施建设部长论坛等一系列会议。为庆祝智日建交100周年，弗雷总统率领160人的大型代表团访问日本，再次会见了桥本龙太郎，接待了马来西亚总理马哈蒂尔·穆罕默德和日本王子访智。1998年，弗雷总统出席了在马来西亚首都吉隆坡召开的APEC首脑会议，智利接待了新加坡总理吴作栋、日本外务大臣高村正彦等访问。当年智利正式启动了同韩国的自由贸易谈判，这是智利首次同亚洲国家进行此类谈判。5月，智利举办了第十三届太平洋盆地经济理事会会议。1999年9月11日，智利总统弗雷出席在新西兰奥克兰召开的亚太经合组织第七次领导人非正式会议，会议期间与韩国总统金大中举行了会谈。双方就签署两国自由贸易协定达成一致意见，将进一步加强和扩大两国间的经济合作，推进双边贸易自由化。这是第一个拉美国家与亚太经济合作组织中亚洲成员国之间的谈判。对此，弗雷给予高度评价：他认为韩国在拉美选择智利，意味着其他亚洲国家也将对智利产生兴趣，这是极其重要的。接待了新西兰总理珍妮·希普利、泰国总理川·立派和菲律宾总统约瑟夫·埃杰西多·埃斯特拉达的访问。因苏尔萨外长访问了中国和韩国。巴尔德斯外长出席了在加拿大多伦多举行的美洲自由贸易协定部长级会议，与加拿大签署了加快双边自由化协议。同韩国、新西兰等国的自由贸易也以启动。智利还作为拉美协调国努力促成东亚－拉美论坛首次高官会晤在新加坡举行。

弗雷就任总统后，表示要继续加深与中国的关系。1995年11月，弗雷总统访问中国。1996年李鹏总理访问智利。通过一系列的高层互访，特别是两国国家元首的互访，智利、中国之间大大加深了相互了解，签署了多项合作协定，建立了两国外交部长之间的政治磋商制度以及经济贸易混合委员会、科技混合委员会等常设机构，两国关系进入到一个全面发展的阶段。

弗雷政府努力开拓与非洲的合作。1997年10月，智利同博茨瓦纳建立了正式外交关系，成为智利在非洲建交的第27个国家。智利政府还接受了南非副总统塔博·姆武耶卢瓦·姆贝基的来访，这是历史上首位南非副总统对智利进行的访问，也是自南非自非洲人国民大会执政以来对智利进行的最高级别的访问。1998年弗雷总统访问了南非，会见了南非总统纳尔逊·曼德拉，并同南非签署了《促进与保护投资协定》、《禁毒合作协议》、《建立政治磋商机制谅解备忘录》。

2000年3月11日，弗雷总统任期期满，卸任总统职务，根据当时宪法规定，弗雷成为终身参议员，2005年终身参议员条款被取消后，弗雷参加了2005年~2006年的总统和议会选举，他作为洛斯里奥斯大区（河大区）代表，再次当选为参议员，2006年3月11日正式就职，任期8年，弗雷2006年3月11日~2008年3月11日担任参议院议长，2008年12月，弗雷被基督教民主党推举为2009年~2010年总统大选候选人，弗雷作为基督教民主党候选人参加总统竞选，12月14日，第一轮竞选结果公布，智利民族革新党候选人塞瓦斯蒂安·皮涅拉获得3074164张选票，占总票数的44.06%，基督教民主党候选人弗雷获得2065061张选票，占总票数的29.6%，两人得票数居前两位，由于在第一轮选举中没有人获得绝对多数选票，得票数居前两位的候选人进入第二轮选举，2010年1月17日，竞选结果公布，弗雷获得3367790张选票，占总票数的48.39%，皮涅拉获得3591182张选票，占总得票数的51.61%，弗雷不敌对手皮涅拉。大选失利后，弗雷向皮涅拉发出祝贺，2010年9月，弗雷出席纪念智利独立200周年庆祝活动，2014年3月11日，弗雷参议员任职期满，当年4月24日，弗雷被米歇尔·巴切莱特总统任命为智利驻亚太地区特命全权大使。

弗雷在卸任总统后，以智利参议院议长和智利政府亚太事务特命全权大使等身份多次访华，时常奔走于智中两国之间，力求加强中智两国间的政治和经贸关系。

2019年8月29日，国家发改委副主任宁吉喆会见了智利驻亚太地区特命全权大使爱德华多·弗雷，双方就中智在“一带一路”框架下各领域合作等议题交换了意见。

2019年10月6日，智利现任亚太事务特使爱德华多·弗雷接受中央广播电视总台国际在线记者的专访。弗雷在接受采访时表示，新中国70年取得的辉煌成就让全世界受益。

弗雷所获得的荣誉有：智利功绩勋章、贝尔纳多·奥希金斯勋章、秘鲁共和国大十字太阳勋章、克罗地亚共和国托米斯拉夫国王勋章（1994年）、意大利共和国功绩勋章（1995年）、马来西亚皇室荣誉勋章（1995年）、波兰共和国大十字勋章。

弗雷1967年同玛尔塔·帕特里夏·拉腊埃切结婚，两人共有4个子女，分别是维罗妮卡·弗雷·拉腊埃切、塞茜莉亚·弗雷·拉腊埃切、玛格达莱娜·弗雷·拉腊埃切、卡塔丽娜·弗雷·拉腊埃切。

弗雷喜欢文体活动，爱好歌剧和探戈音乐、足球及高尔夫球运动；此外，他还是马德里俱乐部（以推动民主进程的政治家为主要成员）的成员。