真蕨亚门厚囊蕨纲比较原始的一目，根状茎和根为肉质，叶二型，一至数枚，单一或多回羽状分裂，均出自总柄，在总柄的顶端（有时在叶轴下部），生出穗状或复穗状的孢子囊穗，它们是由许多圆球形的孢子囊聚生而成的，其孢子囊壁由数层细胞构成，是原始的性状之一。

陆生，少有为附生的草本植物；根状茎肉质，不被鳞片，有不分枝的肉质粗根。叶片一至数枚，孢子叶与营养叶分开，但下部有一共同的总柄，直立，少有下垂，营养叶单叶或为多裂复叶，或掌状分裂，无柄或有柄；孢子叶有柄，穗状或复圆锥状，孢子囊沿囊托边缘两列着生或周围着生，裸出，大形，无柄或有短粗的柄，不具环带，自顶端横裂或纵裂；孢子同型，四面形或两面形，淡黄色或无色透明。配子体土下生，管状，通常无叶绿素，并有内生菌根。