马芳任宣府游击时，重立“军战连坐法”，规定临战畏敌不前者，后队斩前队，将领畏敌不前者，士兵斩将领，每战依旧率先冲杀敌阵，引得属下殊死效命。嘉靖三十一年（1552年），马芳又向兵部上奏，提出“尽遣宣府客兵，以乡人守乡土，可得虎师。”朝廷采纳此议，在山西当地征募青壮从军，马芳更认定“兵之优劣，重在选练之效”，不但在军中制定严格的赏罚管理训练条例，招募当地拳师以及蒙古降兵为教官，更常在训练中“亲执械示范格杀”。针对明朝军中将官刻薄虐待士卒的陋习，马芳调任宣府游击时，便曾命亲兵在军中秘查，先后惩治虐待士兵克扣军饷的将官二十多人，一时间“军纪大振”。升任总兵后，他更颁布严格条令，规定将官有虐待士卒者，要处以至少八十军棍的刑罚，有克扣军粮者，不但大刑伺候，财产更要充公。为阻止当地权贵擅调士兵充奴婢，马芳竟对山西某权贵“拔刀怒向”，终迫使其归还被征调的士卒三百余人。马芳还从麾下的士兵里挑出数十名最精壮的人，组成“家兵”，这支部队，在以后的数场战争中发挥了巨大的作用。

马芳曾对兵部尚书赵锦言，明军较之蒙古军，有三“不可比”：一为蒙古军“天生骑射，弓马娴熟”；二为“来去迅即，顾此失彼”；三为“居无定所，进退自由”。为解决这三“不可比”，他并非像当时其他边将那样建议以守为主，靠修筑边墙来阻遏敌人进攻，相反却创造性思维，提出了“以骑制骑”的作战思路。即先是结合南宋吴玠的“叠阵法”，发挥明军在火器技术上的优势，为边镇骑兵大规模装配火器，作战中火枪骑兵，骑射兵，刀兵相互配合，反复冲杀，以此“可补骑射之短也”。明朝骑兵大规模装备“三眼铳”、“五眼铳”等连发火器，正是从此时开始。而在作战思路上，马芳更将“以快制快”发挥到极致，主张每年冬春之季，派遣精锐骑兵组成小分队对蒙古草原进行反突击，以劫掠马匹和焚烧草场为作战目标，最大限度摧毁蒙古人的作战资源，而当蒙古军南下侵扰时，切忌闭关消极防守，而是要以长途奔袭，断绝蒙古军后路，聚歼蒙古军有生力量为目的。诚如他自己所言：“克掳之道，重在料敌先发，敌欲动我先动，以我火器骑射之长，克敌弓弩骑射之短，重创敌于塞上，方为制胜之法也。”

马芳的提议引起朝野的纷纷侧目。早在任参将的时候，御史夏阳就曾弹劾他“骄兵悍将，邀功贪战。”对其“以骑制骑”的战法，兵部侍郎赵应奎更斥为“沽名钓誉，不识边务。”论为官，马芳却颇为清廉，宣大总兵仇鸾在任时，山西当地将官每逢过年都要按惯例送礼，美其名曰“冬礼”，马芳非但不参与，更常找借口远避之。仇鸾获罪后，继任的宣大总督杨顺每逢蒙古骑兵侵扰时，只会闭关求太平，只在敌人退走后才作态追击，而且他时常命部下屠戮逃难的百姓，割头后剃发冒充蒙古兵以充边功，对此行为，马芳愤然抵制，严令属下“敢有随之杀良冒功者立斩”。因他清廉不冒功，仇鸾在时，曾夺他奇袭俺答汗之功；杨顺在时，也曾牵连他因“坐连战败”而罚俸。马芳虽看似不懂人情，实际上颇有见识。他不“孝敬”仇鸾，因他深知仇鸾“性桀骜贪暴，势难长久也。”抵制杨顺“杀良”，更因他明白此举“必招怨怒，从之亦难免罪”。事实上，都御史方逢时及几任的兵部尚书王邦瑞、赵锦等皆与他交好，后来担任宣大总督的名将王崇古更将马芳“引以为知交”。

马芳每镇守一地，除悉心练兵防御外，更留心搜集当地珍奇土特产，用以馈赠各位“上级”，因此，他每每选将练兵，整饬军备，都“精兵良械优给之”。权臣严嵩之子严世蕃同样颇为忌惮马芳，曾告诫杨顺道：“（马芳）虽表面憨鲁，实心细如发，更兼胸怀韬略，不可引之为仇也。”

而在此时，俺答汗自嘉靖三十年（1551年）重开战端后，连年侵扰明朝边境，摧毁边镇堡垒无数，特别是嘉靖三十二年（1553年），他竟从二月至十月，连续对明朝宣府、大同、延绥、宁夏、甘肃五大军事防区进行掠夺式侵扰，所过之处“军堡尽毁，府库尽遭掠，黎民流离被掳者无数”。期间，明军总兵、参将、指挥等大小各级军官战死者数十人，军队损失惨重。

与此同时，马芳开始反击。嘉靖三十四年（1555年），俺答汗故伎重演，绕过宣大防线，率骑兵再次闪击至明朝京城外围的怀柔地区，一时间京师大警，数万援军畏惧俺答汗兵威，纷纷观望不敢战。危急之下，还是参将的马芳慨然出击，率麾下两千精骑在保安（河北逐鹿）与俺答汗军血战，是役马芳军“奋勇跳荡，生猛敢战”，杀得俺答汗部后退十数里。横遭重击的俺答汗不知明军虚实，立刻下令全军北撤。此战中马芳身负五处刀伤，坐骑也被射杀，可谓以命相搏，明世宗朱厚熜听闻后感叹道：“勇不过马芳。”而蒙古军中也深知马芳威名，尊称他为“马太师”。马芳之勇猛，从此一战成名。

嘉靖三十六年（1557年），屡立战功的马芳暂离山西，升任蓟镇副总兵，这次他的主要对手，换成了长期侵扰明朝东部边陲的蒙古土蛮部，马芳刚一到任，土蛮即发动十万骑兵南下侵扰，马芳一面命他的“家兵”从侧翼打击蒙古军，一面与总兵欧阳安一道在界岭口迎敌，一番激战，杀得土蛮前锋暂退且俘获多人，审讯时有蒙古俘虏盯着马芳道：“马太师也！”马芳闻言，立刻“免胄示之”。得悉对手正是数度重创蒙古骑兵的马芳，十几万土蛮骑兵立马仓皇北撤。土蛮刚撤军，俺答汗又卷土重来。同年六月，俺答汗侵扰河北地区，因时任蓟辽总督的王杼指挥无方，导致明军全线崩溃，遵化、玉田等重镇相继沦陷，马芳率领骑兵长途奔袭，在金山寺一战里重创蒙古骑兵，再次迫使俺答汗北撤，但战后追究败因，马芳以“抗敌不力”的罪名被剥夺副总兵一职，贬为都督佥事。

嘉靖四十年（1561年），马芳移守宣府，再次与俺答汗正面对抗。八月，俺答汗南下侵扰，与以往分散式骚扰不同，这次他改为“重点打击”，兵锋直逼山西地区。明军当地部队却纷纷溃退，身在宣府的马芳却决心先发制人，在俺答汗部南下之初，即侦之其部队动向，经反复筹谋，终定下从宣府奔袭至山西，给俺答汗以重击的方略。副将赵勇担忧此举风险太大，且山西并非宣府防区，“观望”可免责，一旦失败即罪不容赦。马芳不听，率军连夜急行军五百里，抵达大同外围，终于捕捉到了俺答汗主力，此时正是凌晨，马芳并不急于进攻，还是先以其精锐“家兵健儿”为先导，趁夜色潜入蒙古军营中放火。继而马芳领军奋勇冲杀，在正面对蒙古军发起强攻，猝不及防的俺答汗果然大溃，明军以死相拼，是役蒙古军“惊慌失措，相互踩踏死者无数”。但面临突发局面，俺答汗却果断应对，他冷静的整合兵马，命令部队交替掩护撤退，且亲自留队断后，经殊死搏杀，终于成功的顶住马芳的强攻，安然抽身北退。不甘心的俺答汗小退二十里，与马芳相持。

初战告捷，马芳乘胜追击，率部持续进逼俺答汗，意图复仇的俺答汗连续在兔儿岭、饮龙河等地与马芳接战，马芳手下的宣府精骑反复拼杀，刀兵、火枪兵、骑射手波浪般来回纵马冲击，火枪与铁骑相互配合冲锋的战术，令只善骑射的蒙古军接连受挫，整齐划一的冲杀与轰鸣呼啸的火枪弹丸下，蒙古骑兵纷纷被打落马，几次接战皆伤亡惨重，但俺答汗的军队毕竟训练有素，每遇战事不利的情况，随即能够发挥机动性优势，通过交替掩护的方式安然撤退，随后连续五战，马芳虽节节胜利，却始终不能重创敌人。俺答汗且战且退，渐退至明朝边境的怀安地区，俺答汗意图绝地反击，先以小股骑兵诈败诱使马芳轻进，企图将马芳诱引至塞外草原，再发挥蒙古骑兵的机动力聚而歼之，马芳果然率部突进，俺答汗大喜，正欲合围歼之，却见蒙古军两翼突现明军。原来，马芳早安排他的“家兵健儿”从侧翼突进，在战斗打响后将蒙古军拦腰斩断，一场原本俺答汗计划内的伏击战，反成了明军的歼灭战，此战“持续昼夜，格杀甚烈”，马芳本人依旧身先士卒冲荡敌阵，冲杀间竟然“马刀砍损三把”，经一夜恶斗，终于击败了俺答汗。战后，世宗复加马芳为左都督，擢升为宣府总兵官。

马芳升任宣府总兵后，为实现“先发制人”，多年来时常命亲兵化装混入被蒙古军掳走的逃难百姓里，趁机混入蒙古军中“卧底”，对俺答汗所信任的叛将们，马芳也苦心策反，先后发展了多位“线民”，并借机派细作混入其中。这些被马芳派去“潜伏”的人，此后都将各类重要情报送回。因此马芳对于蒙古部落特别是俺答汗部的活动情况了如指掌，《明史》称他“有胆智，谙敌情。”而王崇古就任宣大总督伊始，曾与马芳一道商讨战事，事后大赞道：“胡骑来去虽快，却难逃马桂馨（马芳）耳目。”

凭借正确的情报，马芳逐渐大胆实现他“先发制人”的战略，从担任参将开始，马芳就开始着手组建隶属于他的“家兵”。每当俺答汗进犯的情报送来后，马芳立刻将他的“家兵”散布在明蒙交界的边境线上，组成数支三十至四十人的“小分队”，当俺答汗大举进犯后，马芳的“家兵”立刻全线出动，对蒙古人的后方进行疯狂的报复性攻击，或抢夺马匹，或焚烧草场，或袭击俺答汗的辎重粮草，与马芳的主力部队前后夹击，粉碎俺答汗的入侵。担任宣府总兵后，马芳更加胆大，除了每年频繁的侵扰俺答汗，更多次组织主力部队，对边境蒙古部落发动大规模的惩罚性袭击，史载他“或躬督战，或遣婢将”，每年“数出师捣巢”，多次“多所斩获，寇大震”。规模最大时，马芳亲率大军奔袭四百里，捣毁内蒙古兴和地区的蒙古部落后，竟在当地旧堡垒遗址上“登高四望，耀兵而还”。但在嘉靖四十二年（1564年）时，马芳率主力出击内蒙北沙滩，意图重创俺答汗主力，但俺答汗却巧妙绕开马芳兵锋，奇袭马芳辖区宣府，攻破重镇隆庆，事后马芳因“坐寇入”之罪遭朝廷严斥，被夺去左都督职务。念及往昔战功被令“戴罪立功”。

自马芳担任宣府总兵后，俺答汗的侵扰重点，就逐渐转向延绥、宁夏、甘肃等地区。受马芳影响，延绥总兵赵苛，大同总兵姜应熊等边将也屡次主动出击，对蒙古部落发动反攻，虽然有胜有败，但忌惮明军反扑的俺答汗终不敢如往昔那般长驱直入，再加上蒙古部落连续数年频遭雪灾，导致俺答汗数次南侵皆损失惨重，渐渐陷入颓势。

主词条：万全右卫之战

为扭转局面，嘉靖四十五年（1566年）七月，俺答汗集结十万骑兵，以其长子辛爱黄台吉统帅，发动了对明朝边境重镇万全右卫（今河北万全镇）的大规模攻击，马芳也因此迎来了他一生中最凶险一战—马莲堡会战。

万全右卫是明朝宣府西路长城的要冲，在明蒙战争中，它既是遏制蒙古军攻势的战略要地，更数次挫败蒙古军入侵。但俺答汗竟一次动用了十万精骑的重兵，一旦万全右卫沦陷，俺答汗此次南侵就将无后顾之忧，不但河北地区会惨遭涂毒，京城安全也将受严重威胁。

战事爆发后，明朝迅速做出反应，兵部尚书杨博急命固原、延绥、宣府、大同、蓟镇五大总兵率精锐驰援，马芳率宣府军在正面迎击蒙古军主力，蓟镇援军从侧翼夹击，大同、延绥、固原三镇精兵于山西天成、阳和地区设伏，意图聚歼蒙古军主力。

而担任正面迎击的马芳，恰是明军战略中的关键棋子，但马芳率一万精兵刚刚赶到万全右卫北面二十里的马莲堡，即与蒙古军侦骑遭遇，继而蒙古军十万主力部队火速扑来，敌众我寡下，有副将建议立刻南撤，与万全右卫守军会合后再战，马芳断然拒绝道：“今敌气势正盛，避之必覆没，唯痛击也。”当即下令全军在马莲堡设防，升起“马”字战旗，与蒙古军针锋相对。此时大同、延绥、固原三镇援军相距遥远，蓟镇援军尚在途中，万全右卫守军兵力单薄，马芳所在的马莲堡，已是彻头彻尾的“绝地”。慑于马芳的威名，蒙古军未敢立刻发起强攻，仅派小股骑兵连续试探，马芳镇定自若，坦然应对，命令部下大张旗鼓，摆出数万精兵坐镇的假象。不明虚实的蒙古军不敢近前，仅用硬弩和土铳不断轰击，双方对峙至下午。这时，年久失修的马莲堡城墙在蒙古军的攻击下又突然坍塌，正当马芳的部将正慌忙修缮城墙时，马芳却断然制止，相反命令全军偃旗息鼓，甚至对蒙古军的骚扰也不再还击，一时间全军摆出了“空城计”的态势。

入夜后，为试探马芳虚实，蒙古军大张旗鼓摆出全面进攻的架势，甚至点起火把彻夜呐喊辱骂，一时间“野烧蚀天，嚣呼达旦”，马芳却不慌不忙，命部下堂而皇之打开马莲堡城门，自己却在军帐里安然静坐，对蒙古军的挑衅充耳不闻。虚虚实实下，蒙古军果然上当，叫嚣整夜，却不敢贸然进攻。“空城计”终为马芳赢得了宝贵的反击时间，次日上午，马芳亲临阵前观察，判定蒙古军正准备撤退，马芳立刻下令全军追击，先命火器齐轰，然后全军出击，明军“喊杀冲突，悍勇不可挡”。猝不及防的蒙古军再次大溃，不但被马芳追杀数十里，更被赶进了明军早已设伏良久的大同，延绥两镇精兵乘机出动，一路奋勇追杀，“沿途斩首俘获甚重”，俺答汗再次大败。此情此景，诚如战后在杨博的奏折中所言：“此役同仇敌忾，追歼逐北，其酣畅淋漓，为九边罕见也。”对马芳，杨博更赞不绝口，称其“以汉李广之智勇，首挫寇之兵锋，当为头功也。”

万全右卫之战胜利后五个月，世宗驾崩，其子明穆宗朱载垕登基即位。穆宗即位初期颇有作为，对北部边防大力整治，而马芳也复职左都督。

隆庆元年（1567年）正月至四月，俺答汗连续对蓟镇、宣府、大同、固原诸重镇发动了七次侵扰，明军严防死守，皆迫使俺答汗无功而返。受挫之下，俺答汗依其属下献策，经仔细筹谋，命其子辛爱于隆庆二年（1568年）十一月率五万骑兵佯攻蔚州，待马芳中计出击后，再派精锐骑兵乘虚攻击宣府，企图重演嘉靖四十二年闪击宣府的先例。但马芳并未中计，当蒙古军奔袭至宣府后，不但见宣府重镇已经严阵以待，马芳更砍伐周边树木在城墙周边环列成栅栏，组成一道遏制蒙古骑兵突击的防线。俺答汗见状，只得率军北撤。马芳却仍率军尾随追杀二百里，终于在长水海大破俺答汗主力。

俺答汗在马芳回师后，立刻集结重兵，再次发动进攻。俺答汗兵锋逼近时，马芳尚在吃饭，闻讯后马芳当即“掷碗碟于地”，对众将大呼“且随我夺虏食”，立刻率兵出战，在内蒙古鞍子山与俺答汗军相逢，再次击破俺答汗，迫使其撤还。战后，马芳命人烹制美食，与此战中阵亡将士的尸骨一起下葬。时任宣大总督的陈其学闻之感叹道：“爱兵如此，方有虎师也。”

宣府遇挫后，俺答汗转而对邻近宣府的大同地区发动进攻。而宣大总督陈其学判断失误，命大同总兵赵苛将重兵屯守在紫荆关，虽一度击退敌军，却反被俺答汗避实击虚，绕开紫荆关攻入怀仁、山阴等地区。陈其学在盛怒之下，命时任宣府总兵的马芳与大同总兵赵苛换防，让马芳率军防备俺答汗，而俺答汗却转而强攻宣府管辖的威远地区，待到马芳率军驰援时，俺答汗又率军北撤。

面对俺答汗的侵扰，马芳决定主动出击，如他对诸将所言“非大创之不可”。隆庆四年（1570年）六月，马芳探知俺答汗将主力屯于咸宁海子（今内蒙古商都），随即集中全部主力出击，战前马芳严令三军，全军弃掉辎重物资，每人仅带三日口粮，以示死战之心。四月七日，全军开拔，一路上“人噤声，马衔枚”，悄无声息高速急行军，在四月八日抵达咸宁海子外围时，俺答汗竟毫无察觉。四月九日，凌晨马芳发动总攻，先以火器攻击，马芳的“家兵”从俺答汗大营两翼奇袭，马芳率主力正面突击，另有一支精骑在俺答汗逃路上截杀，俺答汗再次中计，马芳军“四面合围，驰突奔杀。”俺答汗军“仓皇弃营，踩踏砍杀殒命者甚重。”经一夜血战，俺答汗终于不支而逃，明军紧紧追赶，从咸宁海子一路向西追杀数十里。此战俺答汗伤亡甚重，仅被擒的部落首领就有十数人，缴获战马辎重无数，史称“大创之”。 刚刚就任宣大总督的王崇古阅罢战报后当场大喜道：“大同可暂无事也。”

隆庆四年（1570年）九月，因俺答汗强娶其孙把汉纳吉的未婚妻乌纳楚，把汉纳吉一怒之下竟带部下家人数十人至大同投奔明朝。俺答汗闻讯后震怒，立刻率领十余万骑兵杀至大同外围，企图用武力逼迫明朝交出把汉纳吉。但因马芳严防死守，俺答汗丝毫未占到便宜。而王崇古深谋远虑，一面妥善安置把汉纳吉，一面向明朝提议趁机招抚俺答汗。当时主政的高拱、张居正两位大学士皆对此全力支持。偏巧此时俺答汗的长子辛爱虽假意发兵协助俺答汗，其实却按兵不动，企图借俺答汗与明朝血拼的机会谋夺权力。

十月初，在马芳小挫俺答汗后，王崇古派百户鲍崇德为使与俺答汗会谈，经一番辩论，俺答汗终于屈服道“天子若封我为王，统辖北方诸部，我当约令称臣，永不复叛。”得到俺答汗承诺后，双方达成协议：俺答汗向明朝交还之前叛逃至蒙古的赵全等人，明朝册封把汉纳吉为指挥使，礼送回俺答汗处。

十二月初四，俺答汗逮捕赵全、李自馨、王廷辅、赵龙、张彦文、刘天麟、马西川、吕西川、吕小老至明朝，明朝也如约将把汉纳吉礼送归蒙古，为防俺答汗报复，明朝使臣更警告俺答汗“汝孙今为朝廷命官，不可轻辱也。”是日俺答汗与把汉纳吉祖孙俩“相抱而哭，连连南向叩头。”俺答汗更对明朝“遣使报谢，誓不犯大同”。交换人员后，俺答汗主动示好，下令昆都力，吉能等蒙古部落停止对明朝边境的侵扰，王崇古也向明朝廷上奏，建议明朝“以先朝忠顺王故事”册封俺答汗，“许贡入京”，且在边境上开放互市，从而实现明蒙双方的长期和平。虽有朝臣指责王崇古“邀近功，忽远虑”，但因大学士高拱、张居正等人支持，在隆庆五年（1571年）三月二十八日，明朝终于下诏册封俺答汗为“顺义王”，其兄弟子侄部下皆受封都督、同知、千户等官职，在延绥，红山敦，宁夏清水营等地开设“互市”，恢复汉蒙两族边民贸易。

隆庆五年（1571年）五月七日，俺答汗在大同北面的晾马台正式举行“顺义王受封宣誓”的仪式，歃血盟誓道“世世代代，永不复叛”。此誓果然成真，之后不但蒙古其他部落有样学样，以至“河套各部皆求归附”，且“边鄙又安，蓟宣以抵甘固，六十余年边民生息，遂长不识兵革也。”此事结束了明蒙双方的大规模战争，达成了著名的“隆庆和议”。

“隆庆和议”的成功，固然是由把汉纳吉的“叛逃”事件引发，由高拱、张居正、王崇古等人的缜密筹谋而实现，但不容忽略的依然还有马芳，事件起初，正是马芳在大同滴水不漏的防守，创造了双方谈判的环境，王崇古向朝臣解释“封贡”原因的奏折里，也将此时明军兵强马壮，“我兵非昔怯”作为论据。“和议”成功后，王崇古在奏折里大赞马芳“和议之成，芳实有功也”。俺答汗方面，虽然“叛逃”事件里明朝的诚意是他和平的原因，但更重要的原因是，常年的战争状态下，明朝对蒙古部落的“经济封锁”，以及马芳等边将的军事打击后，俺答汗其实已外强中干。

“隆庆和议”成功后，马芳作为大同总兵，在每年五月，都受命率精兵护送王崇古到大同北面的弘赐堡接见蒙古各部首领，宣扬明朝威德，每次马芳部皆“兵甲威武，诸部皆拜服之”。

在明神宗即位后的政治斗争中，原内阁首辅高拱失势被逐，大学士张居正取而代之。随后，身为高拱亲信的王崇古被御史陈堂弹劾“弛防徇敌”，不得不引咎辞职，马芳随后也未能幸免。他担心不能通过阅视，于是贿赂武库司郎中林绍、怀隆及兵备参议吴哲、阅视侍郎吴百朋。吴百朋告发此事，奏请朝廷提审马芳。经杨博说情，神宗于是在万历元年（1573年）革去马芳的职务，勒令他“归家闲住”。

万历三年（1575年）九月，马芳被起用为前军都督府佥书管事。

俺答汗向朝廷索要封赏，并威胁要兵戎相见。万历六年（1578年）九月，朝廷立刻命马芳挂印，充任宣府总兵官。马芳到任后，整治兵马，在宣府郊外率领骑兵举行了数次“游猎”，蒙古各部闻讯后大惊道：“马太师归也。”俺答汗向朝廷“奉表谢罪，痛悔前过。”原本一触即发的兵祸就此消解。

万历七年（1579年），马芳因病请辞，于次年闰四月解甲归乡。

万历九年（1581年）二月，马芳在家乡蔚州逝世，享年六十四岁。神宗闻讯后，按例赐祭葬。

马芳为帅十余年，大小百余战，多次获胜，尤善以少胜多。《明史》言其“大小百十接，身被数十创，以少击众，未尝不大捷。擒部长数十人，斩馘无算，威名震边陲，为一时将帅冠。”

嘉靖四十五年（1566年），俺答汗的儿子辛爱黄台吉率重兵攻打万全右卫（今万全镇）。在万全右卫保卫战，马芳在马莲堡迎战，在敌人的攻击下，马莲堡城墙塌陷，马芳不但不让人修复，反而令军士大开四门，偃旗息鼓，一时间，马莲堡好像空寂无人一样。这时，天将黄昏，敌人顿生疑虑，怕中了马芳的埋伏，不敢进入，只好在城外打着火把，嚣呼达旦。马芳却在大帐高卧不理。敌军不明情况，终不敢攻城，次日陆续撤军时，马芳率军奋力出击，大获全胜。这是马芳导演的一出“空城计”，充分体现了他的军事指挥才能。

马芳在宣府总兵任上，为抵御俺答汗的侵扰，还亲自督军数千人，出塞砍柴，又与军民共同筑窑烧砖，将残破的宣府城墙修葺一新。他抗击俺答汗的胜利为隆庆时期的茶马互市奠定了坚实的军事基础。

周尚文：汝他日必为能将。

朱厚熜：勇不过马芳。

陈其学：今诸将中如马芳、赵苛、谢朝恩三臣，皆才勇可当一面。

王崇古：胡骑来去虽快，却难逃马桂馨耳目。

杨博：一定大同捣巢之议……至于宣府，亦可仿而行之。盖总兵官马芳，骁勇不减於（梁）震，戮力报国，此其时也。（《覆陕西总督都御史戴才议处番夷疏》）

尹耕：威名万里马将军，白发丹心天下闻。（《秋兴》）

项笃寿：“近有都督马芳者，以骁勇着马，故降敌起健儿，策身三朝，以勋名终。”（《今献备遗》）

张惟贤等：“芳故夷产，勇敢善战，练习夷情，尤善抚餋家丁，临戎对敌，斩馘最多，一时边塞倚之，称名将云。”（《大明神宗显皇帝实录》）

朱国桢：累立功至极品，盖嘉靖末一名将也……公猿臂壮伟，走及奔马……至马公虽始终无异议，而末年以郍吉纳降为非是，坐夺职。夫武人言战是本等事，乃以此课去留，何耶？如此人物，若使文臣知兵有方略者督之，捍奴虏如秋风扫落叶，可以一空。而动多牵制，不尽用，可恨！（《涌幢小品》）

沈德符：先朝西方名将如马芳，滨死犹以不及恢复松山为恨。

钱谦益：观马公出身，堪比仲卿（卫青）之寒微，更兼子卿（苏武）之精忠。

查继佐：时去二祖（朱元璋、朱棣）远，开国与靖难诸战，言之口咋矣。吾难马德馨、石希声（石邦宪）胆气，无所规模，百变不措，有似山怀远（山云）之在宣庙（朱瞻基）中。（《罪惟录》）

张廷玉：①芳起行伍，十余年为大帅。战膳房堡、朔州、登鹰巢、鸽子堂、龙门、万全右卫、东岭、孤山、土木、乾庄、岔道、张家堡、得胜堡、大沙滩，大小百十接，身被数十创，以少击众，未尝不大捷。擒部长数十人，斩馘无算，威名震边陲，为一时将帅冠。（《明史》）②马芳三代为将，父子兄弟先后殉国，伟矣哉！（《明史》）

赵翼：两军相接全恃将勇，将勇则兵亦作气随之，然将亦非恃一人之勇也，必有左右心膂之骁悍者协心并力，始气壮而敢进，将既进，则兵亦鼓勇争先，此将帅所贵有家丁、亲兵也……马芳蓄健儿，尝令三十人出塞四百里，多所斩获。（《廿二史劄记》）

马芳最初任队长时，多次御敌有功，按例应当授官，但他因为父亲非常贫困，将军功全都换成赏赐来奉养父亲。

石州城被鞑靼攻陷后，马芳的副将田世威和参将刘宝因为战败论罪，按律应处斩，马芳主动要求放弃自己的赏赐为二人赎罪，反遭到御史弹劾，朝廷也下诏告诫他。后来田世威官复原职，对马芳很不礼遇，马芳却不与他计较，有见识的人因而颇为称赞他。

马芳一家三代为将，马芳本人为嘉靖、隆庆、万历时期名将。马芳的长子马栋，亦官至都督；次子马林，“更历边镇”，累官至辽东总兵官，后于萨尔浒之战中战死，其子马燃、马熠也于此役中战没。马林另三子马炯、马爌、马飚也均为总兵、同知一级的武将。史称其“父子兄弟并死国难”。

表格参考资料：

马芳死后葬于山西大同北面的新平堡（今山西大同天镇城北五十里）。此后历经战乱，其墓碑与尸骨皆相继流失。

马芳宅院，俗称马芳院，为马芳出生之地，位于山西省晋城市阳城县凤城镇蒿峪村后街4号院内。院内建筑多已塌毁或改建，仅大门内迎面树立的一座青石照壁保存完好。

马芳也是汉族民间信奉的神仙“马王爷”的原型之一。

马芳多次出现于一些曲艺、戏曲作品中，如鼓词《香莲帕》、川剧《鱼鳞阵》、京剧《马芳困城》等。

在《香莲帕》中，马芳在明穆宗时武艺出众而未有际遇，遂至流落京西芦沟桥为寇，后为国丈李良所擒，原拟斩首，经杨波力保始获赦免，举为大同总兵。神宗即位后，杨波被徐赞陷害下狱问罪。马芳闻讯，即自大同发兵围困皇城。神宗不得已，乃应马芳之约交出徐赞，释放杨波。

明长城碑刻“明故特进荣禄大夫前军都督府左都督兰溪马公墓志铭”

张惟贤等《大明神宗显皇帝实录·卷一百九》

查继佐《罪惟录·列传卷十九·武略诸臣列传》

张廷玉等《明史·卷二百一十一·列传第九十九》