鲨齿龙科最早的成员于1亿5400万年的晚侏罗纪时期出现，在白垩纪早期到中晚期，鲨齿龙科与棘龙科是劳亚大陆和冈瓦纳大陆的最大型和最主要掠食动物，在非洲、北美洲、南美洲、亚洲均占据食物链顶端，并且以捕杀大型和巨型的蜥脚亚目恐龙为食，是白垩纪早期到中期的顶级掠食动物。北美洲的高棘龙、亚洲的假鲨齿龙也属于鲨齿龙科。它们的辉煌年代从白垩纪早期的巴列姆阶（1亿2500万年前）一直到白垩纪中期的森诺曼阶末期（9400万年）。

当2006年发现马普龙时，罗多尔夫·科里亚（Rodolfo Coria）与菲力·柯尔（Phil Currie）建立南方巨兽龙亚科，以包含更先进的南美洲物种，这些物种彼此关系更为接近，而离非洲与欧洲物种较远。科里亚与柯尔并未将魁纣龙归类于此亚科，需要更详细的叙述，但根据它们的股骨特征，它们可能也属于南方巨兽龙亚科。经过2013年的重新研究，特别是对魁纣龙骨骼的详细研究，发现魁纣龙和南方巨兽龙以及马普龙的关系更为接近，而离鲨齿龙较远一点，随后，科学界废除了南方巨兽龙亚科，建立了南方巨兽龙族，包括了阿根廷的巨型鲨齿龙亚科恐龙，并将南方巨兽龙、马普龙、魁纣龙分入该族，并且将南方巨兽龙亚科归入鲨齿龙亚科之中，代表着鲨齿龙、马普龙、南方巨兽龙、魁纣龙的亲缘十分接近，并构成了一个血缘关系很接近的演化支。