同年十二月初一日，李从厚在西宫为明宗发丧，并于柩前即皇帝位。他遵照明宗遗命，“以日易月”，服丧二十七天。二十八日，李从厚开始在中兴殿处理政务，并召翰林学士为他讲读《贞观政要》和《太宗实录》。他虽欲励精图治，但却不懂治国之道，处事优柔寡断，且无识人之明。当时，朱弘昭、冯赟自恃有拥立之功，专擅朝政，将李从厚的亲信都排挤出朝廷，又将禁军指挥使安彦威、张从宾外调为节度使，借机掌控了禁军兵权。李从厚虽然不悦，却无可奈何。

潞王李从珂是唐明宗的养子，自幼随父征战，在后唐灭后梁之战中屡立战功，官至凤翔节度使。河东节度使石敬瑭是明宗的女婿，也是战功卓著，深得军心。二人的官位、声望皆在朱弘昭、冯赟之上，因而深受忌惮。当时，李从珂的长子李重吉担任禁军控鹤都指挥使，女儿李惠明（法号幼澄）在洛阳出家。朱弘昭将李重吉外放到亳州任团练使，削去其禁军军职，又将李惠明召入禁中，实际上是作为人质。李从珂见儿子外调、女儿内召，知道朝廷对自己有猜忌之意，心中疑惧不安。

应顺元年（934年）二月，李从厚听从朱弘昭、冯赟的建议，通过枢密院调令对凤翔、河东、成德、天雄四镇节度使进行易地调动，并派使臣监送。其中，李从珂被调离凤翔，改镇河东。李从厚本想借此削弱四镇实力，但因未按朝廷规制下达制诏，引起各节度使的极大不满。李从珂在部将的鼓动下，趁机以“清君侧”的名义起兵叛乱。李从厚忙征调西都留守王思同、护国节度使安彦威、山南西道节度使张虔钊等六镇节度使，联军征讨凤翔，同时将李重吉幽禁于宋州（治今河南商丘）。

同年三月，朝廷派遣的诸道军马汇集凤翔城下，大举攻城。凤翔城低河浅，守备力量薄弱，东西关城接连失守，城中将卒死伤严重。李从珂只得登上城头，自陈战功，哭诉朝廷信任奸佞，无罪诛杀功臣。他恸哭不止，哀感诸军。当时，张虔钊负责主攻城西南，因急于求功，命亲军持刀刃驱逼士卒攻城。士卒愤怒不已，纷纷倒戈反攻。羽林指挥使杨思权、严卫步军左厢指挥使尹晖趁机率部投降李从珂，王思同、张虔钊等六镇节度使大败遁走。李从珂乘胜东进，攻入西都长安（治今陕西西安）。

李从厚得知诸道军马兵败凤翔的消息，不禁惊慌失措，在朝堂上对朱弘昭、冯赟等人道：“先帝辞世之时，朕本无意争夺帝位，都是被诸公所拥立。朕幼年继位，将朝政委托于诸公，对诸公所定的国家大计无有不准。这次兴兵讨伐凤翔，诸公无不自夸，称平叛不足为虑。如今事已至此，诸公还有什么办法可以扭转祸局？如果没有，朕便西去迎接潞王，以帝位相让，如仍不免罪责，纵然是死也心甘情愿。”朱弘昭、冯赟惶惧不安，无言相对。

李从厚遣使宣召石敬瑭（时任成德节度使）入朝，想让他率军抵御凤翔军东进。侍卫都指挥使康义诚打算投降李从珂，请求率京中禁军出征，而马军指挥使朱洪实则主张以禁军坚守洛阳。二人争执不休，皆称对方是想趁机造反。李从厚难辨是非，竟将朱洪实斩首。他倾尽府库，大肆犒赏禁军，并许诺平乱后还有重赏。禁军军士却并不感念皇帝恩德，反而更加骄纵，行军途中肆无忌惮，扬言要到凤翔再领一份赏赐。不久，李从厚又命处死李重吉、李惠明。

李从珂攻破陕州（治今河南陕县）后，传书慰抚京中百官，称自己此番入京只诛朱弘昭、冯赟两族，让他们不要忧虑。而这时，禁军刚行至新安，便已百十成群，争相奔向陕州。康义诚到达陕州境内的乾壕时，麾下仅剩几十人，遂向李从珂请降。李从厚忙命宦官召朱弘昭入宫，商讨对策。朱弘昭却以为皇帝是要追究罪责，投井自杀。京城巡检安从进早有投降李从珂之意，趁机攻杀冯赟，诛灭其族，而后派人将朱弘昭、冯赟的首级送往李从珂军中。

李从厚见洛阳已经无法据守，决定放弃洛阳，逃奔魏州，再图谋复起。他命孟汉琼先行到魏州安排诸项事宜，并让亲信慕容迁率所部控鹤禁军把守玄武门。但孟汉琼一出城门，便单骑奔向陕州，也投降了李从珂。当夜，李从厚从玄武门逃离洛阳，带着五十名侍卫逃奔魏州。慕容迁原本表示会率部随行，但当李从厚出城后却关闭城门，派人与李从珂联络。宰相冯道次日上朝，方知李从厚已经出逃。不久，曹太后命内宫诸司前往乾壕，迎李从珂入京。

李从厚逃奔魏州途中，在卫州（治今河南卫辉）城东数里处遇到了率军入朝的石敬瑭。他将近日发生的变故告知石敬瑭，向他询问兴复之策。石敬瑭托言要与卫州刺史王弘贽商议，将李从厚安置在驿馆中。王弘贽认为李从厚已经没有复起的希望。石敬瑭便指使牙内指挥使刘知远引兵入驿，将李从厚的随从侍卫全部杀死，而后率军赶赴洛阳。李从厚被独自撇在驿馆，后又被王弘贽软禁在州衙中。

应顺元年（934年）四月，李从珂进入洛阳，冯道率百官三次上表劝进。李从珂先以曹太后的名义下诏，将李从厚废为鄂王，两日后在明宗柩前即位称帝。他命殿直王峦（王弘贽之子）前往卫州，弑杀李从厚。李从厚死时，年仅二十一岁。

天福元年（936年），石敬瑭灭后唐称帝，建立后晋。他追谥李从厚为闵皇帝（《新五代史》作愍皇帝），并将李从厚与李从荣、李重吉一同葬于徽陵（明宗陵墓）之中。

天福四年（939年），石敬瑭又在洛阳为唐朝设立五庙，供奉高祖李渊、太宗李世民、庄宗李存勖、明宗李嗣源以及李从厚。

应顺元年（934年）二月，李从厚为削弱藩镇实力，对藩镇节度使进行移镇。他将河中节度使李从璋调往凤翔，担任凤翔节度使；凤翔节度使李从珂调往太原，担任河东节度使；河东节度使石敬瑭调往镇州，担任成德节度使；成德节度使范延光调往魏州，担任天雄节度使。

三月，李从厚对禁军进行调整，将左右羽林军的四十指挥（指挥为编制单位）改编为严卫左右军，又将左右龙武军、左右神武军改编为捧圣左右军。

潞王之乱时，李从厚重赏禁军军士，许诺平乱后每人再加赏钱二百贯。他还表示，如果府库不足，便用宫中锦帛珍玩变价补充。禁军军士却纷纷投降李从珂，希望能获得更重的赏赐。但李从珂称帝后，却因府库空竭减少了对禁军的奖赏。凤翔两军阵前归附的禁军军士每人仅得赏钱二十贯，京中禁军更是只有十贯。禁军军士皆失望无比，后悔地道：“除去菩萨（李从厚小字菩萨奴，而且宽仁软弱如菩萨），扶立生铁（李从珂严苛刚强如生铁）。”

《全唐文》收录有李从厚的诏书五篇：《准优经学出身选任诏》、《令三京诸道祭山川祠庙诏》、《立藩镇神道碑诏》、《禁滞狱诏》、《定夺情限制敕》。

李嗣源，庙号明宗，谥号圣明神武广道法天文德恭孝皇帝。

夏氏，长兴元年（930年）追封为皇后，谥号昭懿。

李从璟（李从审），官至禁军金枪指挥使，李嗣源即位前被元行钦杀害。

李从荣，官至尚书令、天下兵马大元帅，封秦王。长兴三年（932年）欲以武力夺位，兵败被杀。

李从益，封许王。后晋时封郇国公，奉后唐之祀。

李从珂，李嗣源养子，本姓王氏，封潞王。清泰元年（934年）四月称帝，史称后唐末帝。

孔氏，横海节度使孔循之女，封鲁国夫人，李从珂称帝后遇害。后晋时期追谥为闵哀皇后。

李从厚与孔皇后生有四子，但史料未载其名，在李从珂称帝后全部遇害。而据《旧五代史·唐明宗纪》记载，李从厚有一子李重哲，曾在长兴四年（933年）被授为银青光禄大夫、检校工部尚书。

薛居正：闵帝爰自冲年，素有令问，及征从代邸，入践尧阶，属轩皇之弓剑初遗，吴王之几杖未赐，遽生猜间，遂至奔亡。盖辅臣无安国之谋，非少主有不君之咎。以至越在草莽，失守宗祧，斯盖天命之难忱，土德之将谢故也。

欧阳修：愍帝之亡也，穴于徽陵，其土一垅，路人见者，皆为之悲。使明宗为有知，其有愧于重诲矣，哀哉！

司马光：闵帝性仁厚，于兄弟敦睦，虽遭秦王忌疾，闵帝坦怀待之，卒免于患。及嗣位，于潞王亦无嫌，而朱弘昭、孟汉琼之徒横生猜间，闵帝不能违，以致祸败焉。

胡安国：夫潞王非明宗之子也，愍帝真其国矣。所以不终者，身乏股肱，朝无祯干，非其罪也。

蔡东藩：① 明宗既殂，从厚依次当立，名正言顺，本无可乘之隙。且即位仅及数月，无甚失德，亦何至速即危亡，所误者任用非人耳！然观当时卖国诸臣，皆属先朝遗老，是其咎尤不在从厚，而在明宗。② 明宗末年，乱机已伏，不发难于明宗之世，而延及于从厚之身，天或者尚因明宗之逆取顺守，尚有令名，特不忍其亲罹惨祸，乃使其子从厚当之耳。

关于李从厚的遇弑经过，史料记载不一，主要有两种说法：

《旧五代史·卷四十五·唐书闵帝纪》

《新五代史·卷七·唐本纪第七》

《资治通鉴·卷二百七十八·后唐纪七》

《资治通鉴·卷二百七十九·后唐纪八》