·昂布瓦斯的和平

昂布瓦斯的安抚诏书没有让任何人满意，而且难以实施：它禁止在城市中实行宗教改革，而新教徒在许多重要的地方占多数，并且是几个省的主人。

1564年3月，太后开始了对法国的大巡游，向国王的臣民展示他的王国，并让国王了解他的王国。这也使王国得以安宁。行程经过王国最激动人心的城市：桑斯、香槟的特鲁瓦。

游行队伍于1564年4月30日离开法国，前往巴尔公国的首府巴勒迪克，在那里停留了5月1日至9日。在那里，洛林公爵夏尔三世·德·洛林和他的妻子克洛德（法国国王的姐姐）让他们六个月大的儿子亨利（后来的洛林公爵亨利二世·德·洛林）接受了洗礼。夏尔九世和西班牙国王费利佩二世都是孩子的舅舅，他们是小王子的教父。同时统治着西属尼德兰的西班牙国王，由利格尼勋爵和邻近的卢森堡公国总督曼斯菲尔德伯爵代表。凯瑟琳·德·美第奇虽然因儿子夏尔与她最喜爱的女儿克洛德的重逢而感到安慰，但却错过了与她的长女西班牙王后伊丽莎白·德·瓦卢瓦的会面。

然后，王室队伍前往洛林边境的利尼昂巴鲁瓦，然后在5月19日前往第戎，前往索恩河畔的战略城市马孔，以及罗纳河谷：鲁西永、瓦伦斯、蒙特里马、阿维尼翁。

正是在文艺复兴时期的鲁西永城堡里，夏尔九世签署了《鲁西永敕令》，其中有一条规定1月1日为整个法兰西王国一年中的第一天。

经过三周的停留，继续前往普罗旺斯沙龙--太后在那里与她的占星家诺斯特拉达穆斯会面--然后前往普罗旺斯地区艾克斯，普罗旺斯议会所在地。王室随从在1564年的万圣节到达了海耶尔，然后经过土伦和马赛，在那里人们用庆祝活动欢迎他们，然后离开了平定的普罗旺斯。

在朗格多克，年轻的国王经过了蒙彼利埃、纳博讷和图卢兹。在加斯科涅的新教城镇，他受到了恭敬的欢迎，但仅此而已。在1565年3月20日进入的蒙托邦，他不得不就解除该城的武装进行谈判，该城曾抵抗过蒙鲁克的三次围攻。图卢兹和波尔多比较和平，在天主教徒手中。

从蒙德马桑前往巴约纳（6月14日）；太后去那里有两个原因：一是去看她的女儿、西班牙国王费利佩二世的妻子伊丽莎白·德·瓦卢瓦，二是与西班牙谈判一项条约，但谈判失败了。

7月，再次穿越加斯科涅，然后在8月和9月穿越夏朗德河谷。在这些拥有大量新教徒的地区，和平是极其脆弱的，新教徒在适用《昂布瓦斯敕令》时有些不情愿。然而，在任何地方，人们都对国王表现出最大的忠诚度。插曲是在拉罗谢尔（1627年前法国国王的最后一次入境），那里的新教徒很不高兴，而在奥尔良，迎接车队的是一场骚乱。

1566年，国王终于在穆兰停留下来，在那里决定了几项改革。根据大法官米歇尔·德·洛佩斯的提议，《穆兰敕令》对继承权进行了规定，并宣布王室领地是不可分割的。

·不和平

1566年6月在帕米尔，尽管王室进行了安抚，但敌对行动又开始了，新教徒袭击了天主教教堂。天主教的镇压很猛烈：700名加尔文教徒在富瓦被屠杀。

在尼姆和整个朗格多克地区，1567年9月29日，即米迦勒节，发生了米歇尔德事件：天主教知名人士被残忍地杀害了。在新教军队的带领下，孔代亲王路易一世·德·波旁和加斯帕尔·德·科利尼来到了巴黎的大门口。

1567年11月10日，新教徒在圣德尼被阿内·德·蒙莫朗西的康斯特布尔击败，在雅尔纳克和蒙康图被安茹公爵亨利击败。1568年3月23日，孔代亲王与凯瑟琳·德·美第奇在朗朱摩最终签署了和平协议，并在1570年得到圣日耳曼-昂莱和平的确认。

1568年9月25日，夏尔九世在圣莫尔颁布了一项法令，将改革宗教的成员排除在大学和司法机关的办公室之外。

·圣日耳曼的和平

夏尔九世在外交上拉近了与英国和神圣罗马帝国的距离。有些人希望看到法国国王有一天能戴上帝国的皇冠。1570年11月27日，夏尔九世与奥地利的伊丽莎白女大公结婚，她是神圣罗马帝国皇帝马克西米利安二世和西班牙公主玛丽亚的女儿。1571年3月，王后和国王进入巴黎。法国最伟大的艺术家们为精心设计游行的装饰和程序做出了贡献。

这对夫妇有一个早逝的女儿玛丽·伊丽莎白。此外，在八年的时间里，国王得到了母亲凯瑟琳·德·美第奇的容忍，保留了他的情妇，贝尔维尔夫人玛丽·图谢，她为他生了一个私生子，夏尔·德·瓦卢瓦（或称夏尔·德·昂古莱姆），夏尔被封为奥弗涅伯爵（1589年-1619年），随后在1619年成为昂古莱姆的公爵。

因此，夏尔九世是亨利二世和凯瑟琳·德·美第奇的五个儿子中生育了后代的人。

当国王把时间花在打猎上时，母后则在天主教徒和新教徒之间寻求和解。1571年秋天，海军上将加斯帕尔·德·科利尼与国王会面了几天。