正如同大部分东海道本线初设时就已启用或一同启用的车站一样，热田车站也是根据江户时代所建立的驿道宿场之位置而设立，靠近在东海道五十三次中排第41号的宫宿与知名的热田神宫，该地区自古以来即为颇重要的交通要冲。不过，当时作为半田线（今日武丰线）终点站而在1886年时启用的热田车站并不位于今日的站址上，而是位在往南约1.57公里的瑞穗区浮岛町附近。直到1896年时才迁建到目前的位置（离热田神宫入口约500米），并同时改筑为第二代的站舍（目前所使用的站舍则为1982年修筑的第四代）。