癌家族的系谱调查较难进行。最著名的是G家族的调查资料，从1895年发现这个家族高发腺癌（子宫和结肠腺癌），到1913年才首次报告了这个家系，经过80多年共五次系谱调查，直到1976年这一家族几个支系已延续了七个世代共842个成员，从调查结果中得到了腺癌在这个家族中的遗传规律和特征。在此期间也相继报道了其他癌家族。

双生儿法

双生儿肿瘤发病情况的研究对识别遗传因素和环境因素在肿瘤病因中的作用有重要意义。但进行这一研究也有一定困难，因为双生儿在人群中为数不多，而双生儿患癌者更少，但是双生儿法的研究可以提供宝贵的资料。例如77对患白血病的双生儿中，单合子双生儿（MZ）患病的一致率很高，而胃癌和乳腺癌的发病一致率在单合子双生儿（MZ）和双合子双生儿（DZ）之间却无统计学上的差异。双生儿法在肿瘤遗传学研究中的重要性在于：①可以利用单合子双生儿发生肿瘤的一致性来判断遗传因素在各种肿瘤中的重要性；②可以利用双生儿肿瘤发生的不一致性来判断环境因素在肿瘤发生中的作用。

流行病学调查

不同肿瘤在不同的人种、不同的民族、不同的地理环境的流行病学调查是肿瘤遗传学研究中的常用方法。例如白种人中淋巴细胞白血病的发病率远较黄种人高；日本人患松果体瘤比其他民族高11～12倍；黑人很少患睾丸癌、黑色素瘤和皮肤癌，但多发性骨髓瘤的发病率比白人高；中国人鼻咽癌的发病率远较世界上其他民族为高，特别是广东籍汉族人。流行病学调查的结果可以用来绘制各种肿瘤的地理分布图，为肿瘤遗传学的研究提供背景资料，其中移民的肿瘤发病率调查可以提供肿瘤的发生与遗传和环境关系的可靠依据。

细胞遗传学方法

染色体畸变是恶性肿瘤细胞的重要细胞遗传学特征，除常见的超二倍体、亚二倍体、多倍体等染色体数目改变外，还可见到各种类型的染色体结构异常。有些结构异常的染色体可以作为某种肿瘤的特征性染色体，这种染色体称为标记染色体，如慢性粒细胞白血病的Ph1染色体、视网膜细胞瘤的13q-染色体、Burkitt淋巴瘤的14q+染色体和Wilm瘤的11q-染色体等。此外，还可以通过肿瘤细胞染色体核型的统计分析和染色体的消长来观察肿瘤细胞系的演变。

免疫学方法

人类组织相溶性抗原（HLAt）和肿瘤的相关性常被应用于肿瘤遗传学的研究。例如鼻咽癌是一种与HLA抗原密切相关的肿瘤，A2－Bw46单倍型的个体患鼻咽癌的危险性大；All的个体患鼻咽癌的危险性小。

单基因遗传的肿瘤

人类恶性肿瘤中只有少数种类是按单基因方式遗传的，这些单基因遗传的肿瘤的特点是发病年龄轻而且是双侧发生或多发性的，例如遗传性的视网膜母细胞瘤、神经母细胞瘤、Wilm瘤和嗜铬细胞瘤等肿瘤是以常染色体显性方式遗传的。动物实验中发现在同一外界致瘤因素刺激下，不同基因型的动物发病率不同。人类某些肿瘤有明显家族遗传倾向。如结肠多发性息肉、视网膜母细胞瘤、神经纤维瘤、肾母细胞瘤等。也有一些患者有肿瘤家族史，父母兄妹中易患肿瘤，但肿瘤类型可各不相同。肿瘤家族史或遗传因素在肿瘤发病中仅是一种“易感性”，作为环境致癌因素作用的基础。

某些单基因遗传的综合征常和肿瘤的发生联系在一起。人类3000多种单基因的遗传性疾病中，有240多种综合征都有不同程度的患肿瘤倾向，肿瘤是组成该综合征的一部分。这类单基因遗传病属遗传性癌前疾病，常被称为遗传性肿瘤综合征，大部分按常染色体显性方式遗传，部分属常染色体隐性或X性连锁遗传，如家族性结肠息肉病、基底细胞痣综合征、多发性内分泌腺肿瘤综合征等。

多基因遗传的肿瘤

多基因遗传的肿瘤大多是一些常见的恶性肿瘤，这些肿瘤的发生是遗传因素和环境因素共同作用的结果。例如多基因遗传的乳腺癌、胃癌、肺癌、前列腺癌、子宫颈癌等，患者的一级亲属的发病率显著高于群体的发病率。

染色体畸变与肿瘤先天性染色体异常疾病与恶性肿瘤的发生也密切相关，例如先天愚型（唐氏综合征）患者易患白血病，克氏综合征常伴发男性乳腺癌，特纳氏综合征易发卵巢癌。此外，还有一些具有自发性染色体断裂和重组为特征的常染色体隐性遗传疾病，如毛细血管扩张共济失调症、着色性干皮病、范可尼贫血和勃劳姆综合征等，这些患者极易发生皮肤癌、白血病和淋巴肉瘤。

染色体不平衡假说

该假说认为染色体异常是癌变的原初变化，各种因素造成细胞的不对称分裂而使子细胞内遗传物质分布不平衡，从而影响基因的正常功能，是肿瘤发生的原因。肿瘤细胞遗传学的研究表明，除慢性粒细胞白血病的Ph1染色体等是特征性的染色体外，一般肿瘤细胞的染色体变化较大，在同一种肿瘤的不同细胞系有不同的核型组成，但是通过同一肿瘤细胞大量显带核型分析，仍然可以看到一些结构异常染色体在某种肿瘤内出现是非随机的。

两次突变假说

通过对视网膜母细胞瘤家系的调查和发病情况的研究，A·G·克努森认为肿瘤可分为两种类型：一类是非遗传型肿瘤，这是由于体细胞连续发生两次突变而形成的；另一类为遗传型肿瘤，其中两次突变的前一次是发生在患者亲代的生殖细胞中，后一次是发生在患者的体细胞中。第一次突变是肿瘤的始动过程，第二次突变是促进过程。两次突变假说已被不少学者接受并不断地予以修改和补充，可用于解释各种遗传型和非遗传型肿瘤形成的机理。

转化基因假说

该假说认为正常细胞转化为恶性细胞是由一种所谓转化基因（Tr）所决定的，正常情况下转化基因被调节基因i+Tr所阻遏。i+Tr基因经突变成为突变型基因i0Tr。在纯合体i0Tr/i0Tr中Tr基因消除阻遏而被激活，于是细胞发生恶性转化。转化基因假说可以看作是二次突变假说的补充和发展。

癌基因假说

从20世纪80年代开始在人和动物细胞中发现与病毒癌基因同源的DNA顺序，称为原癌基因。这些基因在正常细胞中转录活性较低或虽有转录但对细胞无害。原癌基因被活化成为癌基因后便大量地转录，或者发生突变后便转录出异常的产物，这两种情况都会导致细胞癌变。这方面的研究将为肿瘤发生的原因提供重要的理论依据并对防治具有潜在的应用意义。