在鉴真大师塑像回国探亲时，被国务院委任为迎接委员，并写有《中日科技交流史上的鉴真》一书。先生毕生所发表的200余篇论文，以医史文物考占为大宗，奠定了医史学的一个重要门类。耿鉴庭先生的一生，是中国传统文化所造就的知识分子 的典型的一生，自幼以温柔敦厚的诗教，塑造出处世正直， 与人为善，宠辱不惊，自奉菲薄，豁达大度的美德。凡与他接触过的人，无不留有深刻的印象。耿鉴庭先生热心教学，50年代即开始在中医高等院校讲授《中国医学史》《内经》《伤寒论》《医古文》等课程，晚年仍兼中国中医研究院研究生部客座教授，经常举办专题讲座。他一生带过大量学生，进修生，可谓桃李遍天下。研究生制度恢复后，他带过多名研究生，他把自己的学识、经验毫无保留地传授给他们，其中一些已成为中西医方面的杰出人才，从而为祖国中医事业的发展作出贡献。耿鉴庭先生于晚年曾说，我已如蚕开始上山结茧，要将所有的丝全部吐出来，嘉惠来者。可惜十年重病缠身，影响了他的宏愿实现。即使在病中，他仍然以拳拳之心，在学生的协助下，完成了《咽喉科传灯录》等带有总结性的著述。凡有登门求教，求诊，求序者，均能以惊人的记忆力，独创的分析力和文采使其满意而去。先生于1999年7月20日2时15分病逝，享年85岁。耿鉴庭先生曾任卫生部医学科学委员会委员，国家科委预防医学组常务委员，中华全国中医学会常务理事，中华医学会医史学会副主任委员，《中华医史杂志》副总编辑，全国中医中心图书馆副馆长，中医古籍出版社副社长兼总编辑，中国中医研究院学术委员会委员，学位委员会委员，北京市人民政府专业顾问，中国中医研究院研究员，专家咨询委员会委员，国务院古饵整理出版规划小组顾问，《中国中西医结合耳鼻咽喉科杂志》名誉总编辑，中国自然科学史学会会员，中国海外交通史学会会员，中外关系史学会会员，中国科学技术史学会会员。1990年第一批享受国务院颁发的政府特殊津贴。